FuNGI

A0A0L0HP55

Protein Details

Accession

A0A0L0HP55

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
689-711	LDEKIKQNKERLKQLPKKMHTLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 7, mito 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MANTVLPSPGYWLQTLSNHPVLDTSSSTLLDDSQTTPDVTLPDISSIALEAPSNHTLDVSGPDFMDDMGDSFATPDSRQSLIAVRDGLAVTCLNSSPPRIRLLNLRKWKGSLDETGDDVDKALETADFKELVSPTLSFRVRQIQMNGTGRLLAVVGEYEIVVLSLPRIAWTDGNTRERIRTNSWRIGPMTPQPIVKIHWHPLSESHTHLMVLSDDGALRIYDVTANANEPEQTLHFLGSEPIDTWKAPNRSGMFGADLWEREFVSFCVGRDDGNWGSMTMYGVTRSGDVYSLCPVVPQRSIFIPQKLQDLKAASALEQEEHEEHECYGPYTERQYYWREQWLDELLNEINQRSIKETLPGEPVGLTLPRMTAKVKCRARGPYLIQPSPDATIDYQDATDILCLATNPINVLIISFESGMLRTCIDLEGPVPLWNINAEALPGEAPLPVLRIHEDIDISWRESSGSQQTAPVRIPSSLAADPRHDAIFYCYHSFGVHRVSVEPWVSPLRGLSEAQADEAQLATELKSAMEQHIESDVSLLFSTRTFISTDVPSVVGFAVITEASLGYCYLLLTSHPHLYGDILPMHVNIPWKISEVTANEMYTPSMEPPIFDIPEVVRKAPPPLRLPTGASAKQVLAKCTHPPTLWAFFEHLKARRCDILDLHEAIIALRTRLERQQSELKQQAGALMLLDEKIKQNKERLKQLPKKMHTLRVKEYVQRKSLGIILQILIENSQPLTDAEKQWIKELHHIRNALQKRLKPWAENVQEQVHSLLQDRNPVEDPDKDAELDQLALGQTQMRRIETALRQEYKLLAGTAQKLTKLQNIVQKMEDTIRLKSMQSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.33
3	0.34
4	0.35
5	0.33
6	0.32
7	0.31
8	0.3
9	0.28
10	0.25
11	0.21
12	0.18
13	0.19
14	0.19
15	0.18
16	0.17
17	0.15
18	0.16
19	0.14
20	0.15
21	0.16
22	0.16
23	0.17
24	0.17
25	0.17
26	0.16
27	0.17
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.14
32	0.13
33	0.12
34	0.11
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.14
39	0.16
40	0.17
41	0.16
42	0.15
43	0.15
44	0.16
45	0.19
46	0.16
47	0.15
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.07
58	0.08
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.12
63	0.15
64	0.16
65	0.16
66	0.17
67	0.22
68	0.23
69	0.26
70	0.24
71	0.21
72	0.22
73	0.22
74	0.2
75	0.16
76	0.14
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.13
82	0.17
83	0.21
84	0.24
85	0.29
86	0.29
87	0.32
88	0.4
89	0.48
90	0.54
91	0.59
92	0.63
93	0.59
94	0.6
95	0.6
96	0.55
97	0.5
98	0.45
99	0.41
100	0.37
101	0.36
102	0.36
103	0.34
104	0.28
105	0.23
106	0.17
107	0.11
108	0.09
109	0.08
110	0.07
111	0.07
112	0.09
113	0.11
114	0.12
115	0.11
116	0.16
117	0.16
118	0.16
119	0.16
120	0.15
121	0.15
122	0.23
123	0.24
124	0.2
125	0.23
126	0.31
127	0.32
128	0.36
129	0.38
130	0.36
131	0.44
132	0.48
133	0.47
134	0.38
135	0.35
136	0.3
137	0.26
138	0.2
139	0.11
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.03
150	0.04
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.08
155	0.09
156	0.1
157	0.14
158	0.21
159	0.27
160	0.32
161	0.34
162	0.35
163	0.38
164	0.41
165	0.43
166	0.43
167	0.46
168	0.5
169	0.55
170	0.56
171	0.57
172	0.55
173	0.52
174	0.49
175	0.45
176	0.43
177	0.36
178	0.34
179	0.31
180	0.3
181	0.31
182	0.33
183	0.32
184	0.32
185	0.35
186	0.35
187	0.34
188	0.36
189	0.39
190	0.36
191	0.33
192	0.28
193	0.24
194	0.23
195	0.22
196	0.18
197	0.13
198	0.11
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.1
218	0.09
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.08
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.13
232	0.19
233	0.22
234	0.22
235	0.28
236	0.28
237	0.29
238	0.3
239	0.29
240	0.24
241	0.21
242	0.22
243	0.18
244	0.16
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.11
249	0.11
250	0.09
251	0.12
252	0.13
253	0.12
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.15
258	0.2
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.12
263	0.12
264	0.13
265	0.12
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.12
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.15
287	0.21
288	0.23
289	0.26
290	0.28
291	0.27
292	0.34
293	0.34
294	0.33
295	0.31
296	0.29
297	0.26
298	0.25
299	0.24
300	0.16
301	0.17
302	0.16
303	0.13
304	0.11
305	0.12
306	0.09
307	0.1
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.13
318	0.15
319	0.15
320	0.18
321	0.22
322	0.25
323	0.28
324	0.34
325	0.32
326	0.3
327	0.31
328	0.31
329	0.27
330	0.23
331	0.22
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.12
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.12
