Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0H8Z9

Protein Details
Accession A0A0L0H8Z9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
408-429RHIEERRREGRNRRNREREEAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-432RRHIEERRREGRNRRNREREEAERRR
881-892RRGRGRGRGGAA
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSQKYPKVTSQVIEEQPREINGHTIPVDASKVNPNGVEFDNLYLDMNGIIHPCCHPEGKPAPATEEEMFVEIFKYIDRIMAMIRPRKVLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAQIQQEEEERIRKEWEAAGDKMPETEKKQHFDSNCITPGTPFMTNLAVALRYYIADRLNTDPGWRNLKVILSDASVPGEGEHKIMDYIRRQRGQTGYDPNTHHVLYGLDADLIMLALATHEPNFQILREDVFFNDAKDRGCFICGQTGHQANECTGKKKEKIGEFDEKGKVAEQKPFVFLHVSVLREYLEIELKSPDLPFAWDLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLIELWRKNLPKWGSYLTNSGDIDLQRVELMMDDLGKVEDDIFRERRHIEERRREGRNRRNREREEAERRRYERMDAPPAIVTETPPDYLLETLQSGRKPEPPVIPSRDANKAAAEALKIALTGAGQDVTGNPAIETHAGVKRKADSIENEATDAVFPVSTEVQDISDSEEDVTESKIDDENGAVDGEGSDETPEVEEEVEETMTVADVPIPHEPPTHKPAGEEEEPYDDVRLWESGWKQRYYKNKFDVEVTDVAFRRRVVTSYVEGLCWVLKYYYQGCQSWKWYFPYHYAPFASDFDFIGELNIVFELGTPFRPVEQLMGVLPAYSRQHIPPAFQPLMTDSDSPIIDFYPEKFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDENRLLQALETRYHLLTEEEVQRNSKGDEVLVVGGSHGLFEPFCSLYGRQAEQTPIPIDARLSQKFFGSVLPDPNACLPGSTFESPLSAYGLDDISNNHSISVLYYMPEVAPGHIFKAELLPGAQFPSPVLDANDAYAVRMGYNGRRGRGRGRGGAAGRFIRHGMGAGNTFGRQGYDNGAQSYDGRRNDYQHDNKRSRYDSRNQHSGTGLPYMGGGGYEPYSSGSGEYQQGGNQQYGSYQAQASYGGGYIPNANSGYQQNRGYQGGYTGSAVAPPGVTSWNQTPASNQAGYNRSGYGPPGAAGSESGGRPHAGNLGWSRNVSANRGSSRGSGGYGGKFRGANRRRANESQGRDFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.55
3 0.56
4 0.57
5 0.52
6 0.5
7 0.52
8 0.53
9 0.54
10 0.51
11 0.47
12 0.45
13 0.45
14 0.39
15 0.31
16 0.28
17 0.21
18 0.26
19 0.23
20 0.22
21 0.21
22 0.2
23 0.22
24 0.18
25 0.2
26 0.22
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.24
31 0.26
32 0.27
33 0.28
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.16
40 0.15
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.14
49 0.16
50 0.18
51 0.19
52 0.26
53 0.33
54 0.39
55 0.43
56 0.41
57 0.43
58 0.43
59 0.47
60 0.38
61 0.34
62 0.27
63 0.23
64 0.22
65 0.18
66 0.16
67 0.11
68 0.1
69 0.08
70 0.09
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.17
77 0.24
78 0.3
79 0.32
80 0.34
81 0.35
82 0.36
83 0.36
84 0.35
85 0.32
86 0.32
87 0.3
88 0.27
89 0.27
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.12
95 0.15
96 0.21
97 0.29
98 0.39
99 0.47
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.81
105 0.78
106 0.74
107 0.75
108 0.73
109 0.7
110 0.7
111 0.65
112 0.6
113 0.57
114 0.51
115 0.4
116 0.36
117 0.3
118 0.26
119 0.26
120 0.26
121 0.25
122 0.27
123 0.28
124 0.26
125 0.27
126 0.32
127 0.32
128 0.32
129 0.35
130 0.35
131 0.34
132 0.33
133 0.33
134 0.29
135 0.3
136 0.38
137 0.4
138 0.42
139 0.46
140 0.5
141 0.49
142 0.52
143 0.51
144 0.48
145 0.46
146 0.43
147 0.39
148 0.32
149 0.33
150 0.3
151 0.26
152 0.19
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.19
169 0.22
170 0.22
171 0.25
172 0.29
173 0.33
174 0.38
175 0.36
176 0.33
177 0.31
178 0.34
179 0.31
180 0.27
181 0.24
182 0.19
183 0.2
184 0.19
185 0.18
186 0.15
187 0.14
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.15
197 0.22
198 0.31
199 0.39
200 0.43
201 0.44
202 0.49
203 0.52
204 0.52
205 0.52
206 0.53
207 0.49
208 0.51
209 0.52
210 0.49
211 0.48
212 0.42
213 0.34
214 0.25
215 0.21
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.05
