FuNGI

A0A0L0HE48

Protein Details

Accession

A0A0L0HE48

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
340-364	SEEDASPRKKKKKGKKGKTETADET	Basic
564-585	SKETPGKTSKKSPKAAKSSQLS	Hydrophilic
627-668	QGAQKTPTSSQSKKKTPKSARSASKNTPTPDRKSPRRAVAAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
346-357	PRKKKKKGKKGK
639-662	KKKTPKSARSASKNTPTPDRKSPR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.166, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MTDGSGMQSGFGRQLAHTDKSIRDRAVRGLTKWLVNNEEIKDLDLLKLWKGLFYSFWMSDKPLIQQHLADKLASLALHLPQSTVLRYIRAFWTIIVADWHGIDRLRLDKYYMLLRKFHFYGFKYLESKGWDADVVGEYLQILKNGPLKLNDLKTPDSLRYHTAEVYLEELQRAVGGKATADAVFQLLDPFFDIISKSANDVVFAKVRENIFEHILDQTSKDDSAMDHDVPSLPFDCERIGRRIFDIAIGSDVLVKNRPKVQHLFKAYAKVVKIDVDESLLKTSKGAIKGTKSKPDHLIDAGPATLKVNGKGQAQSEPKSEERAHDDLVGSKRKAAPVDTSEEDASPRKKKKKGKKGKTETADETAQVMDVKENMHGESSDARVDVTGEGMDGIEQYKVEVKVTKIPKAKTKKTQDATGALPLPGTVTDSIDPKLSPVTPQSKQKKTGKNAMTVPAKQTQKTLLIATASSDPRKSVKFVMEKNMVKSFDIKEPVAEEGTPSRKTETSAPPVLKPALATPVAKKLESLLKSAVWTEKAHEDVQANETVEEGTPKGTPKRDGTVTESKETPGKTSKKSPKAAKSSQLSVLLTTLLQQSNTTSAKDPAISEKSSTKSPDPITPQGKPSTKQGAQKTPTSSQSKKKTPKSARSASKNTPTPDRKSPRRAVAADFM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.25
3	0.27
4	0.3
5	0.33
6	0.38
7	0.44
8	0.5
9	0.47
10	0.47
11	0.47
12	0.5
13	0.56
14	0.55
15	0.49
16	0.52
17	0.53
18	0.52
19	0.53
20	0.5
21	0.44
22	0.41
23	0.45
24	0.38
25	0.38
26	0.34
27	0.31
28	0.28
29	0.25
30	0.23
31	0.21
32	0.2
33	0.17
34	0.21
35	0.2
36	0.2
37	0.2
38	0.2
39	0.17
40	0.21
41	0.26
42	0.23
43	0.25
44	0.25
45	0.26
46	0.29
47	0.3
48	0.3
49	0.29
50	0.3
51	0.3
52	0.32
53	0.34
54	0.37
55	0.36
56	0.31
57	0.26
58	0.23
59	0.24
60	0.19
61	0.16
62	0.11
63	0.12
64	0.14
65	0.14
66	0.14
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.19
71	0.18
72	0.19
73	0.2
74	0.23
75	0.23
76	0.24
77	0.23
78	0.18
79	0.22
80	0.19
81	0.19
82	0.17
83	0.15
84	0.14
85	0.13
86	0.14
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.12
91	0.15
92	0.18
93	0.18
94	0.19
95	0.2
96	0.22
97	0.32
98	0.35
99	0.33
100	0.36
101	0.37
102	0.41
103	0.41
104	0.42
105	0.39
106	0.35
107	0.41
108	0.4
109	0.44
110	0.41
111	0.4
112	0.4
113	0.37
114	0.36
115	0.28
116	0.24
117	0.19
118	0.16
119	0.17
120	0.15
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.1
126	0.1
127	0.08
128	0.08
129	0.1
130	0.16
131	0.18
132	0.2
133	0.2
134	0.24
135	0.3
136	0.33
137	0.34
138	0.33
139	0.34
140	0.35
141	0.37
142	0.36
143	0.34
144	0.32
145	0.32
146	0.31
147	0.3
148	0.27
149	0.25
150	0.22
151	0.18
152	0.2
153	0.19
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.12
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.1
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.06
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.12
185	0.12
186	0.13
187	0.14
188	0.16
189	0.17
190	0.17
191	0.17
192	0.18
193	0.18
194	0.19
195	0.2
196	0.19
197	0.18
198	0.18
199	0.18
200	0.15
201	0.16
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.13
211	0.15
212	0.14
213	0.13
214	0.14
215	0.15
216	0.15
217	0.16
218	0.12
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.16
225	0.2
226	0.21
227	0.21
228	0.22
229	0.23
230	0.22
231	0.2
232	0.18
233	0.13
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.13
241	0.14
242	0.16
243	0.21
244	0.22
245	0.24
246	0.31
247	0.38
248	0.42
249	0.46
250	0.48
251	0.45
252	0.5
253	0.47
254	0.43
255	0.36
256	0.29
257	0.25
258	0.21
259	0.2
260	0.14
