Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HQW6

Protein Details
Accession A0A0L0HQW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-129AEAQRQREERQDRLRRQKEETQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034423  RBM19_RRM5  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12317  RRM4_RBM19_RRM3_MRD1  
cd12318  RRM5_RBM19_like  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MSRLIVKNLPKHYTLDRFKEHFSEKGEVTDAKLVKTPDGVFRRFGYIGFKTEKQAKDALKYFNNTFVDTSKIQVELAKAIGDASLPRPWSRHSHGSSAFDRKTQAEAEAQRQREERQDRLRRQKEETQQDMERKQKLLNTLYADEHDPKLKEFLEVMRPRSSARGRTWANDDVTSAQGTANNGGKKNRAKATVLAVPNKKTGGDGMLVTKTHVTFEDSEDELYDELPSATKDNGSGSTKEGTESAATMVEEDVETETVEDASKQRNSAAHDSSLSDLDYLRSKMRNLSKDEDEEIEAHEDSGADVGEDDDDSMDVDKAITPTDIKSSSTIGAVPSKIHASRMALFDNEDDIETPAPIATTQGASNTRPPPSTVSVPKAEQGPPPAELIADTGRLFVKNLPYTCTVEDLHKLFEKFGPLSEVHIPIEKETKKPKGFAFILYLLPEHAVKAFTTLDGQIFQGRILEVLPGKEKPRPVDDEENSSQTFKNQREKQRKANAGNEFSWNSLFMNSDAVAEAMARKLGVKKSDILNPDAENMAVRLALAETHIITETKQYLEEEGIDLSAFEKRKTRSKSIILVKNIPHDTEEEELRELFGKFGTIGRLVLPPAKTIALVEFLELNEAKAAFQRLAYTKFKHLPLYLEWAPVDTFKKKYDPTEVAERRNKKETQKEDKTTTEDVESEAPRRTINELASADDATEDPDAMPIATLFVKNLNFETNEERLREAFKVAKGLRSVRVATKLDKKTGGKLSMGFGFLEFNTKEDAMRCIKSMQNFKLDGHSLELKISNAAAKSTAPSKKRGSEEPIKVTGTKLIVRNIPFEATKKDIRQLFSTFGQVKSVRIPRKMDGNHRGFGFVDFLTKQEAKSAFESLAATHLYGRHLVLEWAEDVESVEAMRSKTARGFFKDDGPNKKRKIVMDDEGEEDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.61
4 0.6
5 0.62
6 0.65
7 0.61
8 0.56
9 0.52
10 0.5
11 0.42
12 0.41
13 0.41
14 0.34
15 0.34
16 0.36
17 0.31
18 0.27
19 0.3
20 0.28
21 0.26
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.37
26 0.38
27 0.37
28 0.39
29 0.43
30 0.39
31 0.37
32 0.35
33 0.31
34 0.35
35 0.37
36 0.37
37 0.37
38 0.45
39 0.47
40 0.43
41 0.47
42 0.44
43 0.48
44 0.52
45 0.54
46 0.52
47 0.55
48 0.53
49 0.54
50 0.52
51 0.45
52 0.4
53 0.34
54 0.33
55 0.28
56 0.29
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.17
63 0.18
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.16
73 0.18
74 0.2
75 0.23
76 0.31
77 0.37
78 0.44
79 0.44
80 0.51
81 0.55
82 0.6
83 0.63
84 0.64
85 0.58
86 0.5
87 0.48
88 0.41
89 0.39
90 0.33
91 0.29
92 0.28
93 0.31
94 0.38
95 0.44
96 0.44
97 0.45
98 0.46
99 0.46
100 0.48
101 0.49
102 0.49
103 0.52
104 0.61
105 0.68
106 0.77
107 0.83
108 0.79
109 0.8
110 0.8
111 0.79
112 0.79
113 0.75
114 0.71
115 0.69
116 0.71
117 0.71
118 0.69
119 0.63
120 0.54
121 0.5
122 0.47
123 0.47
124 0.44
125 0.42
126 0.41
127 0.39
128 0.39
129 0.38
130 0.38
131 0.34
132 0.31
133 0.31
134 0.26
135 0.24
136 0.26
137 0.25
138 0.23
139 0.21
140 0.24
141 0.3
142 0.34
143 0.37
144 0.38
145 0.38
146 0.38
147 0.44
148 0.45
149 0.42
150 0.42
151 0.48
152 0.45
153 0.49
154 0.54
155 0.52
156 0.49
157 0.42
158 0.38
159 0.3
160 0.29
