Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HDP2

Protein Details
Accession A0A0L0HDP2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKARNRRRLPQQQPLQDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 5, nucl 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005373  PHAF1  
IPR039156  PHAF1/BROMI  
Pfam View protein in Pfam  
PF03676  PHAF1  
Amino Acid Sequences MGKARNRRRLPQQQPLQDIGQVDKEELCKEPLESVNKEAGESVCVDVASETALTAEGAVVLETVALKPPPSPSPPNEKEEALEQATKQPPKQPSPDLTSFTPAIANPVAAEPSNVLRPPKPTSHPPRLPTPRMTPTATPLPTAPRLECTVVPGRSVGPFILGAPIGEVVERLRGMEGVVPRVECKYGDLNPLDIDIVLNLPANGVCMRFDPKSQCLKSIELYDFSKLSLFYNGVEFNSYKVLPTFVHIYRLFGPIYPGEFCEEKKHYVLSYPGISFMFPIPDKYIPLQNITDLPLSFPDGTTPVLNRIYVYAGAEKWEDAVPPTLSQLEPITAELNHGIHIPQRDCTLKFGAPAQDVLDALGKPEKILEKGEDKMKIFGVDVAEECDGGGYFWNYFSLGIDILFSGTTHTITKFILHTNFLGCWEFGEYTKCRFQVVGFENGAVIGCDDLWNDVQSTLPTPSPRPVVFNRGNHHNPFGSTWFYGFDGVVFEVMKNGYLASVTLYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.79
3 0.69
4 0.61
5 0.52
6 0.44
7 0.39
8 0.3
9 0.25
10 0.24
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.19
16 0.19
17 0.24
18 0.28
19 0.33
20 0.33
21 0.35
22 0.39
23 0.37
24 0.37
25 0.33
26 0.27
27 0.22
28 0.21
29 0.18
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.14
56 0.19
57 0.25
58 0.31
59 0.34
60 0.45
61 0.5
62 0.54
63 0.53
64 0.49
65 0.44
66 0.41
67 0.41
68 0.33
69 0.3
70 0.25
71 0.3
72 0.37
73 0.39
74 0.37
75 0.4
76 0.44
77 0.48
78 0.54
79 0.53
80 0.53
81 0.58
82 0.61
83 0.58
84 0.52
85 0.5
86 0.43
87 0.36
88 0.31
89 0.23
90 0.21
91 0.17
92 0.15
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.11
100 0.15
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.23
105 0.28
106 0.33
107 0.37
108 0.43
109 0.51
110 0.6
111 0.65
112 0.65
113 0.7
114 0.73
115 0.73
116 0.69
117 0.67
118 0.63
119 0.6
120 0.59
121 0.5
122 0.46
123 0.49
124 0.43
125 0.36
126 0.31
127 0.31
128 0.32
129 0.33
130 0.28
131 0.23
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.25
136 0.28
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.22
141 0.2
142 0.21
143 0.16
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.04
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.16
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.21
179 0.18
180 0.13
181 0.11
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.1
195 0.11
196 0.14
197 0.17
198 0.23
199 0.32
200 0.32
201 0.35
202 0.35
203 0.36
204 0.35
205 0.36
206 0.31
207 0.24
208 0.25
209 0.22
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.1
229 0.08
230 0.1
231 0.14
232 0.12
233 0.19
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.21
239 0.16
240 0.17
241 0.11
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.16
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.12
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.18
272 0.16
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.13
280 0.12
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.18
331 0.21
332 0.21
333 0.24
334 0.26
335 0.22
336 0.22
337 0.25
338 0.26
339 0.23
340 0.23
341 0.21
342 0.17
343 0.16
344 0.16
345 0.14
346 0.1
347 0.1
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.16
355 0.19
356 0.21
357 0.25
358 0.3
359 0.33
360 0.32
361 0.32
362 0.3
363 0.27
364 0.24
365 0.22
366 0.18
367 0.14
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.14
400 0.14
401 0.18
402 0.2
403 0.21
404 0.22
405 0.22
406 0.23
407 0.22
408 0.22
409 0.17
410 0.15
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.2
415 0.2
416 0.23
417 0.29
418 0.28
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.31
423 0.33
424 0.35
425 0.3
426 0.3
427 0.29
428 0.28
429 0.27
430 0.17
431 0.13
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.07
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.15
445 0.17
446 0.2
447 0.21
448 0.27
449 0.32
450 0.32
451 0.36
452 0.38
453 0.45
454 0.5
455 0.55
456 0.56
457 0.6
458 0.65
459 0.63
460 0.63
461 0.55
462 0.49
463 0.45
464 0.42
465 0.37
466 0.31
467 0.28
468 0.25
469 0.24
470 0.23
471 0.19
472 0.16
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.08