Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HMA2

Protein Details
Accession A0A0L0HMA2    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-330RDSYRDSKDRDRRRDRRSHSSSRSHSRSRSRRRDRYSSKRSSRDRDRDRSRSRSRTRSRSRSTHRRNRETSRDRYRPSRRDRSRSRERSRDRRDRYSDYHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-387YRDSKDRDRRRDRRSHSSSRSHSRSRSRRRDRYSSKRSSRDRDRDRSRSRSRTRSRSRSTHRRNRETSRDRYRPSRRDRSRSRERSRDRRDRYSDYHRGSREGERYRRDDRSRGSPEERRSREREDNEESRAVPEGIKKKPSVSSKKVNALFKKT
392-397GEPKKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTATEAQNIHGTNPQFLIEKIIRTRIYDSLYWKESCFALTAETLIDKAVNLTSIGGQYGNQKPTEFLCLALKMLQLQPEKEIVRLYIQNEDYKYLRALGAFYLRLTGTAVEIYQYLEPLLLDYRKLRRRNISGEFELTHVDEFVDDLLRSERVCDTILPRITKRHILEENGDLEPRLSPLEEDLEDEEIAEDSEGEITSEGEKMDQSRRTEGDRKLRTSSRERHDHRDSYRDSKDRDRRRDRRSHSSSRSHSRSRSRRRDRYSSKRSSRDRDRDRSRSRSRTRSRSRSTHRRNRETSRDRYRPSRRDRSRSRERSRDRRDRYSDYHRGSREGERYRRDDRSRGSPEERRSREREDNEESRAVPEGIKKKPSVSSKKVNALFKKTAVQAGEPKKAGKEGGGGASESLSVEETNKMRAALGLKPLKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.26
4 0.27
5 0.21
6 0.2
7 0.26
8 0.23
9 0.29
10 0.3
11 0.36
12 0.36
13 0.37
14 0.41
15 0.38
16 0.4
17 0.38
18 0.4
19 0.4
20 0.44
21 0.42
22 0.39
23 0.37
24 0.32
25 0.29
26 0.24
27 0.17
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.17
48 0.23
49 0.26
50 0.26
51 0.25
52 0.26
53 0.28
54 0.33
55 0.26
56 0.21
57 0.22
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.17
63 0.19
64 0.24
65 0.23
66 0.22
67 0.24
68 0.28
69 0.28
70 0.26
71 0.25
72 0.2
73 0.22
74 0.25
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.3
79 0.3
80 0.32
81 0.29
82 0.27
83 0.26
84 0.2
85 0.19
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.11
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.09
110 0.08
111 0.1
112 0.14
113 0.24
114 0.32
115 0.37
116 0.42
117 0.48
118 0.55
119 0.62
120 0.65
121 0.64
122 0.59
123 0.57
124 0.52
125 0.43
126 0.37
127 0.29
128 0.21
129 0.14
130 0.1
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.19
147 0.24
148 0.25
149 0.26
150 0.3
151 0.32
152 0.37
153 0.36
154 0.36
155 0.35
156 0.35
157 0.37
158 0.35
159 0.36
160 0.29
161 0.28
162 0.2
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.12
195 0.16
196 0.17
197 0.2
198 0.21
199 0.26
200 0.34
201 0.38
202 0.43
203 0.44
204 0.46
205 0.48
206 0.5
207 0.5
208 0.51
209 0.54
210 0.51
211 0.56
212 0.57
213 0.61
214 0.65
215 0.66
216 0.6
217 0.59
218 0.56
219 0.53
220 0.56
221 0.52
222 0.48
223 0.51
224 0.58
225 0.6
226 0.67
227 0.71
228 0.74
229 0.79
230 0.86
231 0.83
232 0.84
233 0.83
234 0.82
235 0.8
236 0.8
237 0.77
238 0.77
239 0.76
240 0.7
241 0.69
242 0.69
243 0.72
244 0.73
245 0.77
246 0.79
247 0.82
248 0.85
249 0.89
250 0.88
251 0.89
252 0.88
253 0.88
254 0.86
255 0.86
256 0.85
257 0.84
258 0.84
259 0.84
260 0.83
261 0.83
262 0.83
263 0.85
264 0.86
265 0.86
266 0.85
267 0.85
268 0.84
269 0.84
270 0.84
271 0.84
272 0.87
273 0.87
274 0.86
275 0.85
276 0.87
277 0.87
278 0.89
279 0.89
280 0.89
281 0.88
282 0.87
283 0.86
284 0.87
285 0.84
286 0.83
287 0.84
288 0.82
289 0.76
290 0.79
291 0.81
292 0.79
293 0.81
294 0.82
295 0.81
296 0.83
297 0.89
298 0.88
299 0.89
300 0.9
301 0.9
302 0.89
303 0.89
304 0.9
305 0.9
306 0.91
307 0.88
308 0.88
309 0.86
310 0.83
311 0.8
312 0.79
313 0.78
314 0.74
315 0.73
316 0.64
317 0.6
318 0.56
319 0.55
320 0.54
321 0.54
322 0.56
323 0.55
324 0.59
325 0.63
326 0.68
327 0.66
328 0.65
329 0.61
330 0.64
331 0.64
332 0.66
333 0.67
334 0.65
335 0.7
336 0.73
337 0.74
338 0.71
339 0.69
340 0.7
341 0.72
342 0.7
343 0.68
344 0.66
345 0.65
346 0.62
347 0.6
348 0.52
349 0.43
350 0.39
351 0.32
352 0.25
353 0.28
354 0.3
355 0.34
356 0.39
357 0.38
358 0.4
359 0.47
360 0.55
361 0.58
362 0.59
363 0.63
364 0.66
365 0.75
366 0.78
367 0.79
368 0.76
369 0.74
370 0.71
371 0.64
372 0.61
373 0.54
374 0.51
375 0.44
376 0.41
377 0.42
378 0.45
379 0.5
380 0.46
381 0.45
382 0.43
383 0.43
384 0.39
385 0.32
386 0.29
387 0.25
388 0.27
389 0.27
390 0.25
391 0.23
392 0.22
393 0.21
394 0.16
395 0.12
396 0.09
397 0.08
398 0.09
399 0.14
400 0.15
401 0.18
402 0.19
403 0.19
404 0.19
405 0.21
406 0.23
407 0.23
408 0.32