Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HKH9

Protein Details
Accession A0A0L0HKH9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
708-727PKLPRGAAPKQQRSRTPFQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 7.5, cyto_nucl 6, nucl 3.5, pero 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR027078  snRNP-E  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF00995  Sec1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01718  Sm_E  
Amino Acid Sequences MSSVKAQKIMVAPINLIFRLLQQKVRVQIWLFEKVDIRMEGQILGFDEFMNLVLDDAEEHNLPDKTTKQLGRILLKGDNITLLCPALDAEASEIAASIVLADCATGGCGDAQPSVRGSIGQRARRSKLHTLALAMSAPKSLREQQKEALFTLLNLNTRDAIVDSALPDTASAATASSTTTLAITDPVWKVLIYDKLGQDVISPLVKVNDLREQGITVHMPLYSDRLPIPDVPAIYLVQPTAENIKRIGDDFGKQLYESYYINFLSSVPRPLLEDLAATAISTGVSGDVAQVYDQYLDYVCLDNNMFSLQMEDSYQSLNDPTSSESRIESLLDKIVGSLFSVLVTLGVVPIIRSQRGNAAEVVATKLESRLRDHMLNTRANLFMDNLSVTRNLSRPVLIILDRNLDLTMMLNHTWTYATLVHDIFDMKLNRVTIVDEEGGQRKRKTFDIDVNDFFWRKNASNPFPQVAEDVDVEINRYKADVDQVTKSCGVNSLDEVDPNDFSSGAKGLTSAIKQLPELTERKRLLDMHMNIATALLRTIQERHLDQFFSMEESISKQSKGNIMEAIRDPKKSPDDKLRLFSVYYLSTEAVSKEDLGEYETALAEAGCNVNAVHYLKQVRAFSRMNTVANVPPPQQSAANDLLGRFTSIGSKLTDHLKDAGVSGHFENLVSGVKNLLPLRKDCPATRIVDAMMEHKDGPDTEEYLYLDPKLPRGAAPKQQRSRTPFQEAIVFVVGGGNYLEYQNLTEYTQRASVQRKRITYGSTELVTPKAFMKQLEALGSGSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.29
3 0.27
4 0.21
5 0.2
6 0.27
7 0.29
8 0.31
9 0.32
10 0.38
11 0.44
12 0.46
13 0.46
14 0.39
15 0.43
16 0.43
17 0.47
18 0.42
19 0.39
20 0.39
21 0.36
22 0.39
23 0.34
24 0.3
25 0.23
26 0.23
27 0.21
28 0.19
29 0.19
30 0.15
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.09
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.19
51 0.2
52 0.24
53 0.32
54 0.34
55 0.34
56 0.4
57 0.46
58 0.48
59 0.49
60 0.47
61 0.43
62 0.42
63 0.39
64 0.33
65 0.29
66 0.23
67 0.21
68 0.17
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.23
106 0.3
107 0.36
108 0.43
109 0.49
110 0.54
111 0.58
112 0.64
113 0.63
114 0.63
115 0.62
116 0.56
117 0.52
118 0.49
119 0.44
120 0.38
121 0.3
122 0.22
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.16
127 0.22
128 0.3
129 0.36
130 0.41
131 0.45
132 0.52
133 0.53
134 0.49
135 0.45
136 0.35
137 0.29
138 0.31
139 0.27
140 0.24
141 0.22
142 0.22
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.14
147 0.12
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.21
179 0.19
180 0.23
181 0.22
182 0.24
183 0.25
184 0.24
185 0.2
186 0.17
187 0.16
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.19
201 0.21
202 0.18
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.14
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.18
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.18
232 0.17
233 0.18
234 0.21
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.19
239 0.18
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.07
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.12
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.15
342 0.16
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.1
354 0.1
355 0.13
356 0.15
357 0.19
358 0.2
359 0.22
360 0.27
361 0.3
362 0.3
363 0.28
