Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HFC5

Protein Details
Accession A0A0L0HFC5    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-45RTVSPAWTHKRKKIYTNQVATNGHydrophilic
209-229SEPEIIPPKRQRNKAKKSETAHydrophilic
258-280TEAPRKGGPRPRRERAKKVCYSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-204RAKTRRAAP
214-225IPPKRQRNKAKK
261-275PRKGGPRPRRERAKK
288-299KPKPGRKAKTRT
311-327GKSKGRRPLRRAAAAKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 6.833, mito 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001370  BIR_rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MVATSRKNLTTMECFDLRLETFRTVSPAWTHKRKKIYTNQVATNGWYLSNGPAECVCGWCNAVRSTWSGVDDPALGHSNTCVLGQFWTRFGQDKSGTGSLDARQKTFDESWPHQNAAGWEKLSGQKMAAAGFIYFPLAESRDTAMCPYCKLSLDGWEPEDDPIIEHEKRQPTCQFLKAKRKQAKTQSGAPTATASRAKTRRAAPHASESEPEIIPPKRQRNKAKKSETAVTLVVPEVEADVVNENADGKENSPDLTPTEAPRKGGPRPRRERAKKVCYSEDLLDLDGKPKPGRKAKTRTANEKVEETDTTGKSKGRRPLRRAAAAKKETNSMETTRESGIETADEAESVAMTDIGEGGSELHLEVDMTPTPSAIDNQLPAVSETIPPFINGVPNDPGFVGKITIEKLSAHKTSMALTNEQKSMTVEEYLRNEAMSVRAEFRKKRVEAWQSVEREFEKLIHWIEKHPGDDMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.36
4 0.31
5 0.27
6 0.25
7 0.22
8 0.23
9 0.23
10 0.27
11 0.24
12 0.26
13 0.29
14 0.35
15 0.41
16 0.5
17 0.58
18 0.61
19 0.7
20 0.74
21 0.78
22 0.79
23 0.82
24 0.82
25 0.82
26 0.81
27 0.77
28 0.71
29 0.63
30 0.55
31 0.45
32 0.34
33 0.26
34 0.2
35 0.16
36 0.2
37 0.18
38 0.16
39 0.16
40 0.18
41 0.18
42 0.19
43 0.18
44 0.14
45 0.16
46 0.16
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.22
52 0.24
53 0.25
54 0.25
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.08
70 0.11
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.24
77 0.24
78 0.29
79 0.26
80 0.27
81 0.31
82 0.31
83 0.3
84 0.27
85 0.29
86 0.25
87 0.31
88 0.3
89 0.25
90 0.24
91 0.24
92 0.28
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.34
97 0.43
98 0.45
99 0.45
100 0.4
101 0.39
102 0.36
103 0.33
104 0.31
105 0.22
106 0.19
107 0.21
108 0.25
109 0.25
110 0.22
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.15
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.18
139 0.21
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.21
146 0.21
147 0.14
148 0.11
149 0.11
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.21
154 0.27
155 0.28
156 0.33
157 0.34
158 0.35
159 0.39
160 0.46
161 0.48
162 0.5
163 0.61
164 0.64
165 0.71
166 0.73
167 0.75
168 0.76
169 0.78
170 0.79
171 0.72
172 0.73
173 0.7
174 0.66
175 0.59
176 0.51
177 0.43
178 0.33
179 0.31
180 0.25
181 0.18
182 0.22
183 0.25
184 0.27
185 0.31
186 0.37
187 0.42
188 0.45
189 0.5
190 0.45
191 0.5
192 0.51
193 0.47
194 0.41
195 0.34
196 0.31
197 0.25
198 0.22
199 0.17
200 0.15
201 0.19
202 0.26
203 0.35
204 0.4
205 0.49
206 0.59
207 0.66
208 0.76
209 0.81
210 0.82
211 0.79
212 0.76
213 0.73
214 0.64
215 0.55
216 0.45
217 0.35
218 0.27
219 0.2
220 0.15
221 0.09
222 0.07
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.2
246 0.2
247 0.21
248 0.24
249 0.27
250 0.3
251 0.38
252 0.45
253 0.49
254 0.57
255 0.65
256 0.73
257 0.77
258 0.82
259 0.83
260 0.85
261 0.81
262 0.78
263 0.73
264 0.65
265 0.61
266 0.51
267 0.44
268 0.34
269 0.27
270 0.22
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.17
277 0.24
278 0.31
279 0.39
280 0.46
281 0.54
282 0.62
283 0.71
284 0.74
285 0.77
286 0.76
287 0.76
288 0.68
289 0.61
290 0.54
291 0.45
292 0.38
293 0.32
294 0.3
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.24
299 0.26
300 0.32
301 0.37
302 0.42
303 0.51
304 0.55
305 0.63
306 0.69
307 0.75
308 0.75
309 0.76
310 0.76
311 0.73
312 0.71
313 0.62
314 0.58
315 0.49
316 0.45
317 0.39
318 0.3
319 0.27
320 0.24
321 0.25
322 0.2
323 0.2
324 0.18
325 0.16
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.13
376 0.17
377 0.15
378 0.18
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.2
383 0.2
384 0.16
385 0.16
386 0.13
387 0.1
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.18
394 0.24
395 0.24
396 0.24
397 0.24
398 0.24
399 0.26
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.32
404 0.36
405 0.35
406 0.35
407 0.33
408 0.27
409 0.28
410 0.24
411 0.23
412 0.2
413 0.23
414 0.27
415 0.3
416 0.29
417 0.25
418 0.24
419 0.21
420 0.22
421 0.2
422 0.19
423 0.21
424 0.27
425 0.35
426 0.39
427 0.45
428 0.52
429 0.5
430 0.54
431 0.59
432 0.63
433 0.64
434 0.67
435 0.69
436 0.64
437 0.63
438 0.61
439 0.52
440 0.44
441 0.37
442 0.31
443 0.24
444 0.24
445 0.27
446 0.29
447 0.3
448 0.31
449 0.39
450 0.42
451 0.41