Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HR45

Protein Details
Accession A0A0L0HR45    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-359DAQSRRVHSRQERRAERAPYNGRKTRRSKNKAPPPKVKVDELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-354VHSRQERRAERAPYNGRKTRRSKNKAPPPKV
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 9.833, nucl 7.5, cyto_nucl 6.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MPSPTQPLSDTARKAVRDLLLIYFCNSEINGTVANIPKNVISHEDWVAGWIPISTLASFKRLQAITKDPLEIARAAVELAPAIFEASPDGSRLRRRIPYDEKYAAEIDAREAISRNIVQVHGFGASTATTEVRAYFERFGPVVQLAAVGPVDKGTFHVEFANVEDMVKVLAQSHIYEDMQIQVQGKSKNVREPSTPSAARAAAISSLETHAGVTTYPHNRIVQFVLSDPQITKLAIKVAAEQFASVHSIDLERDAEAGYIRFKKSVAKEVVNVIERQGGLQVNGERVELRSLEGEEERLYWSVSKYRAENSELPKPLDAQSRRVHSRQERRAERAPYNGRKTRRSKNKAPPPKVKVDELQALLQGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.4
4 0.35
5 0.34
6 0.33
7 0.31
8 0.3
9 0.31
10 0.26
11 0.23
12 0.21
13 0.19
14 0.14
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.21
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.17
36 0.14
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.08
42 0.1
43 0.11
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.23
48 0.23
49 0.26
50 0.28
51 0.34
52 0.36
53 0.38
54 0.38
55 0.31
56 0.31
57 0.3
58 0.25
59 0.19
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.14
78 0.2
79 0.24
80 0.3
81 0.35
82 0.39
83 0.47
84 0.55
85 0.58
86 0.61
87 0.62
88 0.56
89 0.52
90 0.48
91 0.39
92 0.31
93 0.25
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.06
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.19
174 0.2
175 0.25
176 0.28
177 0.28
178 0.27
179 0.32
180 0.35
181 0.37
182 0.36
183 0.31
184 0.29
185 0.27
186 0.25
187 0.19
188 0.15
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.1
202 0.13
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.19
207 0.2
208 0.21
209 0.17
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.11
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.22
251 0.25
252 0.34
253 0.36
254 0.35
255 0.37
256 0.41
257 0.46
258 0.42
259 0.38
260 0.29
261 0.26
262 0.23
263 0.21
264 0.19
265 0.14
266 0.12
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.13
283 0.14
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.18
290 0.21
291 0.24
292 0.24
293 0.29
294 0.33
295 0.37
296 0.42
297 0.43
298 0.49
299 0.49
300 0.49
301 0.45
302 0.43
303 0.41
304 0.44
305 0.4
306 0.38
307 0.42
308 0.48
309 0.54
310 0.54
311 0.6
312 0.61
313 0.69
314 0.71
315 0.75
316 0.75
317 0.76
318 0.82
319 0.8
320 0.74
321 0.74
322 0.74
323 0.74
324 0.75
325 0.76
326 0.74
327 0.76
328 0.8
329 0.81
330 0.82
331 0.81
332 0.82
333 0.85
334 0.9
335 0.91
336 0.93
337 0.92
338 0.89
339 0.9
340 0.84
341 0.79
342 0.73
343 0.69
344 0.67
345 0.59
346 0.52