340	0.15
341	0.13
342	0.17
343	0.17
344	0.18
345	0.2
346	0.2
347	0.17
348	0.15
349	0.15
350	0.12
351	0.11
352	0.09
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.14
359	0.19
360	0.29
361	0.33
362	0.35
363	0.39
364	0.44
365	0.46
366	0.48
367	0.48
368	0.46
369	0.5
370	0.48
371	0.43
372	0.39
373	0.36
374	0.3
375	0.24
376	0.17
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.04
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.11
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.13
453	0.17
454	0.18
455	0.2
456	0.2
457	0.19
458	0.16
459	0.14
460	0.15
461	0.12
462	0.15
463	0.15
464	0.17
465	0.16
466	0.17
467	0.17
468	0.18
469	0.17
470	0.13
471	0.12
472	0.12
473	0.14
474	0.15
475	0.16
476	0.15
477	0.15
478	0.15
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.12
484	0.13
485	0.13
486	0.16
487	0.16
488	0.14
489	0.12
490	0.13
491	0.12
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.12
496	0.12
497	0.11
498	0.13
499	0.13
500	0.14
501	0.13
502	0.11
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.05
507	0.05
508	0.04
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.09
521	0.09
522	0.09
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.05
527	0.05
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.11
534	0.12
535	0.13
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.07
542	0.06
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.03
550	0.04
551	0.04
552	0.03
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.08
559	0.11
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.15
567	0.13
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.12
572	0.12
573	0.13
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.14
578	0.14
579	0.14
580	0.16
581	0.16
582	0.2
583	0.2
584	0.2
585	0.18
586	0.18
587	0.18
588	0.15
589	0.14
590	0.09
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.14
595	0.18
596	0.17
597	0.16
598	0.17
599	0.14
600	0.22
601	0.23
602	0.21
603	0.19
604	0.19
605	0.27
606	0.3
607	0.35
608	0.33
609	0.36
610	0.4
611	0.4
612	0.42
613	0.41
614	0.44
615	0.4
616	0.37
617	0.33
618	0.29
619	0.33
620	0.32
621	0.28
622	0.23
623	0.23
624	0.27
625	0.3
626	0.34
627	0.28
628	0.29
629	0.33
630	0.37
631	0.35
632	0.31
633	0.3
634	0.28
635	0.32
636	0.35
637	0.36
638	0.35
639	0.36
640	0.37
641	0.39
642	0.39
643	0.37
644	0.33
645	0.33
646	0.33
647	0.33
648	0.3
649	0.26
650	0.25
651	0.21
652	0.22
653	0.17
654	0.12
655	0.12
656	0.13
657	0.15
658	0.2
659	0.27
660	0.25
661	0.3
662	0.41
663	0.43
664	0.51
665	0.53
666	0.5
667	0.44
668	0.42
669	0.38
670	0.29
671	0.24
672	0.15
673	0.1
674	0.09
675	0.09
676	0.09
677	0.09
678	0.12
679	0.18
680	0.22
681	0.26
682	0.35
683	0.43
684	0.5
685	0.6
686	0.65
687	0.71
688	0.76
689	0.82
690	0.84
691	0.8
692	0.83
693	0.79
694	0.79
695	0.77
696	0.75
697	0.72
698	0.7
699	0.69
700	0.67
701	0.69
702	0.67
703	0.62
704	0.57
705	0.5
706	0.43
707	0.43
708	0.38
709	0.31
710	0.24
711	0.21
712	0.2
713	0.19
714	0.18
715	0.14
716	0.12
717	0.1
718	0.08
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.12
723	0.17
724	0.18
725	0.25
726	0.3
727	0.31
728	0.35
729	0.4
730	0.37
731	0.42
732	0.49
733	0.51
734	0.52
735	0.54
736	0.51
737	0.56
738	0.59
739	0.6
740	0.58
741	0.53
742	0.52
743	0.61
744	0.63
745	0.57
746	0.58
747	0.59
748	0.59
749	0.6
750	0.59
751	0.54
752	0.5
753	0.47
754	0.42
755	0.33
756	0.26
757	0.24
758	0.25
759	0.21
760	0.28
761	0.28
762	0.3
763	0.31
764	0.33
765	0.34
766	0.31
767	0.35
768	0.32
769	0.33
770	0.29
771	0.27
772	0.25
773	0.23
774	0.2
775	0.15
776	0.12
777	0.11
778	0.1
779	0.1
780	0.12
781	0.13
782	0.18
783	0.21
784	0.2
785	0.21
786	0.23
787	0.31
788	0.33
789	0.42
790	0.46
791	0.47
792	0.46
793	0.47
794	0.47
795	0.41
796	0.37
797	0.27
798	0.21
799	0.22
800	0.26
801	0.3
802	0.31
803	0.3
804	0.3
805	0.33
806	0.37
807	0.37
808	0.38
809	0.39
810	0.43
811	0.45
812	0.45
813	0.43
814	0.4
815	0.39
816	0.41
817	0.36
818	0.33
819	0.34
820	0.33

A0A0L0HP55

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer