Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HCW1

Protein Details
Accession A0A0L0HCW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-69MESSTAPHHRHQPRRRCASTGKQFQGHydrophilic
953-979RDGRTRTRERVTKPTERRHSRLRAWINBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLWGRTPVRAKPCCHAGRQTSRTLASASNGHSGDPWKSFLDWFMESSTAPHHRHQPRRRCASTGKQFQGKGTGQWTLRPLEHPSLRAAMPEPSAKFTGSPRTRDQIATTESDIADCGARRLRGNIPSRRFPVNTSLTHYKEVLNRLHVHHHRRGHLNQPAQGRAIHFTSAMKSSADPIEQLESALEQGVDAERILLSDQLDDGTSGEPIQKECNPPATVAELLRLLSELELQIKADDGCITPDAHYLTSRVWKAFKNLAETIPHELKALRNHDFTVLFEIVKRSRVPCEERVNRVMLVMNTLQECGRPASLRGYEALMSAHIGEAGASDICTKILQGAIENGITPRTETYNILLRARIVEYGVDAARTWLAEHVEGKAQVRSTKESESFPFAATVSTFNAIIHGYIQAGDIRRALQCVKEMEEKVLPPNFITWTMLIFGYSKCGDRSAVIRTFRNMIAANVRPSRVTYETIIFALLGGGRVKRDFLQQDSRERTTYPVSGDQKAGDEEKNAMGEAMEVYEDMIAAGFKPGVMLYNIFMTAYLNRKELPRVKQLFDEMLKRGLYPDVATYTIAISACSAANDISAVDEVFAHLRQSEIEPDIILYGTVMAAHAQKGNLVKVRTYLEDMVNAGWKPNYYIWHILLHAYCQSRDMSGAHKIVEEMQRSGFPATEITYNTLINGYGHVGNIETAEEVFRSFVSKKIKISVETFNIMINALARNQDREGAMRIYAEMIDRGLQPDRITFNILIKLESNRLDAIGASDRYREMLSAGLEPDERTYIPMINLHARRSDFDRARSIQRHLLSLGHLTPTFQSHNAFIEAYWKQGSASDAVKEYEFATEVKQMTPDIRTFDMLVRAFGYKGDVGSARQWFDKCIDVGIQPDTRLWNALMSGYVTIGDRDAAFAVWKEMEKAGAKADIFTYTLMLKAGVKQSEGQQKEQPQDDRHAATSGHSRDGRTRTRERVTKPTERRHSRLRAWINVGLDEKTHPVENKTSNLDEQQDGAAHPDTLRPEDDTSDHGVRVTSDIGKDHESAIMSDNELLDLATEEIEDSGAGTPSVNDIENTGRELSAKVQQAVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.66
4 0.7
5 0.72
6 0.72
7 0.67
8 0.63
9 0.58
10 0.51
11 0.43
12 0.35
13 0.35
14 0.31
15 0.32
16 0.3
17 0.28
18 0.28
19 0.3
20 0.3
21 0.28
22 0.27
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.25
27 0.27
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.2
33 0.21
34 0.25
35 0.28
36 0.29
37 0.32
38 0.4
39 0.5
40 0.61
41 0.7
42 0.74
43 0.77
44 0.84
45 0.84
46 0.81
47 0.8
48 0.8
49 0.81
50 0.8
51 0.78
52 0.74
53 0.72
54 0.66
55 0.66
56 0.57
57 0.5
58 0.43
59 0.42
60 0.35
61 0.38
62 0.4
63 0.35
64 0.35
65 0.34
66 0.36
67 0.38
68 0.42
69 0.39
70 0.39
71 0.38
72 0.36
73 0.35
74 0.31
75 0.25
76 0.25
77 0.29
78 0.27
79 0.28
80 0.29
81 0.27
82 0.27
83 0.28
84 0.36
85 0.36
86 0.4
87 0.42
88 0.46
89 0.48
90 0.49
91 0.48
92 0.44
93 0.42
94 0.4
95 0.36
96 0.34
97 0.3
98 0.28
99 0.25
100 0.19
101 0.17
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.19
106 0.2
107 0.24
108 0.3
109 0.37
110 0.46
111 0.53
112 0.55
113 0.62
114 0.64
115 0.66
116 0.61
117 0.56
118 0.55
119 0.53
120 0.48
121 0.48
122 0.52
123 0.49
124 0.5
125 0.48
126 0.43
127 0.41
128 0.44
129 0.4
130 0.38
131 0.39
132 0.4
133 0.49
134 0.53
135 0.56
136 0.58
137 0.6
138 0.61
139 0.65
140 0.67
141 0.66
142 0.67
143 0.66
144 0.63
145 0.61
146 0.57
147 0.51
148 0.47
149 0.39
150 0.34
151 0.29
152 0.24
153 0.19
154 0.18
155 0.19
156 0.2
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.18
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.17
167 0.17
168 0.14
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.09
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.15
197 0.18
198 0.22
199 0.25
200 0.31
201 0.3
202 0.3
203 0.3
204 0.29
205 0.27
206 0.23
207 0.22
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.21
236 0.23
237 0.23
238 0.24
239 0.26
240 0.31
241 0.36
242 0.37
243 0.36
244 0.36
245 0.37
246 0.37
247 0.37
248 0.38
249 0.34