161 0.26
162 0.2
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.19
168 0.21
169 0.24
170 0.26
171 0.33
172 0.37
173 0.44
174 0.46
175 0.45
176 0.44
177 0.45
178 0.49
179 0.5
180 0.49
181 0.5
182 0.48
183 0.46
184 0.46
185 0.43
186 0.36
187 0.28
188 0.24
189 0.18
190 0.15
191 0.14
192 0.16
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.16
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.15
209 0.13
210 0.11
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.15
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.19
253 0.25
254 0.3
255 0.31
256 0.28
257 0.27
258 0.28
259 0.27
260 0.25
261 0.2
262 0.14
263 0.11
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.24
271 0.31
272 0.36
273 0.39
274 0.44
275 0.45
276 0.46
277 0.47
278 0.42
279 0.35
280 0.29
281 0.24
282 0.2
283 0.16
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.18
328 0.2
329 0.2
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.13
335 0.1
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.18
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.23
356 0.24
357 0.26
358 0.31
359 0.3
360 0.31
361 0.32
362 0.32
363 0.33
364 0.31
365 0.29
366 0.25
367 0.24
368 0.21
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.15
384 0.18
385 0.18
386 0.2
387 0.23
388 0.25
389 0.25
390 0.25
391 0.2
392 0.18
393 0.2
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.12
405 0.15
406 0.17
407 0.17
408 0.14
409 0.17
410 0.16
411 0.14
412 0.22
413 0.2
414 0.22
415 0.27
416 0.35
417 0.35
418 0.38
419 0.38
420 0.39
421 0.39
422 0.36
423 0.34
424 0.28
425 0.27
426 0.24
427 0.23
428 0.15
429 0.14
430 0.12
431 0.08
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.08
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.14
457 0.15
458 0.17
459 0.2
460 0.24
461 0.28
462 0.35
463 0.35
464 0.4
465 0.4
466 0.4
467 0.37
468 0.33
469 0.27
470 0.21
471 0.26
472 0.23
473 0.31
474 0.36
475 0.46
476 0.56
477 0.62
478 0.69
479 0.73
480 0.77
481 0.72
482 0.73
483 0.69
484 0.62
485 0.58
486 0.51
487 0.42
488 0.34
489 0.29
490 0.21
491 0.15
492 0.11
493 0.1
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.08
508 0.11
509 0.13
510 0.14
511 0.17
512 0.2
513 0.25
514 0.27
515 0.25
516 0.25
517 0.23
518 0.23
519 0.2
520 0.17
521 0.12
522 0.1
523 0.08
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.14
554 0.17
555 0.26
556 0.32
557 0.38
558 0.42
559 0.48
560 0.56
561 0.6
562 0.65
563 0.61
564 0.6
565 0.56
566 0.55
567 0.5
568 0.41
569 0.32
570 0.26
571 0.24
572 0.2
573 0.19
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.11
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.09
588 0.1
589 0.11
590 0.11
591 0.14
592 0.14
593 0.12
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.09
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.08
613 0.09
614 0.12
615 0.14
616 0.2
617 0.25
618 0.26
619 0.31
620 0.36
621 0.38
622 0.38
623 0.36
624 0.34
625 0.31
626 0.36
627 0.31
628 0.28
629 0.26
630 0.23
631 0.22
632 0.21
633 0.23
634 0.18
635 0.19
636 0.2
637 0.25
638 0.27
639 0.3
640 0.36
641 0.37
642 0.38
643 0.47
644 0.5
645 0.54
646 0.6
647 0.63
648 0.6
649 0.62
650 0.63
651 0.6
652 0.64
653 0.66
654 0.68
655 0.72
656 0.74
657 0.72
658 0.71
659 0.68
660 0.6
661 0.51
662 0.42
663 0.32
664 0.26
665 0.26
666 0.23
667 0.2
668 0.2
669 0.19
670 0.18
671 0.19
672 0.2
673 0.19
674 0.19
675 0.23
676 0.22
677 0.23
678 0.24
679 0.23
680 0.2
681 0.17
682 0.15
683 0.1
684 0.09
685 0.07
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.05
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.1
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.14
701 0.15
702 0.17
703 0.22
704 0.23
705 0.25
706 0.25
707 0.26
708 0.24
709 0.26
710 0.24
711 0.23
712 0.23
713 0.21
714 0.29
715 0.29
716 0.32
717 0.34
718 0.37
719 0.37
720 0.37
721 0.38
722 0.34
723 0.4
724 0.38
725 0.41
726 0.47
727 0.48
728 0.48
729 0.52
730 0.5
731 0.5
732 0.55
733 0.52
734 0.44
735 0.41
736 0.4
737 0.35
738 0.34
739 0.26
740 0.19
741 0.17
742 0.15
743 0.18
744 0.15
745 0.13
746 0.15
747 0.15
748 0.16
749 0.16
750 0.21
751 0.21
752 0.22
753 0.23
754 0.24
755 0.27
756 0.33
757 0.41
758 0.41
759 0.43
760 0.44
761 0.43
762 0.46
763 0.45
764 0.38
765 0.34
766 0.33
767 0.27
768 0.27
769 0.27
770 0.21
771 0.2
772 0.19
773 0.17
774 0.13
775 0.13
776 0.12
777 0.12
778 0.14
779 0.21
780 0.28
781 0.28
782 0.34
783 0.4
784 0.47
785 0.52
786 0.56
787 0.57
788 0.6
789 0.66
790 0.66
791 0.64
792 0.59
793 0.55
794 0.49
795 0.44
796 0.37
797 0.34
798 0.3
799 0.3
800 0.34
801 0.35
802 0.37
803 0.34
804 0.34
805 0.31
806 0.3
807 0.31
808 0.31
809 0.36
810 0.36
811 0.42
812 0.43
813 0.45
814 0.46
815 0.44
816 0.44
817 0.39
818 0.44
819 0.4
820 0.36
821 0.38
822 0.34
823 0.33
824 0.37
825 0.44
826 0.43
827 0.46
828 0.5
829 0.48
830 0.57
831 0.63
832 0.64
833 0.66
834 0.65
835 0.63
836 0.59
837 0.57
838 0.47
839 0.41
840 0.33
841 0.23
842 0.21
843 0.17
844 0.17
845 0.22
846 0.22
847 0.2
848 0.24
849 0.26
850 0.25
851 0.28
852 0.29
853 0.23
854 0.24
855 0.25
856 0.18
857 0.2
858 0.17
859 0.15
860 0.14
861 0.16
862 0.15
863 0.16
864 0.16
865 0.15
866 0.15
867 0.16
868 0.14
869 0.15
870 0.14
871 0.14
872 0.13
873 0.11
874 0.11
875 0.11
876 0.1
877 0.08
878 0.09
879 0.1
880 0.11
881 0.14
882 0.14
883 0.16
884 0.22
885 0.29
886 0.34
887 0.38
888 0.46
889 0.45
890 0.53
891 0.61
892 0.63
893 0.68
894 0.67
895 0.7
896 0.67
897 0.72
898 0.68
899 0.64
900 0.65
901 0.62
902 0.64
903 0.63
904 0.61
905 0.58