Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TR49

Protein Details
Accession A7TR49    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50KPSLKFKPKAVARRTKEERDASHydrophilic
60-81SHNNDKKKPGMNRKPGGQQQRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-47KPSLKFKPKAVARRTKEER
65-74KKKPGMNRKP
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG vpo:Kpol_461p13  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSSGSGSGSGRLPSLSSGSGSGSGSGAGKPSLKFKPKAVARRTKEERDASAPKVNEEANSHNNDKKKPGMNRKPGGQQQRRVPKYLANTHVITSGPLAAGNFTGGGKDMMRRNFAKSDTYANSMNKGDDEDALVSGINKINMGKEYSIKNSSESDSTEESSENEGFANSMGELFPITPLRIKHEDVDGLQREITTETLHEEPAPVPTPVAEETPAVEKSVKIETDATGLNETLEARETLLKEKLKLKSKHVELEPSDPMGLQSENKTMNDDYEYISNKLVSLEKDAYKYLLFQLPPKLPMFTDETETKSEETEGQDVEMKEQEEANEDEEVEGEEKTTEAKTSEEKSTKPAKPEIIKLETSNPTGKIGFVRIHRSGKMTVKIGKVVMDIGKSAEATFLQELVALDDSEESPSVRVLGQVEGRVVVTPKLEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.15
16 0.15
17 0.22
18 0.31
19 0.38
20 0.41
21 0.44
22 0.52
23 0.58
24 0.67
25 0.71
26 0.72
27 0.71
28 0.78
29 0.82
30 0.8
31 0.8
32 0.76
33 0.71
34 0.68
35 0.67
36 0.62
37 0.61
38 0.53
39 0.45
40 0.43
41 0.38
42 0.32
43 0.3
44 0.32
45 0.31
46 0.37
47 0.39
48 0.41
49 0.46
50 0.47
51 0.47
52 0.49
53 0.51
54 0.55
55 0.63
56 0.69
57 0.74
58 0.77
59 0.79
60 0.81
61 0.8
62 0.81
63 0.79
64 0.76
65 0.75
66 0.8
67 0.76
68 0.71
69 0.64
70 0.59
71 0.59
72 0.6
73 0.55
74 0.49
75 0.47
76 0.43
77 0.43
78 0.37
79 0.28
80 0.2
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.12
95 0.17
96 0.2
97 0.25
98 0.26
99 0.3
100 0.33
101 0.35
102 0.34
103 0.31
104 0.35
105 0.32
106 0.35
107 0.35
108 0.32
109 0.33
110 0.3
111 0.29
112 0.22
113 0.21
114 0.18
115 0.13
116 0.14
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.12
131 0.15
132 0.18
133 0.22
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.25
139 0.23
140 0.21
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.09
165 0.09
166 0.15
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.23
172 0.21
173 0.28
174 0.24
175 0.21
176 0.2
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.07
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.12
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.13
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.08
225 0.11
226 0.16
227 0.17
228 0.19
229 0.26
230 0.32
231 0.4
232 0.43
233 0.46
234 0.5
235 0.53
236 0.57
237 0.52
238 0.52
239 0.45
240 0.47
241 0.41
242 0.33
243 0.29
244 0.22
245 0.2
246 0.15
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.17
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.16
258 0.13
259 0.16
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.13
268 0.15
269 0.18
270 0.2
271 0.21
272 0.21
273 0.21
274 0.19
275 0.19
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.18
280 0.25
281 0.26
282 0.28
283 0.28
284 0.26
285 0.22
286 0.24
287 0.26
288 0.21
289 0.23
290 0.22
291 0.24
292 0.25
293 0.26
294 0.24
295 0.18
296 0.18
297 0.16
298 0.17
299 0.16
300 0.14
301 0.14
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.14
329 0.18
330 0.27
331 0.29
332 0.3
333 0.36
334 0.45
335 0.48
336 0.48
337 0.5
338 0.5
339 0.52
340 0.59
341 0.6
342 0.55
343 0.53
344 0.5
345 0.52
346 0.47
347 0.45
348 0.41
349 0.34
350 0.31
351 0.29
352 0.28
353 0.23
354 0.23
355 0.25
356 0.26
357 0.32
358 0.36
359 0.41
360 0.41
361 0.43
362 0.45
363 0.48
364 0.49
365 0.48
366 0.47
367 0.46
368 0.48
369 0.45
370 0.4
371 0.33
372 0.3
373 0.27
374 0.22
375 0.19
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.11
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.12
403 0.16
404 0.19
405 0.21
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.21
410 0.21
411 0.18