250 0.31
251 0.25
252 0.24
253 0.25
254 0.29
255 0.33
256 0.3
257 0.29
258 0.3
259 0.32
260 0.32
261 0.29
262 0.27
263 0.23
264 0.18
265 0.18
266 0.21
267 0.19
268 0.22
269 0.23
270 0.19
271 0.23
272 0.29
273 0.34
274 0.38
275 0.48
276 0.52
277 0.56
278 0.58
279 0.55
280 0.49
281 0.43
282 0.38
283 0.27
284 0.24
285 0.19
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.17
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.14
337 0.21
338 0.23
339 0.24
340 0.23
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.19
345 0.11
346 0.09
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.18
368 0.21
369 0.21
370 0.25
371 0.26
372 0.27
373 0.28
374 0.31
375 0.3
376 0.26
377 0.24
378 0.19
379 0.17
380 0.15
381 0.14
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.14
404 0.15
405 0.18
406 0.22
407 0.22
408 0.23
409 0.24
410 0.24
411 0.25
412 0.25
413 0.22
414 0.16
415 0.17
416 0.16
417 0.15
418 0.15
419 0.11
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.14
434 0.17
435 0.22
436 0.24
437 0.25
438 0.25
439 0.28
440 0.26
441 0.27
442 0.21
443 0.16
444 0.19
445 0.2
446 0.24
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.21
451 0.23
452 0.2
453 0.19
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.16
459 0.12
460 0.1
461 0.08
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.13
471 0.14
472 0.18
473 0.28
474 0.31
475 0.39
476 0.43
477 0.44
478 0.4
479 0.39
480 0.36
481 0.29
482 0.27
483 0.22
484 0.24
485 0.25
486 0.26
487 0.26
488 0.24
489 0.22
490 0.22
491 0.21
492 0.14
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.09
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.04
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.02
511 0.02
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.07
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.19
533 0.25
534 0.28
535 0.34
536 0.37
537 0.38
538 0.38
539 0.39
540 0.38
541 0.33
542 0.31
543 0.23
544 0.22
545 0.2
546 0.18
547 0.18
548 0.14
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.04
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.06
590 0.04
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.04
597 0.05
598 0.06
599 0.06
600 0.08
601 0.09
602 0.12
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.16
607 0.19
608 0.18
609 0.19
610 0.19
611 0.15
612 0.16
613 0.16
614 0.14
615 0.15
616 0.13
617 0.11
618 0.09
619 0.09
620 0.1
621 0.11
622 0.13
623 0.14
624 0.17
625 0.18
626 0.2
627 0.2
628 0.2
629 0.18
630 0.17
631 0.18
632 0.16
633 0.14
634 0.14
635 0.14
636 0.12
637 0.13
638 0.13
639 0.12
640 0.16
641 0.17
642 0.16
643 0.16
644 0.16
645 0.19
646 0.23
647 0.21
648 0.17
649 0.17
650 0.17
651 0.18
652 0.18
653 0.14
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.1
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.13
662 0.13
663 0.12
664 0.11
665 0.09
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.04
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.07
683 0.08
684 0.13
685 0.2
686 0.23
687 0.25
688 0.31
689 0.33
690 0.33
691 0.37
692 0.38
693 0.34
694 0.33
695 0.31
696 0.25
697 0.23
698 0.2
699 0.16
700 0.11
701 0.08
702 0.07
703 0.1
704 0.1
705 0.12
706 0.13
707 0.15
708 0.15
709 0.16
710 0.18
711 0.16
712 0.16
713 0.14
714 0.14
715 0.12
716 0.12
717 0.1
