Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0H9Z1

Protein Details
Accession A0A0L0H9Z1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-47LQPTASPPPKKQKPTIPITRGKFKNRFLRKHSSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-42KKRPRKASLQPTASPPPKKQKPTIPITRGKFKNRFLR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSAEEKKRPRKASLQPTASPPPKKQKPTIPITRGKFKNRFLRKHSSLLHNCKSEGLERPRGLIITCPVGSETRALGQIRTFLDRYLPILFPEHKTVWTSRPHELDIDLKIVGASDSELGGAPQDTGGDGDDSADEMNETREESADSKNDRKFQAVDAACGGVLFIRFRVDTDPVDFVVKLFEYMNTLSLSEQNSLKKSISHCSRILPITHTMPSTLPDIQSHLEPVIPRMLTPHLDTLTTQPPTLACITEVRNREGLKKESVRDAVLKCVPGLGSVQTSDSSPQVDAKLVCWSVNLKEPTVVLFTTVFKSVCGFSVLPRYYEYKKYNVQMIGVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.73
3 0.75
4 0.78
5 0.76
6 0.72
7 0.68
8 0.69
9 0.7
10 0.75
11 0.75
12 0.76
13 0.77
14 0.81
15 0.83
16 0.81
17 0.81
18 0.8
19 0.82
20 0.79
21 0.8
22 0.78
23 0.76
24 0.78
25 0.79
26 0.81
27 0.79
28 0.82
29 0.78
30 0.78
31 0.76
32 0.76
33 0.76
34 0.77
35 0.76
36 0.68
37 0.63
38 0.56
39 0.51
40 0.44
41 0.44
42 0.42
43 0.43
44 0.41
45 0.43
46 0.42
47 0.4
48 0.37
49 0.31
50 0.25
51 0.22
52 0.21
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.17
58 0.16
59 0.12
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.2
65 0.2
66 0.23
67 0.21
68 0.18
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.2
73 0.18
74 0.15
75 0.19
76 0.21
77 0.22
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.25
82 0.26
83 0.27
84 0.34
85 0.35
86 0.35
87 0.37
88 0.36
89 0.35
90 0.34
91 0.32
92 0.25
93 0.23
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.07
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.11
131 0.14
132 0.18
133 0.23
134 0.26
135 0.31
136 0.3
137 0.31
138 0.29
139 0.26
140 0.32
141 0.26
142 0.24
143 0.2
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.26
186 0.29
187 0.32
188 0.32
189 0.33
190 0.36
191 0.35
192 0.35
193 0.29
194 0.26
195 0.24
196 0.24
197 0.22
198 0.19
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.2
221 0.16
222 0.17
223 0.18
224 0.2
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.16
233 0.1
234 0.13
235 0.17
236 0.23
237 0.26
238 0.26
239 0.29
240 0.3
241 0.35
242 0.38
243 0.38
244 0.4
245 0.43
246 0.43
247 0.46
248 0.47
249 0.44
250 0.43
251 0.41
252 0.39
253 0.36
254 0.34
255 0.27
256 0.26
257 0.24
258 0.18
259 0.18
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.22
276 0.21
277 0.2
278 0.2
279 0.21
280 0.2
281 0.28
282 0.29
283 0.23
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.25
288 0.22
289 0.16
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.2
294 0.18
295 0.15
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.18
300 0.16
301 0.17
302 0.27
303 0.28
304 0.28
305 0.29
306 0.34
307 0.34
308 0.44
309 0.45
310 0.42
311 0.48
312 0.52
313 0.56
314 0.53