Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HRY4

Protein Details
Accession A0A0L0HRY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-561LDWHFRQNRRAKEKAKKAISRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
549-557RRAKEKAKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR047415  CID_Pcf11  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR045154  PCF11-like  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
CDD cd16982  CID_Pcf11  
Amino Acid Sequences MTHANAAELEAIRLEYRASLADLTFNSKPIITNLTIIAQENTPAAPAIVQAIEDQMRNAQPKQKLPVLYLMDSIIKNVGGIYINLFARNIVRIFVSAYEMVDADDKQRFFKVLSTWKSQPTGPIFSNNIMAGIESAMRKAAGQPRRRPSLGQIHVNPNFVARGQSFSPQSTTASPNVLTMPTNQPNSQDRSATRRYGANTPYDRPQGGRGRPESGPQRRGNRAEGRLDTRRHPSPIQDARLSDKGSYAQGPSTLAFGNGRSSGLSPAIPSVTTATPISQPSMALDVVSLQQQIQSLLAQKEALAILNPLDTSNAGHIQVLTQLLGAMQNTALDAASIQQIAQMLQQYALASVPAVPLPQPVAPPAQLPPILSTILPSQPLPLPNASMGFGMSAAPFLQRKYSTPGSGLVTPHAVAGNLSGGVQGLLANASALDGLLDTLKWASGSSKTGTMIGNLPFGSGIAVPSAVAQDDGAVIGGGEHGGGRVRTVKDLPIIRLVNEDINKTYPNAVELLYEALDLQCRQCGTRYMRNDTGRGKMDAHLDWHFRQNRRAKEKAKKAISRDWFVSEEDWIKEQEVDIKDRKAPTLFFENDKTVEEAVEEVSNIPAEGETNPRCTVCQEPLEKFYDEEMDDWMLRASVRVDGKLYHQACYQDAQKDGIPSTNGTQVISPSTGKRKREDQEETLAREGKSNSPPQIIAIPTPPHLMAASQPLIPIGSVALGEGLTGLVSGVSAASLLSSLGAGSMVGNANVSEDVVKRLKLSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.16
9 0.17
10 0.22
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.21
15 0.21
16 0.2
17 0.25
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.24
24 0.23
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.2
44 0.24
45 0.27
46 0.32
47 0.37
48 0.43
49 0.5
50 0.52
51 0.5
52 0.49
53 0.54
54 0.51
55 0.46
56 0.4
57 0.35
58 0.33
59 0.3
60 0.28
61 0.21
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.18
76 0.16
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.16
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.2
96 0.19
97 0.23
98 0.28
99 0.33
100 0.38
101 0.44
102 0.47
103 0.51
104 0.53
105 0.49
106 0.48
107 0.44
108 0.44
109 0.38
110 0.4
111 0.37
112 0.36
113 0.38
114 0.31
115 0.25
116 0.19
117 0.18
118 0.12
119 0.1
120 0.11
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.14
127 0.22
128 0.29
129 0.38
130 0.47
131 0.55
132 0.63
133 0.64
134 0.61
135 0.6
136 0.63
137 0.61
138 0.6
139 0.58
140 0.6
141 0.61
142 0.61
143 0.52
144 0.42
145 0.36
146 0.27
147 0.24
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.21
152 0.22
153 0.23
154 0.25
155 0.22
156 0.24
157 0.23
158 0.25
159 0.22
160 0.22
161 0.21
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.16
166 0.16
167 0.23
168 0.26
169 0.29
170 0.28
171 0.32
172 0.36
173 0.42
174 0.41
175 0.37
176 0.34
177 0.38
178 0.43
179 0.42
180 0.39
181 0.37
182 0.38
183 0.41
184 0.41
185 0.43
186 0.42
187 0.42
188 0.45
189 0.44
190 0.41
191 0.36
192 0.41
193 0.41
194 0.41
195 0.46
196 0.43
197 0.44
198 0.44
199 0.5
200 0.52
201 0.51
202 0.55
203 0.54
204 0.59
205 0.62
206 0.64
207 0.65
208 0.64
209 0.6
210 0.58
211 0.56
212 0.55
213 0.55
214 0.54
215 0.51
216 0.49
217 0.48
218 0.46
219 0.43
220 0.4
221 0.43
222 0.48
223 0.49
224 0.46