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.08
722 0.1
723 0.1
724 0.11
725 0.11
726 0.14
727 0.16
728 0.15
729 0.18
730 0.17
731 0.18
732 0.22
733 0.22
734 0.2
735 0.19
736 0.2
737 0.2
738 0.21
739 0.2
740 0.15
741 0.15
742 0.14
743 0.13
744 0.13
745 0.15
746 0.14
747 0.13
748 0.14
749 0.14
750 0.15
751 0.15
752 0.13
753 0.09
754 0.1
755 0.1
756 0.11
757 0.12
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.11
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.11
767 0.11
768 0.13
769 0.15
770 0.22
771 0.24
772 0.24
773 0.27
774 0.27
775 0.28
776 0.31
777 0.38
778 0.35
779 0.37
780 0.42
781 0.42
782 0.5
783 0.52
784 0.51
785 0.48
786 0.45
787 0.42
788 0.36
789 0.34
790 0.27
791 0.26
792 0.23
793 0.18
794 0.17
795 0.15
796 0.15
797 0.17
798 0.17
799 0.16
800 0.16
801 0.15
802 0.17
803 0.18
804 0.17
805 0.14
806 0.19
807 0.18
808 0.19
809 0.18
810 0.16
811 0.14
812 0.16
813 0.18
814 0.14
815 0.15
816 0.15
817 0.16
818 0.17
819 0.17
820 0.16
821 0.15
822 0.13
823 0.12
824 0.1
825 0.11
826 0.15
827 0.16
828 0.16
829 0.16
830 0.16
831 0.17
832 0.2
833 0.19
834 0.18
835 0.19
836 0.19
837 0.2
838 0.22
839 0.26
840 0.23
841 0.22
842 0.2
843 0.2
844 0.18
845 0.17
846 0.17
847 0.11
848 0.11
849 0.12
850 0.12
851 0.13
852 0.18
853 0.21
854 0.2
855 0.23
856 0.24
857 0.23
858 0.24
859 0.27
860 0.22
861 0.2
862 0.2
863 0.18
864 0.2
865 0.23
866 0.22
867 0.19
868 0.2
869 0.2
870 0.19
871 0.19
872 0.17
873 0.14
874 0.13
875 0.13
876 0.12
877 0.1
878 0.1
879 0.09
880 0.09
881 0.08
882 0.08
883 0.07
884 0.08
885 0.07
886 0.07
887 0.08
888 0.07
889 0.08
890 0.08
891 0.1
892 0.11
893 0.11
894 0.12
895 0.12
896 0.16
897 0.16
898 0.17
899 0.17
900 0.2
901 0.19
902 0.19
903 0.19
904 0.17
905 0.16
906 0.15
907 0.14
908 0.11
909 0.11
910 0.1
911 0.1
912 0.1
913 0.13
914 0.19
915 0.19
916 0.2
917 0.21
918 0.28
919 0.37
920 0.4
921 0.39
922 0.41
923 0.46
924 0.51
925 0.56
926 0.55
927 0.49
928 0.53
929 0.54
930 0.51
931 0.46
932 0.42
933 0.35
934 0.32
935 0.37
936 0.32
937 0.34
938 0.33
939 0.33
940 0.38
941 0.46
942 0.52
943 0.51
944 0.57
945 0.58
946 0.66
947 0.72
948 0.72
949 0.74
950 0.74
951 0.77
952 0.79
953 0.81
954 0.82
955 0.83
956 0.83
957 0.83
958 0.84
959 0.81
960 0.81
961 0.79
962 0.76
963 0.73
964 0.71
965 0.63
966 0.57
967 0.51
968 0.41
969 0.34
970 0.27
971 0.23
972 0.21
973 0.23
974 0.21
975 0.23
976 0.29
977 0.33
978 0.37
979 0.4
980 0.41
981 0.4
982 0.42
983 0.42
984 0.35
985 0.32
986 0.29
987 0.24
988 0.21
989 0.21
990 0.18
991 0.15
992 0.15
993 0.17
994 0.18
995 0.2
996 0.21
997 0.21
998 0.22
999 0.24
1000 0.25
1001 0.25
1002 0.29
1003 0.28
1004 0.27
1005 0.24
1006 0.23
1007 0.21
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.18
1011 0.17
1012 0.19
1013 0.22
1014 0.25
1015 0.25
1016 0.23
1017 0.23
1018 0.21
1019 0.2
1020 0.21
1021 0.19
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.16
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.12
1028 0.09
1029 0.08
1030 0.08
1031 0.06
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.06
1035 0.07
1036 0.06
1037 0.06
1038 0.07
1039 0.07
1040 0.07
1041 0.07
1042 0.08
1043 0.1
1044 0.12
1045 0.11
1046 0.1
1047 0.12
1048 0.16
1049 0.17
1050 0.2
1051 0.19
1052 0.18
1053 0.18
1054 0.19
1055 0.21
1056 0.24
1057 0.28