225 0.03
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.18
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.15
254 0.21
255 0.2
256 0.22
257 0.27
258 0.31
259 0.31
260 0.32
261 0.31
262 0.25
263 0.33
264 0.32
265 0.3
266 0.3
267 0.36
268 0.37
269 0.43
270 0.49
271 0.48
272 0.53
273 0.55
274 0.6
275 0.57
276 0.6
277 0.56
278 0.49
279 0.42
280 0.38
281 0.37
282 0.29
283 0.32
284 0.3
285 0.29
286 0.32
287 0.32
288 0.3
289 0.26
290 0.24
291 0.24
292 0.23
293 0.22
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.17
298 0.17
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.08
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.09
348 0.07
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.14
354 0.19
355 0.22
356 0.22
357 0.28
358 0.3
359 0.28
360 0.32
361 0.33
362 0.32
363 0.31
364 0.35
365 0.29
366 0.31
367 0.29
368 0.26
369 0.24
370 0.2
371 0.19
372 0.15
373 0.13
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.08
389 0.12
390 0.15
391 0.15
392 0.18
393 0.18
394 0.22
395 0.28
396 0.35
397 0.4
398 0.49
399 0.58
400 0.63
401 0.7
402 0.73
403 0.76
404 0.78
405 0.79
406 0.79
407 0.8
408 0.82
409 0.8
410 0.81
411 0.78
412 0.77
413 0.78
414 0.77
415 0.74
416 0.72
417 0.69
418 0.66
419 0.59
420 0.53
421 0.49
422 0.46
423 0.47
424 0.39
425 0.39
426 0.35
427 0.34
428 0.31
429 0.24
430 0.17
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.11
443 0.11
444 0.13
445 0.14
446 0.19
447 0.21
448 0.24
449 0.28
450 0.28
451 0.34
452 0.38
453 0.4
454 0.38
455 0.39
456 0.4
457 0.36
458 0.34
459 0.27
460 0.22
461 0.19
462 0.18
463 0.14
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.15
490 0.16
491 0.18
492 0.19
493 0.18
494 0.17
495 0.22
496 0.26
497 0.25
498 0.23
499 0.21
500 0.2
501 0.17
502 0.15
503 0.08
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.04
542 0.04
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.03
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.05
558 0.07
559 0.08
560 0.09
561 0.11
562 0.12
563 0.16
564 0.21
565 0.22
566 0.21
567 0.2
568 0.22
569 0.26
570 0.26
571 0.23
572 0.19
573 0.2
574 0.2
575 0.2
576 0.18
577 0.12
578 0.1
579 0.1
580 0.09
581 0.06
582 0.09
583 0.11
584 0.17
585 0.21
586 0.24
587 0.25
588 0.3
589 0.4
590 0.45
591 0.51
592 0.52
593 0.52
594 0.51
595 0.51
596 0.48
597 0.42
598 0.36
599 0.28
600 0.25
601 0.21
602 0.21
603 0.2
604 0.18
605 0.16
606 0.14
607 0.14
608 0.13
609 0.16
610 0.17
611 0.2
612 0.21
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.15
617 0.11
618 0.1
619 0.05
620 0.05
621 0.08
622 0.1
623 0.15
624 0.18
625 0.2
626 0.22
627 0.25
628 0.3
629 0.31
630 0.32
631 0.3
632 0.3
633 0.3
634 0.32
635 0.38
636 0.35
637 0.34
638 0.32
639 0.29
640 0.29
641 0.28
642 0.25
643 0.17
644 0.15
645 0.12
646 0.12
647 0.11
648 0.08
649 0.07
650 0.06
651 0.05
652 0.05
653 0.04
654 0.03
655 0.04
656 0.05
657 0.05
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.07
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.11
676 0.1
677 0.17
678 0.18
679 0.2
680 0.22
681 0.29
682 0.28
683 0.27
684 0.27
685 0.22
686 0.25
687 0.24
688 0.2
689 0.13
690 0.15
691 0.15
692 0.14
693 0.12
694 0.09
695 0.08
696 0.09
697 0.1
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.16
702 0.16
703 0.2
704 0.27
705 0.29
706 0.26
707 0.31
708 0.31
709 0.32
710 0.33
711 0.29
712 0.23
713 0.19
714 0.18
