FuNGI

A0A0L0HSE9

Protein Details

Accession

A0A0L0HSE9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
670-700	AEHSLAKEERRKRREERRLKKIQRDKAVEAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
676-695	KEERRKRREERRLKKIQRDK

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR014789 PolyA-riboNase_RNA-binding IPR036867 R3H_dom_sf IPR006941 RNase_CAF1 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004535 F:poly(A)-specific ribonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006402 P:mRNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF04857 CAF1 PF08675 RNA_bind

Amino Acid Sequences

MRFRFSALKSQSGSDVQIAALNISTVRVSLDPVRSRLCNRFTHTLGRSRCAAASRPASPQGGKTDHPLQRNLATEPGFCVRLPSGSLWSLRDRLGGHYQPAKSMEVLRNSFEALLPNIQEAVQEADFIAIDTELSGIGTARPYQIAFLDTVQERYEKIRRSAQNFLVIQFGLCTFTWDSGRKVYVAKPFNCYVFPQSGSRTLGLDRQYSFQIGSLEFLRGNKFDFNKWISQGIPFLNLDDEAEARQKIGAVAQGNDIPIEGANREFMDSTIQAVQNWLQNSSEKTLEVAAPSSFHRRLIHQEIKKRYNSALSTEGTAGYVTIRKLTNEERKSGSNNRVAYLENELEQLIGFRKVIEVISRSKKPVIGHNVMLDLCQTYEKFHRSLPENVQEFKQGLHNLFPVIYDTKYIAHSESDVQPFIMQSALSDVLRRVSLKPFTYPTIVVHPDFTGYEDADNFHEAGYDAYATGVVFVKLMGQIVKNEGNLPLSFDSPAFQPALNKLHIMRSDIPYMNIVGDEDIPDRSHVFKVYDFPSDVTLSDVQSEFKTLGSVGINFIDDNSCFLTVRNGDMVKDVIPTFGEVENANGEERERMFSYRIETFADHAARQVAQNVTEGGGVGALRAPHSTALRRQQYRDYTTRAAKRPRVDPEGEVAEGLTAGSSSHNYTRSPAEHSLAKEERRKRREERRLKKIQRDKAVEAAARLQARQASSGCTIQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.27
3	0.2
4	0.21
5	0.19
6	0.15
7	0.13
8	0.11
9	0.09
10	0.09
11	0.09
12	0.06
13	0.08
14	0.08
15	0.11
16	0.17
17	0.26
18	0.3
19	0.34
20	0.39
21	0.41
22	0.47
23	0.52
24	0.53
25	0.52
26	0.54
27	0.58
28	0.57
29	0.62
30	0.62
31	0.63
32	0.6
33	0.56
34	0.53
35	0.47
36	0.46
37	0.4
38	0.39
39	0.38
40	0.4
41	0.4
42	0.42
43	0.44
44	0.45
45	0.42
46	0.42
47	0.42
48	0.4
49	0.38
50	0.39
51	0.44
52	0.47
53	0.5
54	0.49
55	0.45
56	0.45
57	0.47
58	0.43
59	0.39
60	0.35
61	0.31
62	0.32
63	0.31
64	0.27
65	0.24
66	0.25
67	0.19
68	0.19
69	0.21
70	0.19
71	0.2
72	0.22
73	0.24
74	0.24
75	0.28
76	0.29
77	0.27
78	0.28
79	0.25
80	0.27
81	0.34
82	0.34
83	0.35
84	0.4
85	0.4
86	0.4
87	0.42
88	0.38
89	0.31
90	0.34
91	0.34
92	0.35
93	0.37
94	0.35
95	0.34
96	0.33
97	0.32
98	0.26
99	0.22
100	0.16
101	0.17
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.14
106	0.13
107	0.12
108	0.14
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.05
117	0.05
118	0.04
119	0.05
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.06
126	0.07
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.1
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.11
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.2
142	0.26
143	0.27
144	0.31
145	0.39
146	0.45
147	0.5
148	0.58
149	0.56
150	0.59
151	0.54
152	0.5
153	0.43
154	0.36
155	0.3
156	0.22
157	0.18
158	0.12
159	0.11
160	0.13
161	0.11
162	0.13
163	0.17
164	0.19
165	0.2
166	0.21
167	0.22
168	0.21
169	0.22
170	0.25
171	0.3
172	0.37
173	0.37
174	0.38
175	0.39
176	0.4
177	0.39
178	0.36
179	0.31
180	0.27
181	0.27
182	0.25
183	0.25
184	0.28
185	0.29
186	0.28
187	0.25
188	0.22
189	0.24
190	0.24
191	0.25
192	0.21
193	0.21
194	0.22
195	0.21
196	0.2
197	0.17
198	0.16
199	0.13
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.14
206	0.12
207	0.14
208	0.17
209	0.18
210	0.19
211	0.24
212	0.27
213	0.28
214	0.29
215	0.3
216	0.25
217	0.25
218	0.26
219	0.21
220	0.2
221	0.16
222	0.15
223	0.14
224	0.13
225	0.12
226	0.09
227	0.09
228	0.07
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.11
237	0.1
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.09
255	0.09
256	0.1
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.13
261	0.15
262	0.15
263	0.16
264	0.14
265	0.12
266	0.13
267	0.15
268	0.16
269	0.16
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.13