225 0.43
226 0.44
227 0.46
228 0.43
229 0.33
230 0.26
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.16
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.09
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.12
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.09
385 0.09
386 0.11
387 0.17
388 0.2
389 0.19
390 0.2
391 0.22
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.08
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.02
421 0.02
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.12
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.16
439 0.14
440 0.15
441 0.13
442 0.12
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.06
447 0.06
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.04
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.02
465 0.02
466 0.02
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.14
475 0.16
476 0.2
477 0.23
478 0.24
479 0.27
480 0.26
481 0.25
482 0.25
483 0.25
484 0.24
485 0.22
486 0.22
487 0.16
488 0.17
489 0.18
490 0.16
491 0.17
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.11
510 0.18
511 0.24
512 0.33
513 0.39
514 0.45
515 0.53
516 0.55
517 0.58
518 0.54
519 0.53
520 0.48
521 0.43
522 0.37
523 0.32
524 0.33
525 0.29
526 0.29
527 0.26
528 0.27
529 0.27
530 0.34
531 0.38
532 0.37
533 0.44
534 0.49
535 0.55
536 0.59
537 0.67
538 0.68
539 0.72
540 0.8
541 0.81
542 0.83
543 0.79
544 0.77
545 0.78
546 0.75
547 0.7
548 0.61
549 0.55
550 0.47
551 0.42
552 0.36
553 0.29
554 0.26
555 0.22
556 0.21
557 0.17
558 0.16
559 0.15
560 0.15
561 0.19
562 0.18
563 0.23
564 0.25
565 0.28
566 0.31
567 0.32
568 0.34
569 0.3
570 0.28
571 0.27
572 0.32
573 0.32
574 0.31
575 0.34
576 0.34
577 0.33
578 0.33
579 0.3
580 0.21
581 0.19
582 0.15
583 0.12
584 0.11
585 0.1
586 0.09
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.05
593 0.06
594 0.07
595 0.14
596 0.16
597 0.19
598 0.21
599 0.21
600 0.22
601 0.23
602 0.27
603 0.25
604 0.31
605 0.33
606 0.36
607 0.4
608 0.44
609 0.42
610 0.38
611 0.33
612 0.29
613 0.24
614 0.2
615 0.18
616 0.17
617 0.16
618 0.15
619 0.14
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.13
625 0.15
626 0.15
627 0.17
628 0.17
629 0.22
630 0.31
631 0.31
632 0.27
633 0.28
634 0.29
635 0.29
636 0.32
637 0.33
638 0.28
639 0.28
640 0.29
641 0.28
642 0.29
643 0.28
644 0.27
645 0.24
646 0.21
647 0.22
648 0.25
649 0.24
650 0.21
651 0.21
652 0.19
653 0.2
654 0.21
655 0.2
656 0.2
657 0.31
658 0.37
659 0.41
660 0.45
661 0.51
662 0.56
663 0.64
664 0.67
665 0.62
666 0.66
667 0.68
668 0.67
669 0.63
670 0.61
671 0.51
672 0.47
673 0.43
674 0.4
675 0.41
676 0.43
677 0.42
678 0.41
679 0.41
680 0.39
681 0.41
682 0.36
683 0.31
684 0.3
685 0.29
686 0.27
687 0.29
688 0.27
689 0.23
690 0.21
691 0.19
692 0.16
693 0.2
694 0.21
695 0.19
696 0.19
697 0.18
698 0.18
699 0.17
700 0.15
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.03
714 0.03
715 0.03
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.04
724 0.04
725 0.04
726 0.04
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.1
740 0.16
741 0.19
742 0.19