715 0.15
716 0.16
717 0.14
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.07
724 0.05
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.12
730 0.13
731 0.14
732 0.16
733 0.16
734 0.16
735 0.16
736 0.16
737 0.12
738 0.12
739 0.15
740 0.21
741 0.23
742 0.24
743 0.25
744 0.25
745 0.26
746 0.25
747 0.22
748 0.14
749 0.11
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.1
754 0.09
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.04
762 0.05
763 0.07
764 0.07
765 0.08
766 0.1
767 0.11
768 0.15
769 0.19
770 0.2
771 0.2
772 0.21
773 0.23
774 0.22
775 0.25
776 0.21
777 0.19
778 0.18
779 0.17
780 0.16
781 0.18
782 0.24
783 0.23
784 0.25
785 0.23
786 0.23
787 0.24
788 0.23
789 0.2
790 0.18
791 0.18
792 0.19
793 0.21
794 0.2
795 0.21
796 0.21
797 0.21
798 0.17
799 0.14
800 0.1
801 0.12
802 0.17
803 0.17
804 0.17
805 0.15
806 0.16
807 0.16
808 0.16
809 0.14
810 0.09
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.09
817 0.12
818 0.14
819 0.14
820 0.13
821 0.13
822 0.13
823 0.13
824 0.15
825 0.11
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.11
831 0.11
832 0.09
833 0.11
834 0.11
835 0.12
836 0.13
837 0.13
838 0.11
839 0.13
840 0.13
841 0.11
842 0.11
843 0.1
844 0.1
845 0.13
846 0.13
847 0.1
848 0.1
849 0.11
850 0.12
851 0.12
852 0.13
853 0.13
854 0.13
855 0.14
856 0.16
857 0.13
858 0.13
859 0.13
860 0.12
861 0.09
862 0.11
863 0.12
864 0.14
865 0.23
866 0.26
867 0.28
868 0.32
869 0.35
870 0.41
871 0.48
872 0.5
873 0.47
874 0.48
875 0.51
876 0.5
877 0.5
878 0.48
879 0.42
880 0.37
881 0.32
882 0.29
883 0.22
884 0.19
885 0.17
886 0.13
887 0.13
888 0.13
889 0.13
890 0.14
891 0.14
892 0.14
893 0.13
894 0.13
895 0.12
896 0.11
897 0.15
898 0.19
899 0.21
900 0.22
901 0.22
902 0.22
903 0.22
904 0.27
905 0.28
906 0.25
907 0.29
908 0.3
909 0.33
910 0.39
911 0.48
912 0.53
913 0.57
914 0.65
915 0.66
916 0.69
917 0.74
918 0.73
919 0.7
920 0.68
921 0.68
922 0.68
923 0.7
924 0.74
925 0.68
926 0.65
927 0.59
928 0.52
929 0.45
930 0.37
931 0.29
932 0.19
933 0.17
934 0.14
935 0.12
936 0.1
937 0.08
938 0.06
939 0.07
940 0.06
941 0.07
942 0.08
943 0.09
944 0.09
945 0.1
946 0.1
947 0.12
948 0.14
949 0.16
950 0.15
951 0.16
952 0.2
953 0.21
954 0.21
955 0.19
956 0.17
957 0.15
958 0.19
959 0.19
960 0.17
961 0.15
962 0.15
963 0.15
964 0.16
965 0.16
966 0.12
967 0.1
968 0.09
969 0.09
970 0.09
971 0.11
972 0.11
973 0.13
974 0.13
975 0.13
976 0.16
977 0.21
978 0.25
979 0.28
980 0.31
981 0.31
982 0.35
983 0.36
984 0.34
985 0.29
986 0.27
987 0.24
988 0.22
989 0.19
990 0.16
991 0.15
992 0.14
993 0.14
994 0.11
995 0.09
996 0.08
997 0.08
998 0.09
999 0.1
1000 0.13
1001 0.17
1002 0.24
1003 0.26
1004 0.26
1005 0.27
1006 0.31
1007 0.36
1008 0.34
1009 0.31
1010 0.3
1011 0.33
1012 0.34
1013 0.34
1014 0.3
1015 0.26
1016 0.25
1017 0.25
1018 0.22
1019 0.19
1020 0.18
1021 0.17
1022 0.16
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.15
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.16
1031 0.16
1032 0.17
1033 0.19
1034 0.15
1035 0.2
1036 0.24
1037 0.3
1038 0.32
1039 0.32
1040 0.33
1041 0.34
1042 0.36
1043 0.34
1044 0.35
1045 0.36
1046 0.37
1047 0.39
1048 0.39
1049 0.35
1050 0.37
1051 0.34
1052 0.3
1053 0.26
1054 0.27
1055 0.3
1056 0.32
1057 0.32
1058 0.31
1059 0.32
1060 0.34
1061 0.41
1062 0.44
1063 0.48
1064 0.54
1065 0.61
1066 0.66
1067 0.7
1068 0.77
1069 0.75
1070 0.77
1071 0.77
1072 0.77