Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HI73

Protein Details
Accession A0A0L0HI73    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-302SSDSDAKRKKVKAKRRETKRKAETKSKVDNKRKVKETEPETPKRPDKKRKRNEDAEANSPBasic
366-394LIVTRGKGFRNEKNKKKRGSYRGGRIDTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-151KERGKAKTAAKAKK
249-293KRKKVKAKRRETKRKAETKSKVDNKRKVKETEPETPKRPDKKRKR
372-385KGFRNEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTSSATLEGLLPLVLRFLEDSGAAKAAKALKKELPLCTKDASAEDGKTLIELYEAYIKLRQSSIDLKEEHETSDSESESDSGSDSSESSENEEAPRKSQKVTKGSGARDSSGSDSSEEGSSSEDEQDYSDNQSSKILKERGKAKTAAKAKKEESSSSSSDSSDSDSTESSSSSSESSDSDSTESSSSSESSDSDSTESTSSSESSDSDSTESSSSSDSSDSDSTESSSSSSESSDSESSESSSSDSDAKRKKVKAKRRETKRKAETKSKVDNKRKVKETEPETPKRPDKKRKRNEDAEANSPAPNGTSSSGPSTKKQKQVNGSAQKTERFQRVKEEEVDPQKIINNAYMAKGGADSSYGLKAHQDLIVTRGKGFRNEKNKKKRGSYRGGRIDTESYSVKFAQSSDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.16
13 0.23
14 0.26
15 0.27
16 0.31
17 0.34
18 0.42
19 0.48
20 0.52
21 0.53
22 0.53
23 0.54
24 0.51
25 0.47
26 0.4
27 0.37
28 0.33
29 0.28
30 0.26
31 0.23
32 0.21
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.11
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.19
44 0.19
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.18
49 0.25
50 0.29
51 0.32
52 0.33
53 0.33
54 0.37
55 0.37
56 0.33
57 0.27
58 0.23
59 0.2
60 0.22
61 0.2
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.11
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.18
79 0.24
80 0.23
81 0.25
82 0.33
83 0.31
84 0.33
85 0.37
86 0.43
87 0.44
88 0.47
89 0.52
90 0.52
91 0.53
92 0.58
93 0.55
94 0.48
95 0.41
96 0.38
97 0.32
98 0.27
99 0.24
100 0.17
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.28
123 0.3
124 0.31
125 0.36
126 0.45
127 0.46
128 0.5
129 0.53
130 0.47
131 0.5
132 0.56
133 0.57
134 0.54
135 0.55
136 0.52
137 0.53
138 0.53
139 0.47
140 0.42
141 0.4
142 0.37
143 0.33
144 0.32
145 0.26
146 0.24
147 0.22
148 0.2
149 0.15
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.12
232 0.13
233 0.2
234 0.25
235 0.31
236 0.38
237 0.43
238 0.52
239 0.58
240 0.68
241 0.71
242 0.77
243 0.81
244 0.85
245 0.91
246 0.9
247 0.91
248 0.91
249 0.9
250 0.86
251 0.87
252 0.84
253 0.81
254 0.83
255 0.82
256 0.82
257 0.82
258 0.84
259 0.83
260 0.83
261 0.81
262 0.75
263 0.72
264 0.7
265 0.66
266 0.67
267 0.67
268 0.64
269 0.62
270 0.65
271 0.68
272 0.69
273 0.73
274 0.73
275 0.76
276 0.81
277 0.86
278 0.9
279 0.91
280 0.91
281 0.9
282 0.89
283 0.83
284 0.78
285 0.72
286 0.62
287 0.52
288 0.42
289 0.33
290 0.23
291 0.18
292 0.14
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.17
297 0.23
298 0.24
299 0.29
300 0.37
301 0.44
302 0.51
303 0.56
304 0.58
305 0.61
306 0.69
307 0.75
308 0.75
309 0.72
310 0.71
311 0.68
312 0.63
313 0.59
314 0.55
315 0.53
316 0.47
317 0.44
318 0.47
319 0.49
320 0.51
321 0.52
322 0.5
323 0.49
324 0.52
325 0.55
326 0.44
327 0.4
328 0.38
329 0.35
330 0.32
331 0.26
332 0.22
333 0.19
334 0.2
335 0.2
336 0.17
337 0.15
338 0.15
339 0.12
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.14
353 0.18
354 0.25
355 0.24
356 0.25
357 0.29
358 0.29
359 0.36
360 0.42
361 0.48
362 0.52
363 0.62
364 0.71
365 0.77
366 0.84
367 0.85
368 0.89
369 0.9
370 0.89
371 0.9
372 0.89
373 0.89
374 0.91
375 0.86
376 0.78
377 0.72
378 0.65
379 0.55
380 0.49
381 0.42
382 0.32
383 0.31
384 0.29
385 0.25
386 0.22
387 0.21