Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HCN5

Protein Details
Accession A0A0L0HCN5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-89LPVRNEFTPKRNQARQKLATLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022018  GIT1_C  
IPR013724  GIT_SHD  
IPR039892  Spa2/Sph1  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12205  GIT1_C  
PF08518  GIT_SHD  
Amino Acid Sequences MSDDVYSTHYDVMRRYLTTFLQEQGSMLGRNNAKEKLGRLSERQFYDLSTDVFDEINRRRENDRNVPFLPVRNEFTPKRNQARQKLATLQEFRFKELASEVFFELERRFPRIVQENDARYGPLYTDSSSRPGVNGFQGPRAVSPNRPLPNPFQPPARMPTTASGRQIPQRGASRGAIDTAGRARRGGSPPPPMPMPTTRGMETLQRQPTELMPRNGTSTRGTTGRGGVTNEEFERMKARYEAEIETLRKQLSGQAPSPEIKKLNAELAMSKMAKRDIKQKYDVLLTDYETIQEELKAQEQAAEALRKDVNSLLEDVQTLSQKNQRLKEDKERDAETIRQLREEVERLGGEAGSVTASTPRTRNDSAKGDLFFSAEDDGEDPRILAYQDAAERLVIAARGSTPTNVLIAMKSVIISIKGITEDAERLEARVESTDDFTDLETAREQVSDALANLVAIAKEHATSYNKNDIGVLEDGVQRVDEDVRNLVAIMKRAGGDALLEGGPDDDRDDTNGLEKRRRGSRVLEVVELKIFIEDETDAIVSLIQTLVSSLKTGTPESSNSTIQSIKSSVDDIIFETGRTRPMLDSDTRSQSDVILEVLQEAVDNLVETGEELLRSEGNRTVKQKIGTCSYEVAKHVKSLLGLFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.29
4 0.28
5 0.32
6 0.32
7 0.28
8 0.28
9 0.26
10 0.25
11 0.24
12 0.25
13 0.21
14 0.19
15 0.24
16 0.24
17 0.28
18 0.32
19 0.31
20 0.32
21 0.34
22 0.36
23 0.38
24 0.44
25 0.45
26 0.48
27 0.53
28 0.57
29 0.57
30 0.56
31 0.47
32 0.4
33 0.4
34 0.35
35 0.28
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.2
42 0.23
43 0.31
44 0.32
45 0.34
46 0.39
47 0.47
48 0.56
49 0.6
50 0.61
51 0.59
52 0.58
53 0.62
54 0.59
55 0.57
56 0.53
57 0.47
58 0.45
59 0.41
60 0.47
61 0.44
62 0.48
63 0.52
64 0.56
65 0.61
66 0.65
67 0.71
68 0.74
69 0.81
70 0.8
71 0.77
72 0.76
73 0.73
74 0.72
75 0.69
76 0.62
77 0.6
78 0.55
79 0.51
80 0.44
81 0.37
82 0.3
83 0.27
84 0.27
85 0.21
86 0.23
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.21
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.3
98 0.38
99 0.41
100 0.42
101 0.48
102 0.48
103 0.49
104 0.49
105 0.41
106 0.32
107 0.29
108 0.22
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.17
113 0.18
114 0.21
115 0.23
116 0.22
117 0.19
118 0.19
119 0.2
120 0.21
121 0.25
122 0.23
123 0.25
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.29
128 0.28
129 0.25
130 0.29
131 0.35
132 0.37
133 0.39
134 0.4
135 0.42
136 0.49
137 0.53
138 0.5
139 0.46
140 0.46
141 0.47
142 0.49
143 0.46
144 0.37
145 0.32
146 0.35
147 0.38
148 0.39
149 0.38
150 0.36
151 0.35
152 0.4
153 0.42
154 0.37
155 0.36
156 0.38
157 0.38
158 0.38
159 0.36
160 0.33
161 0.29
162 0.29
163 0.23
164 0.17
165 0.16
166 0.19
167 0.2
168 0.18
169 0.18
170 0.18
171 0.24
172 0.28
173 0.33
174 0.33
175 0.39
176 0.4
177 0.43
178 0.43
179 0.37
180 0.37
181 0.35
182 0.33
183 0.28
184 0.29
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.33
191 0.34
192 0.32
193 0.32
194 0.31
195 0.34
196 0.38
197 0.4
198 0.35
199 0.33
200 0.33
201 0.37
202 0.36
203 0.34
204 0.27
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.21
209 0.19
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.21
238 0.22
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.27
243 0.29
244 0.3
245 0.27
246 0.23
247 0.19
248 0.19
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.19
256 0.17
257 0.17
258 0.15
259 0.18
260 0.2
261 0.21
262 0.29
263 0.33
264 0.38
265 0.42
266 0.43
267 0.41
268 0.41
269 0.4
270 0.33
271 0.26
272 0.21
273 0.19
274 0.16
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.12
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.13
308 0.17
309 0.22
310 0.26
311 0.31
312 0.36
313 0.41
314 0.5
315 0.54
316 0.55
317 0.55
318 0.52
319 0.47
320 0.44
321 0.41
322 0.36
323 0.34
324 0.29
325 0.26
326 0.24
327 0.24
328 0.23
329 0.23
330 0.18
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.08
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.16
348 0.19
349 0.22
350 0.26
351 0.3
352 0.32
353 0.34
354 0.33
355 0.29
356 0.26
357 0.24
358 0.18
359 0.14
360 0.11
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.1
448 0.13
449 0.16
450 0.21
451 0.29
452 0.29
453 0.29
454 0.29
455 0.25
456 0.26
457 0.24
458 0.19
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.14
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.11
482 0.09
483 0.07
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.17
498 0.21
499 0.24
500 0.29
501 0.32
502 0.37
503 0.44
504 0.47
505 0.45
506 0.46
507 0.53
508 0.56
509 0.56
510 0.54
511 0.48
512 0.45
513 0.42
514 0.36
515 0.26
516 0.17
517 0.14
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.1
538 0.12
539 0.13
540 0.15
541 0.17
542 0.19
543 0.24
544 0.28
545 0.27
546 0.26
547 0.28
548 0.28
549 0.25
550 0.27
551 0.22
552 0.19
553 0.19
554 0.19
555 0.17
556 0.16
557 0.16
558 0.14
559 0.17
560 0.16
561 0.15
562 0.15
563 0.16
564 0.18
565 0.18
566 0.18
567 0.14
568 0.18
569 0.23
570 0.26
571 0.31
572 0.35
573 0.42
574 0.42
575 0.42
576 0.39
577 0.35
578 0.31
579 0.25
580 0.2
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.11
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.08
599 0.09
600 0.11
601 0.12
602 0.14
603 0.18
604 0.24
605 0.31
606 0.35
607 0.39
608 0.43
609 0.49
610 0.53
611 0.54
612 0.55
613 0.51
614 0.5
615 0.49
616 0.47
617 0.45
618 0.42
619 0.42
620 0.35
621 0.34
622 0.33
623 0.3
624 0.28