364 0.27
365 0.24
366 0.22
367 0.21
368 0.15
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.09
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.09
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.11
424 0.16
425 0.19
426 0.22
427 0.22
428 0.23
429 0.25
430 0.27
431 0.31
432 0.3
433 0.35
434 0.4
435 0.44
436 0.43
437 0.43
438 0.42
439 0.36
440 0.31
441 0.25
442 0.19
443 0.15
444 0.2
445 0.26
446 0.29
447 0.35
448 0.38
449 0.38
450 0.36
451 0.35
452 0.29
453 0.22
454 0.19
455 0.13
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.11
467 0.13
468 0.15
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.24
473 0.24
474 0.2
475 0.2
476 0.19
477 0.14
478 0.15
479 0.16
480 0.15
481 0.15
482 0.16
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.09
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.17
504 0.21
505 0.22
506 0.29
507 0.3
508 0.31
509 0.33
510 0.32
511 0.32
512 0.37
513 0.36
514 0.33
515 0.33
516 0.32
517 0.28
518 0.28
519 0.23
520 0.14
521 0.12
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.09
526 0.12
527 0.15
528 0.16
529 0.2
530 0.21
531 0.21
532 0.2
533 0.19
534 0.17
535 0.16
536 0.15
537 0.12
538 0.1
539 0.12
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.15
544 0.17
545 0.22
546 0.24
547 0.23
548 0.24
549 0.23
550 0.26
551 0.29
552 0.35
553 0.32
554 0.32
555 0.31
556 0.32
557 0.4
558 0.39
559 0.42
560 0.44
561 0.52
562 0.55
563 0.58
564 0.55
565 0.48
566 0.45
567 0.4
568 0.33
569 0.24
570 0.21
571 0.18
572 0.15
573 0.14
574 0.14
575 0.14
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.16
601 0.18
602 0.2
603 0.25
604 0.29
605 0.28
606 0.33
607 0.33
608 0.3
609 0.37
610 0.38
611 0.34
612 0.32
613 0.33
614 0.3
615 0.32
616 0.34
617 0.26
618 0.25
619 0.26
620 0.26
621 0.25
622 0.23
623 0.24
624 0.24
625 0.25
626 0.24
627 0.22
628 0.22
629 0.2
630 0.19
631 0.14
632 0.11
633 0.12
634 0.12
635 0.14
636 0.14
637 0.15
638 0.17
639 0.23
640 0.24
641 0.23
642 0.24
643 0.23
644 0.22
645 0.21
646 0.22
647 0.17
648 0.18
649 0.16
650 0.15
651 0.14
652 0.14
653 0.13
654 0.11
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.15
661 0.17
662 0.21
663 0.22
664 0.24
665 0.29
666 0.34
667 0.38
668 0.35
669 0.37
670 0.38
671 0.39
672 0.38
673 0.35
674 0.29
675 0.28
676 0.27
677 0.26
678 0.23
679 0.21
680 0.19
681 0.17
682 0.18
683 0.15
684 0.18
685 0.17
686 0.16
687 0.15
688 0.18
689 0.19
690 0.19
691 0.2
692 0.18
693 0.21
694 0.2
695 0.22
696 0.22
697 0.22
698 0.24
699 0.3
700 0.36
701 0.41
702 0.51
703 0.59
704 0.65
705 0.72
706 0.77
707 0.78
708 0.8
709 0.78
710 0.76
711 0.7
712 0.62
713 0.61
714 0.53
715 0.49
716 0.41
717 0.32
718 0.23
719 0.21
720 0.18
721 0.12
722 0.11
723 0.08
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.07
728 0.08
729 0.09
730 0.11
731 0.12
732 0.15
733 0.16
734 0.18
735 0.22
736 0.23
737 0.27
738 0.36
739 0.43
740 0.49
741 0.56
742 0.57
743 0.58
744 0.6
745 0.58
746 0.54
747 0.51
748 0.47
749 0.4
750 0.38
751 0.35
752 0.33
753 0.3
754 0.26
755 0.22
756 0.22
757 0.23
758 0.22
759 0.26
760 0.28
761 0.31
762 0.32
763 0.31
764 0.27