Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HLF0

Protein Details
Accession A0A0L0HLF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-258AATRVPKELKPQKEKNIERNELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-18GKRALKK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 13, mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTVKARTAAGKRALKKREPQTIEEAKPAVFIKGTTTSQLVMSVLKDLYSLKRPDAVLFGKRNEVRPFDDPRPLEFFSQKNDAALFVIASHSKKRPHNLVFARTFDYQLLDMVEVGVEKGVPMEMFKTTKSAVGHRPLLVFSGDAWDSTDELRTLKSILLDMYRGATSNDMVNLAGVEHLICITAESAQKVYLRTYTIQLKKSGTRLPRVELEEMGPACDLVIRRCRTADTDLWKAATRVPKELKPQKEKNIERNELGDKMGRIHMHKQDLGKLQTRKMKGLKRGPAEDENEDEEEGQSKKRRED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.74
4 0.76
5 0.77
6 0.78
7 0.75
8 0.72
9 0.72
10 0.73
11 0.68
12 0.64
13 0.55
14 0.44
15 0.42
16 0.38
17 0.29
18 0.2
19 0.17
20 0.16
21 0.21
22 0.22
23 0.2
24 0.21
25 0.21
26 0.2
27 0.21
28 0.17
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.16
37 0.22
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.28
42 0.28
43 0.33
44 0.33
45 0.34
46 0.37
47 0.37
48 0.41
49 0.43
50 0.48
51 0.46
52 0.45
53 0.42
54 0.43
55 0.48
56 0.44
57 0.5
58 0.45
59 0.44
60 0.47
61 0.43
62 0.4
63 0.37
64 0.34
65 0.31
66 0.35
67 0.32
68 0.26
69 0.25
70 0.22
71 0.19
72 0.17
73 0.12
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.11
78 0.14
79 0.18
80 0.24
81 0.29
82 0.35
83 0.43
84 0.45
85 0.54
86 0.57
87 0.61
88 0.58
89 0.56
90 0.54
91 0.46
92 0.42
93 0.32
94 0.27
95 0.18
96 0.15
97 0.13
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.06
113 0.08
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.13
118 0.15
119 0.18
120 0.21
121 0.26
122 0.28
123 0.28
124 0.28
125 0.25
126 0.24
127 0.2
128 0.15
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.18
184 0.25
185 0.3
186 0.32
187 0.34
188 0.36
189 0.37
190 0.4
191 0.43
192 0.38
193 0.41
194 0.4
195 0.41
196 0.43
197 0.44
198 0.41
199 0.35
200 0.32
201 0.28
202 0.26
203 0.23
204 0.17
205 0.13
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.23
214 0.25
215 0.27
216 0.32
217 0.34
218 0.32
219 0.36
220 0.36
221 0.37
222 0.37
223 0.34
224 0.33
225 0.34
226 0.29
227 0.32
228 0.36
229 0.39
230 0.49
231 0.58
232 0.63
233 0.66
234 0.72
235 0.74
236 0.8
237 0.82
238 0.82
239 0.83
240 0.78
241 0.7
242 0.66
243 0.6
244 0.51
245 0.45
246 0.39
247 0.29
248 0.27
249 0.29
250 0.27
251 0.26
252 0.33
253 0.38
254 0.41
255 0.44
256 0.43
257 0.47
258 0.52
259 0.53
260 0.54
261 0.52
262 0.53
263 0.57
264 0.58
265 0.59
266 0.6
267 0.63
268 0.64
269 0.7
270 0.72
271 0.72
272 0.75
273 0.73
274 0.72
275 0.69
276 0.62
277 0.56
278 0.51
279 0.44
280 0.38
281 0.32
282 0.26
283 0.24
284 0.21
285 0.24
286 0.27