Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HRR8

Protein Details
Accession A0A0L0HRR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-61RESPPPSRPPPKPAGRRKKAYKSTENLSRTHydrophilic
100-125KLQPETEKRARKSRRHRDAKQNDEGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-51ARESPPPSRPPPKPAGRRKKA
107-116KRARKSRRHR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 9, nucl 4.5, mito 4, pero 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029302  IFT43  
Gene Ontology GO:0030991  C:intraciliary transport particle A  
Pfam View protein in Pfam  
PF15305  IFT43  
Amino Acid Sequences MSDTHYVPNPALSASLANALEAAAEADKRDARESPPPSRPPPKPAGRRKKAYKSTENLSRTLGNDGDNVIDATPEETIHIAEPSAGIRSGGEAFSNMPDKLQPETEKRARKSRRHRDAKQNDEGPMMASSSRSRSGWELGGREASIDHEPENGGFMMRKSGKQRGGFVDDADDGDNKAANLENLKKHTTVGNGGTEEAVIMIIPDLDDVQDDEMLTTVAAAPAVKVNRFKTIKELDGDLMASTGQLVEPPTSIGGIDVSLLVSIALVPPDQVIEPDIHWDWEVIFTEVTSDLQPPLTNTDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.16
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.09
9 0.1
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.1
14 0.13
15 0.14
16 0.17
17 0.18
18 0.22
19 0.31
20 0.37
21 0.43
22 0.51
23 0.56
24 0.62
25 0.69
26 0.7
27 0.69
28 0.72
29 0.73
30 0.75
31 0.79
32 0.82
33 0.82
34 0.87
35 0.89
36 0.91
37 0.9
38 0.89
39 0.88
40 0.83
41 0.81
42 0.81
43 0.73
44 0.64
45 0.57
46 0.49
47 0.41
48 0.37
49 0.3
50 0.21
51 0.19
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.17
89 0.19
90 0.22
91 0.31
92 0.38
93 0.46
94 0.48
95 0.57
96 0.62
97 0.68
98 0.74
99 0.77
100 0.8
101 0.83
102 0.87
103 0.89
104 0.9
105 0.89
106 0.86
107 0.78
108 0.68
109 0.58
110 0.5
111 0.39
112 0.29
113 0.2
114 0.12
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.18
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.12
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.11
144 0.12
145 0.15
146 0.18
147 0.25
148 0.31
149 0.33
150 0.36
151 0.35
152 0.39
153 0.36
154 0.32
155 0.28
156 0.22
157 0.2
158 0.17
159 0.13
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.08
168 0.13
169 0.16
170 0.19
171 0.21
172 0.21
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.19
180 0.19
181 0.18
182 0.16
183 0.14
184 0.1
185 0.07
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.08
210 0.1
211 0.12
212 0.17
213 0.19
214 0.28
215 0.3
216 0.31
217 0.35
218 0.39
219 0.41
220 0.38
221 0.39
222 0.3
223 0.29
224 0.29
225 0.21
226 0.15
227 0.11
228 0.09
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.17
269 0.18
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.14