Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FM02

Protein Details
Accession Q6FM02    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-153SPNRLIKKSSSERHKKSQSIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0043596  C:nuclear replication fork  
GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:0010520  P:regulation of reciprocal meiotic recombination  
GO:0000712  P:resolution of meiotic recombination intermediates  
KEGG cgr:CAGL0K12122g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MPTTPVIEILDDSSLLDDSLIEEIISDNNDNVIHPTEIDESIEISIPYVNDKTAESNSTSLGNSQKESSLIVTQTASQRKRILDEILSDDLSISTDDFSLDAIPKQTSGRTRDSQKNDSALYESSQEKASIASSPNRLIKKSSSERHKKSQSIDSKDICIKSPTRKINLGVTESMQTDVLFEDNNFNNIECTQETDLSFSTATADTPTVGFKEITFKHKESTNEGLNSHNFSDSIFERQRLKQYITNIRDITETESQELYNKLIHTEKGLFNAVNQTPRDNFKAREDIIVDFSPSLLSFLDKQTEILKSILAPATIQKSIHDELPRIRFFRKCHSFYDLQHDFFFPSNYKIVEENTTILYFDSKEFFVKYKEDKRSLFEKLKEIERDNYEIILVLYDLAKFKRELEKIEETKYRSRVQSQIYDSQQSIQQNKVTTPQSDYGLKKFDVEQRLRYINREWGLKIHIVNSHNDFVHSLPNLCSIIGKQRMDPAIRYMRYAHLNVKSASDRKDTLKKTINEIGKVPDIKASAISDIYSSFQSLLHDFEAGSLKASSDGNYLMSEALEKRLHKIFTSTDPNEAVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.18
26 0.16
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.12
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.14
39 0.17
40 0.19
41 0.22
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.23
46 0.22
47 0.21
48 0.24
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.2
61 0.27
62 0.34
63 0.34
64 0.34
65 0.39
66 0.39
67 0.42
68 0.42
69 0.4
70 0.34
71 0.36
72 0.37
73 0.35
74 0.34
75 0.29
76 0.26
77 0.21
78 0.18
79 0.14
80 0.09
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.18
94 0.23
95 0.28
96 0.34
97 0.38
98 0.46
99 0.55
100 0.62
101 0.64
102 0.62
103 0.61
104 0.55
105 0.49
106 0.44
107 0.35
108 0.29
109 0.25
110 0.21
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.19
120 0.21
121 0.26
122 0.32
123 0.34
124 0.35
125 0.34
126 0.35
127 0.4
128 0.46
129 0.5
130 0.55
131 0.63
132 0.69
133 0.76
134 0.8
135 0.76
136 0.72
137 0.73
138 0.72
139 0.7
140 0.71
141 0.63
142 0.59
143 0.59
144 0.54
145 0.46
146 0.4
147 0.36
148 0.37
149 0.44
150 0.46
151 0.46
152 0.49
153 0.5
154 0.52
155 0.53
156 0.47
157 0.4
158 0.34
159 0.31
160 0.27
161 0.25
162 0.18
163 0.13
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.15
177 0.09
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.15
200 0.17
201 0.23
202 0.27
203 0.28
204 0.29
205 0.33
206 0.35
207 0.33
208 0.36
209 0.36
210 0.33
211 0.33
212 0.34
213 0.31
214 0.31
215 0.26
216 0.2
217 0.14
218 0.12
219 0.14
220 0.12
221 0.18
222 0.17
223 0.19
224 0.23
225 0.26
226 0.32
227 0.32
228 0.35
229 0.31
230 0.38
231 0.46
232 0.45
233 0.48
234 0.42
235 0.39
236 0.36
237 0.33
238 0.3
239 0.24
240 0.22
241 0.17
242 0.18
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.16
258 0.15
259 0.21
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.22
266 0.26
267 0.23
268 0.23
269 0.23
270 0.29
271 0.28
272 0.28
273 0.27
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.19
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.09
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.14
306 0.15
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.22
311 0.29
312 0.3
313 0.28
314 0.3
315 0.3
316 0.32
317 0.41
318 0.44
319 0.4
320 0.42
321 0.46
322 0.48
323 0.46
324 0.53
325 0.46
326 0.39
327 0.36
328 0.33
329 0.28
330 0.24
331 0.24
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.24
357 0.32
358 0.39
359 0.44
360 0.45
361 0.48
362 0.51
363 0.54
364 0.54
365 0.48
366 0.47
367 0.44
368 0.49
369 0.49
370 0.46
371 0.44
372 0.4
373 0.4
374 0.34
375 0.31
376 0.24
377 0.2
378 0.17
379 0.12
380 0.09
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.09
388 0.12
389 0.2
390 0.22
391 0.25
392 0.31
393 0.4
394 0.42
395 0.47
396 0.49
397 0.45
398 0.5
399 0.51
400 0.49
401 0.43
402 0.44
403 0.45
404 0.45
405 0.49
406 0.48
407 0.51
408 0.49
409 0.48
410 0.44
411 0.39
412 0.38
413 0.34
414 0.32
415 0.27
416 0.27
417 0.26
418 0.27
419 0.31
420 0.31
421 0.27
422 0.29
423 0.28
424 0.29
425 0.34
426 0.35
427 0.33
428 0.34
429 0.33
430 0.3
431 0.31
432 0.35
433 0.38
434 0.39
435 0.4
436 0.42
437 0.49
438 0.49
439 0.48
440 0.45
441 0.43
442 0.43
443 0.41
444 0.36
445 0.32
446 0.34
447 0.34
448 0.32
449 0.27
450 0.29
451 0.27
452 0.31
453 0.32
454 0.32
455 0.29
456 0.28
457 0.26
458 0.21
459 0.25
460 0.22
461 0.19
462 0.16
463 0.19
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.14
468 0.22
469 0.28
470 0.28
471 0.26
472 0.32
473 0.38
474 0.39
475 0.39
476 0.38
477 0.4
478 0.4
479 0.41
480 0.37
481 0.37
482 0.4
483 0.41
484 0.41
485 0.37
486 0.41
487 0.4
488 0.42
489 0.43
490 0.43
491 0.44
492 0.42
493 0.39
494 0.41
495 0.5
496 0.49
497 0.52
498 0.57
499 0.55
500 0.57
501 0.62
502 0.61
503 0.54
504 0.53
505 0.49
506 0.47
507 0.46
508 0.39
509 0.35
510 0.3
511 0.27
512 0.27
513 0.23
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.13
521 0.12
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.14
526 0.15
527 0.15
528 0.14
529 0.13
530 0.16
531 0.19
532 0.17
533 0.18
534 0.15
535 0.15
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.13
540 0.14
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.14
547 0.13
548 0.18
549 0.21
550 0.21
551 0.25
552 0.32
553 0.33
554 0.32
555 0.35
556 0.34
557 0.39
558 0.48
559 0.46
560 0.44