274	0.11
275	0.11
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.16
280	0.15
281	0.17
282	0.18
283	0.18
284	0.25
285	0.34
286	0.41
287	0.41
288	0.49
289	0.55
290	0.6
291	0.6
292	0.55
293	0.47
294	0.44
295	0.39
296	0.35
297	0.31
298	0.25
299	0.25
300	0.23
301	0.22
302	0.16
303	0.14
304	0.1
305	0.07
306	0.08
307	0.07
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.12
312	0.2
313	0.29
314	0.3
315	0.33
316	0.33
317	0.34
318	0.39
319	0.43
320	0.41
321	0.37
322	0.36
323	0.34
324	0.32
325	0.31
326	0.27
327	0.25
328	0.19
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.09
344	0.14
345	0.2
346	0.22
347	0.23
348	0.23
349	0.26
350	0.26
351	0.31
352	0.33
353	0.31
354	0.31
355	0.3
356	0.31
357	0.28
358	0.27
359	0.19
360	0.11
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.11
366	0.13
367	0.14
368	0.15
369	0.2
370	0.23
371	0.29
372	0.32
373	0.37
374	0.37
375	0.37
376	0.37
377	0.33
378	0.29
379	0.24
380	0.23
381	0.16
382	0.14
383	0.15
384	0.15
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.11
395	0.11
396	0.1
397	0.09
398	0.1
399	0.12
400	0.16
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.11
408	0.06
409	0.04
410	0.06
411	0.08
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.11
419	0.14
420	0.19
421	0.2
422	0.23
423	0.24
424	0.26
425	0.27
426	0.26
427	0.23
428	0.24
429	0.25
430	0.22
431	0.21
432	0.18
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.11
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.09
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.05
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.07
464	0.08
465	0.11
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.16
473	0.14
474	0.13
475	0.13
476	0.12
477	0.12
478	0.11
479	0.13
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.14
484	0.18
485	0.18
486	0.19
487	0.18
488	0.22
489	0.23
490	0.27
491	0.26
492	0.26
493	0.31
494	0.3
495	0.3
496	0.26
497	0.25
498	0.2
499	0.16
500	0.13
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.12
510	0.13
511	0.13
512	0.14
513	0.15
514	0.2
515	0.22
516	0.24
517	0.23
518	0.23
519	0.23
520	0.22
521	0.21
522	0.19
523	0.17
524	0.14
525	0.15
526	0.14
527	0.13
528	0.12
529	0.13
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.08
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.15
550	0.15
551	0.17
552	0.2
553	0.19
554	0.18
555	0.2
556	0.21
557	0.16
558	0.17
559	0.15
560	0.11
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.1
567	0.11
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.1
572	0.1
573	0.12
574	0.13
575	0.16
576	0.16
577	0.17
578	0.19
579	0.2
580	0.24
581	0.25
582	0.25
583	0.23
584	0.23
585	0.23
586	0.28
587	0.28
588	0.23
589	0.22
590	0.22
591	0.2
592	0.2
593	0.23
594	0.18
595	0.17
596	0.18
597	0.17
598	0.16
599	0.15
600	0.14
601	0.09
602	0.09
603	0.07
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.08
609	0.09
610	0.11
611	0.15
612	0.2
613	0.27
614	0.37
615	0.46
616	0.51
617	0.54
618	0.6
619	0.65
620	0.68
621	0.66
622	0.63
623	0.61
624	0.66
625	0.71
626	0.7
627	0.71
628	0.71
629	0.72
630	0.72
631	0.73
632	0.71
633	0.66
634	0.59
635	0.56
636	0.54
637	0.47
638	0.38
639	0.3
640	0.22
641	0.18
642	0.16
643	0.09
644	0.04
645	0.04
646	0.05
647	0.07
648	0.1
649	0.14
650	0.17
651	0.18
652	0.21
653	0.27
654	0.28
655	0.34
656	0.35
657	0.35
658	0.38
659	0.39
660	0.46
661	0.46
662	0.51
663	0.53
664	0.59
665	0.66
666	0.68
667	0.74
668	0.75
669	0.8
670	0.84
671	0.86
672	0.88
673	0.88
674	0.92
675	0.94
676	0.95
677	0.94
678	0.92
679	0.91
680	0.89
681	0.83
682	0.79
683	0.76
684	0.68
685	0.59
686	0.54
687	0.49
688	0.43
689	0.38
690	0.33
691	0.29
692	0.28
693	0.29
694	0.25
695	0.24

A0A0L0HSE9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer