Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HT40

Protein Details
Accession A0A0L0HT40    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-132LDCFPEEEERRKRRRREGNGEDGEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-123RRKRRRR
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 12, mito 5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR040072  Methyltransferase_A  
IPR004383  rRNA_lsu_MTrfase_RlmN/Cfr  
IPR007197  rSAM  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04055  Radical_SAM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51918  RADICAL_SAM  
CDD cd01335  Radical_SAM  
Amino Acid Sequences MSRARPLNPKPIFDEELVLEAFRKNKIKESNAAKLWRYLIQQPEKTIDEIPDFPKAARKLIDDEFVITTSKVISRTDAKDGSTTKLLIELQDGQRVESVIMRYGEVELDCFPEEEERRKRRRREGNGEDGEEILEFRSNKRATLCVSSQVGCAMGCTFCATGTMGLLSNLAAGEIIEQLYHANKIEKIRNIVFMGMGEPLDNYNAVMAAVRAMVDTGRFGLAPSRISVSTVGVVPRIHSLIKDAPNIGLALSLHAPNQTLRQQIVPTAKAWHVDRILSACDAFIDHQNGLIKSTNRRRHILVEYVLIRDVNDSQETAHELGQLLKGRHVLLNVIPYNPTSVPHDYKTPNREDSRRFVETVREYGVHTLLRQTLGADAASACGQLVIDNGGQKTSGQCGDDKGTGNGVADLEDLLQNTGAGKNGVKVSIKYRKKAPSLATPTGVERNPLDTLQSGTAALTKRRSRLKVATLCALCILFAVVLGRVVLRSLGLATV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.37
3 0.35
4 0.32
5 0.25
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.22
10 0.28
11 0.27
12 0.35
13 0.44
14 0.49
15 0.55
16 0.61
17 0.65
18 0.66
19 0.71
20 0.64
21 0.59
22 0.56
23 0.52
24 0.47
25 0.44
26 0.46
27 0.49
28 0.52
29 0.5
30 0.53
31 0.5
32 0.48
33 0.44
34 0.37
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.31
39 0.29
40 0.28
41 0.34
42 0.32
43 0.33
44 0.32
45 0.32
46 0.33
47 0.35
48 0.39
49 0.31
50 0.32
51 0.29
52 0.26
53 0.24
54 0.18
55 0.15
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.16
61 0.22
62 0.26
63 0.33
64 0.33
65 0.32
66 0.36
67 0.38
68 0.38
69 0.34
70 0.31
71 0.24
72 0.25
73 0.24
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.22
78 0.27
79 0.27
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.21
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.13
93 0.13
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.15
100 0.18
101 0.26
102 0.36
103 0.43
104 0.53
105 0.62
106 0.71
107 0.76
108 0.84
109 0.86
110 0.87
111 0.86
112 0.87
113 0.83
114 0.77
115 0.67
116 0.56
117 0.45
118 0.34
119 0.25
120 0.14
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.22
128 0.24
129 0.24
130 0.3
131 0.31
132 0.28
133 0.3
134 0.29
135 0.27
136 0.25
137 0.22
138 0.15
139 0.14
140 0.1
141 0.07
142 0.06
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.16
172 0.22
173 0.24
174 0.29
175 0.29
176 0.32
177 0.31
178 0.29
179 0.24
180 0.18
181 0.16
182 0.11
183 0.1
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.11
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.14
235 0.09
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.19
251 0.22
252 0.2
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.2
257 0.21
258 0.2
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.16
264 0.13
265 0.12
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.18
278 0.17
279 0.24
280 0.34
281 0.4
282 0.42
283 0.44
284 0.45
285 0.47
286 0.5
287 0.47
288 0.39
289 0.36
290 0.34
291 0.32
292 0.3
293 0.24
294 0.19
295 0.14
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.14
309 0.17
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.2
324 0.18
325 0.18
326 0.15
327 0.2
328 0.23
329 0.24
330 0.3
331 0.31
332 0.38
333 0.44
334 0.45
335 0.47
336 0.5
337 0.55
338 0.54
339 0.57
340 0.58
341 0.54
342 0.5
343 0.43
344 0.45
345 0.42
346 0.4
347 0.35
348 0.28
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.2
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.09
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.15
384 0.18
385 0.22
386 0.25
387 0.25
388 0.23
389 0.22
390 0.21
391 0.21
392 0.18
393 0.15
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.12
409 0.14
410 0.17
411 0.19
412 0.2
413 0.29
414 0.38
415 0.45
416 0.46
417 0.53
418 0.59
419 0.63
420 0.68
421 0.65
422 0.66
423 0.68
424 0.68
425 0.63
426 0.55
427 0.53
428 0.52
429 0.46
430 0.38
431 0.3
432 0.28
433 0.27
434 0.25
435 0.23
436 0.18
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.16
441 0.14
442 0.18
443 0.19
444 0.22
445 0.28
446 0.32
447 0.38
448 0.47
449 0.52
450 0.56
451 0.62
452 0.68
453 0.68
454 0.68
455 0.71
456 0.62
457 0.58
458 0.52
459 0.43
460 0.32
461 0.23
462 0.18
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.07