Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HDM8

Protein Details
Accession A0A0L0HDM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-102QAAIKKRKEATKKAAARRTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-159AEKARETRRLNKEAEEREMREIQERAQAAIKKRKEATKKAAARRTEAQKQAIAEKARETRRLNKEAKERQMREIQERAEAAIKKRKEAAKKAAATRAKQIKIK
257-261KKPRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 11, cyto 6, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004868  DNA-dir_DNA_pol_B_mt/vir  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF03175  DNA_pol_B_2  
Amino Acid Sequences MMRKIVSGNFSSENWTKKQLDALENLQIHRVPRFLQSEREKRIAAARRTEAQKQAIAEKARETRRLNKEAEEREMREIQERAQAAIKKRKEATKKAAARRTEAQKQAIAEKARETRRLNKEAKERQMREIQERAEAAIKKRKEAAKKAAATRAKQIKIKGIGYTKELYRFNPKYTFATHDDIVSFFNDVIKESLVGLERGDKVQIGFQHQSLHNGFWSSKVVSVSDLIASDVIDDITARMQSAEIASIDESMTIEKKKPRKHISKIIAFDFESEFLHDGEHRVKFTDCKNPNTTFIAHNGKGYDFHFLFKKFNDNGVKPKYISNGLKIISMVLPKFNIRFIDSMLFLPMGLSKLPSMFGLEEHVRKGYFPHWFKCSNDYKGVLPSLDDFRFDSMPYDKRADAQRWYKKTLRKCMKAAAVKLFREQFLVATDGEIDPWAYKTIASACMGTYRHMFMPEESIPTHHEEGMRRHSDKAVQWLEYLRDNGILDMRRVLRGGEKWIDRLNGKKFYADGYSPSTNTVYEFNVFETIYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.38
4 0.37
5 0.43
6 0.43
7 0.44
8 0.45
9 0.46
10 0.47
11 0.47
12 0.46
13 0.43
14 0.38
15 0.34
16 0.3
17 0.28
18 0.21
19 0.26
20 0.33
21 0.33
22 0.41
23 0.5
24 0.57
25 0.62
26 0.65
27 0.58
28 0.53
29 0.59
30 0.59
31 0.55
32 0.54
33 0.53
34 0.56
35 0.61
36 0.65
37 0.62
38 0.57
39 0.53
40 0.47
41 0.47
42 0.46
43 0.44
44 0.39
45 0.4
46 0.44
47 0.46
48 0.52
49 0.52
50 0.55
51 0.61
52 0.67
53 0.63
54 0.62
55 0.66
56 0.64
57 0.67
58 0.64
59 0.57
60 0.56
61 0.56
62 0.49
63 0.45
64 0.41
65 0.34
66 0.33
67 0.31
68 0.27
69 0.3
70 0.34
71 0.37
72 0.46
73 0.47
74 0.48
75 0.53
76 0.6
77 0.63
78 0.68
79 0.69
80 0.7
81 0.76
82 0.79
83 0.81
84 0.75
85 0.72
86 0.7
87 0.7
88 0.68
89 0.65
90 0.59
91 0.55
92 0.54
93 0.54
94 0.52
95 0.47
96 0.39
97 0.4
98 0.44
99 0.46
100 0.52
101 0.52
102 0.55
103 0.61
104 0.69
105 0.68
106 0.67
107 0.72
108 0.74
109 0.79
110 0.79
111 0.72
112 0.69
113 0.71
114 0.68
115 0.63
116 0.6
117 0.51
118 0.44
119 0.41
120 0.36
121 0.35
122 0.34
123 0.33
124 0.35
125 0.35
126 0.33
127 0.39
128 0.44
129 0.47
130 0.53
131 0.57
132 0.59
133 0.65
134 0.67
135 0.7
136 0.69
137 0.62
138 0.62
139 0.61
140 0.56
141 0.53
142 0.5
143 0.49
144 0.49
145 0.49
146 0.45
147 0.41
148 0.38
149 0.38
150 0.39
151 0.33
152 0.33
153 0.33
154 0.3
155 0.35
156 0.36
157 0.37
158 0.39
159 0.39
160 0.36
161 0.38
162 0.41
163 0.35
164 0.36
165 0.32
166 0.28
167 0.26
168 0.24
169 0.22
170 0.16
171 0.12
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.22
196 0.22
197 0.27
198 0.25
199 0.24
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.14
204 0.16
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.1
242 0.15
243 0.22
244 0.29
245 0.39
246 0.48
247 0.57
248 0.64
249 0.71
250 0.74
251 0.76
252 0.73
253 0.65
254 0.57
255 0.47
256 0.4
257 0.3
258 0.22
259 0.14
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.19
273 0.28
274 0.28
275 0.33
276 0.38
277 0.39
278 0.41
279 0.41
280 0.39
281 0.3
282 0.32
283 0.32
284 0.27
285 0.26
286 0.24
287 0.22
288 0.22
289 0.21
290 0.21
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.26
298 0.21
299 0.28
300 0.33
301 0.32
302 0.39
303 0.43
304 0.44
305 0.38
306 0.39
307 0.35
308 0.36
309 0.35
310 0.29
311 0.29
312 0.27
313 0.27
314 0.25
315 0.23
316 0.17
317 0.18
318 0.15
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.12
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.18
351 0.16
352 0.16
353 0.18
354 0.18
355 0.24
356 0.27
357 0.31
358 0.35
359 0.38
360 0.4
361 0.46
362 0.49
363 0.44
364 0.44
365 0.42
366 0.39
367 0.39
368 0.39
369 0.3
370 0.23
371 0.21
372 0.22
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.21
382 0.23
383 0.26
384 0.24
385 0.28
386 0.34
387 0.35
388 0.39
389 0.46
390 0.52
391 0.54
392 0.61
393 0.63
394 0.64
395 0.69
396 0.72
397 0.72
398 0.7
399 0.69
400 0.71
401 0.74
402 0.74
403 0.7
404 0.69
405 0.65
406 0.59
407 0.6
408 0.54
409 0.45
410 0.4
411 0.34
412 0.25
413 0.2
414 0.2
415 0.14
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.1
428 0.12
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.15
433 0.2
434 0.21
435 0.21
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.22
440 0.23
441 0.18
442 0.24
443 0.24
444 0.25
445 0.23
446 0.23
447 0.23
448 0.27
449 0.28
450 0.23
451 0.25
452 0.27
453 0.34
454 0.42
455 0.47
456 0.44
457 0.44
458 0.46
459 0.48
460 0.47
461 0.5
462 0.46
463 0.4
464 0.4
465 0.41
466 0.4
467 0.38
468 0.35
469 0.25
470 0.23
471 0.22
472 0.21
473 0.23
474 0.23
475 0.2
476 0.25
477 0.26
478 0.25
479 0.25
480 0.25
481 0.26
482 0.27
483 0.34
484 0.36
485 0.36
486 0.39
487 0.44
488 0.47
489 0.44
490 0.49
491 0.5
492 0.5
493 0.49
494 0.47
495 0.43
496 0.42
497 0.44
498 0.38
499 0.34
500 0.33
501 0.36
502 0.34
503 0.36
504 0.33
505 0.27
506 0.27
507 0.25
508 0.21
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.2