261	0.13
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.13
270	0.14
271	0.16
272	0.17
273	0.18
274	0.23
275	0.33
276	0.37
277	0.44
278	0.43
279	0.44
280	0.48
281	0.47
282	0.44
283	0.35
284	0.33
285	0.24
286	0.22
287	0.19
288	0.12
289	0.1
290	0.08
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.12
295	0.14
296	0.16
297	0.17
298	0.18
299	0.23
300	0.25
301	0.26
302	0.25
303	0.26
304	0.25
305	0.28
306	0.28
307	0.22
308	0.25
309	0.25
310	0.24
311	0.21
312	0.21
313	0.21
314	0.25
315	0.28
316	0.22
317	0.22
318	0.23
319	0.23
320	0.24
321	0.2
322	0.2
323	0.18
324	0.23
325	0.21
326	0.22
327	0.2
328	0.2
329	0.2
330	0.19
331	0.21
332	0.23
333	0.3
334	0.36
335	0.44
336	0.53
337	0.63
338	0.71
339	0.79
340	0.82
341	0.86
342	0.88
343	0.9
344	0.86
345	0.82
346	0.73
347	0.66
348	0.56
349	0.44
350	0.35
351	0.25
352	0.19
353	0.13
354	0.1
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.11
387	0.12
388	0.2
389	0.24
390	0.31
391	0.33
392	0.36
393	0.44
394	0.52
395	0.59
396	0.61
397	0.67
398	0.7
399	0.68
400	0.71
401	0.66
402	0.59
403	0.53
404	0.47
405	0.39
406	0.29
407	0.25
408	0.19
409	0.15
410	0.11
411	0.11
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.11
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.16
424	0.22
425	0.26
426	0.36
427	0.45
428	0.49
429	0.58
430	0.65
431	0.69
432	0.68
433	0.74
434	0.69
435	0.67
436	0.64
437	0.64
438	0.61
439	0.53
440	0.5
441	0.47
442	0.45
443	0.38
444	0.36
445	0.31
446	0.29
447	0.29
448	0.26
449	0.2
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.19
454	0.18
455	0.18
456	0.17
457	0.17
458	0.2
459	0.21
460	0.22
461	0.21
462	0.27
463	0.33
464	0.37
465	0.44
466	0.5
467	0.51
468	0.53
469	0.54
470	0.47
471	0.4
472	0.4
473	0.34
474	0.31
475	0.32
476	0.28
477	0.24
478	0.24
479	0.25
480	0.22
481	0.19
482	0.15
483	0.16
484	0.21
485	0.22
486	0.21
487	0.23
488	0.22
489	0.25
490	0.31
491	0.34
492	0.36
493	0.42
494	0.43
495	0.42
496	0.45
497	0.43
498	0.36
499	0.28
500	0.22
501	0.2
502	0.2
503	0.2
504	0.19
505	0.27
506	0.28
507	0.28
508	0.26
509	0.25
510	0.31
511	0.31
512	0.31
513	0.25
514	0.24
515	0.25
516	0.27
517	0.27
518	0.21
519	0.2
520	0.2
521	0.22
522	0.24
523	0.23
524	0.25
525	0.23
526	0.22
527	0.25
528	0.25
529	0.22
530	0.19
531	0.18
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.11
536	0.09
537	0.1
538	0.14
539	0.19
540	0.22
541	0.28
542	0.31
543	0.37
544	0.4
545	0.42
546	0.47
547	0.52
548	0.52
549	0.5
550	0.47
551	0.41
552	0.41
553	0.38
554	0.35
555	0.34
556	0.37
557	0.39
558	0.49
559	0.58
560	0.63
561	0.72
562	0.77
563	0.78
564	0.81
565	0.83
566	0.81
567	0.77
568	0.72
569	0.69
570	0.64
571	0.54
572	0.45
573	0.38
574	0.29
575	0.22
576	0.19
577	0.18
578	0.14
579	0.14
580	0.13
581	0.14
582	0.2
583	0.22
584	0.22
585	0.2
586	0.22
587	0.24
588	0.25
589	0.25
590	0.27
591	0.3
592	0.3
593	0.3
594	0.33
595	0.34
596	0.38
597	0.41
598	0.36
599	0.39
600	0.41
601	0.46
602	0.48
603	0.54
604	0.56
605	0.56
606	0.58
607	0.6
608	0.62
609	0.56
610	0.56
611	0.57
612	0.56
613	0.6
614	0.63
615	0.65
616	0.64
617	0.68
618	0.67
619	0.63
620	0.66
621	0.66
622	0.65
623	0.64
624	0.7
625	0.74
626	0.78
627	0.82
628	0.84
629	0.86
630	0.89
631	0.9
632	0.9
633	0.9
634	0.9
635	0.89
636	0.87
637	0.86
638	0.83
639	0.77
640	0.78
641	0.75
642	0.72
643	0.74
644	0.75
645	0.75
646	0.78
647	0.82
648	0.81
649	0.83
650	0.79

A0A0L0HE48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer