Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HGC5

Protein Details
Accession A0A0L0HGC5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-39VSDATLKPTHTKKKKPRKTNVTQFAPLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-29KKKKPRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, cyto 10.5, nucl 8, mito_nucl 7.999, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01360  ZF_MYND_1  
PS50865  ZF_MYND_2  
Amino Acid Sequences MVGKKEATPSVVSDATLKPTHTKKKKPRKTNVTQFAPLVEQGQWPIIVQHSQSKGRHAVAKEDLSAGTVICQERAATLVVSTPCVSEFCHRCVGSLLKAQLLQQRVSCPACAKTTYCSSACQKADAARHVLECPIVPKLTDIATKHDINVDLLRLTLSLIVRRVLEERRAKMAKEEVTDAPIAPWWCINELALHPQVFDKNWVKCVAAAAQDMSEILPESLATSAPKLVELACRINTNAHSLSDDDEKTADTAFGLFPMGSLFFKHSCAPNCHFTADRGILTYRTIKPIKAGEELLVSHIELFQPRSTRKQELLNTKQIRCDCSRCRVPLRKSVDRFLDGVLCEKCHVGVYLAESEFPEIAKDAHPVENGASANGSKAEEKQDTKAVDTKSEDVVDDSKTLASKDGEQGDEKTEEEKQAAEQDAKAREELLKKECRCDNCGHVKKLIEVEMIRIQVQRDYQQIFQFVQSKNHGATITYFRLFIDRYQKGRLLHPYHVHLVNAHLPLLTAYKTLGDYASCLPIIKHVIDIYESSNIVAPLRHEFVELYAELGVILSALAIANRAEGNGRVHRGGEVLEKRYKREALEAYRKAYEVCRICLGEQSAKTVELKKKARV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.28
4 0.27
5 0.29
6 0.38
7 0.48
8 0.55
9 0.64
10 0.69
11 0.79
12 0.88
13 0.92
14 0.94
15 0.94
16 0.95
17 0.95
18 0.95
19 0.92
20 0.86
21 0.75
22 0.66
23 0.57
24 0.47
25 0.38
26 0.28
27 0.21
28 0.17
29 0.18
30 0.15
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.22
37 0.27
38 0.35
39 0.37
40 0.41
41 0.45
42 0.47
43 0.52
44 0.46
45 0.47
46 0.46
47 0.48
48 0.43
49 0.39
50 0.35
51 0.29
52 0.27
53 0.2
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.09
64 0.09
65 0.13
66 0.13
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.2
74 0.23
75 0.25
76 0.34
77 0.33
78 0.33
79 0.37
80 0.39
81 0.35
82 0.38
83 0.35
84 0.29
85 0.3
86 0.33
87 0.34
88 0.33
89 0.3
90 0.26
91 0.27
92 0.3
93 0.31
94 0.29
95 0.27
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.28
100 0.27
101 0.32
102 0.35
103 0.33
104 0.35
105 0.37
106 0.42
107 0.42
108 0.39
109 0.35
110 0.35
111 0.4
112 0.39
113 0.38
114 0.32
115 0.32
116 0.31
117 0.3
118 0.25
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.2
128 0.19
129 0.23
130 0.27
131 0.28
132 0.28
133 0.29
134 0.27
135 0.25
136 0.25
137 0.19
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.26
153 0.31
154 0.33
155 0.4
156 0.42
157 0.41
158 0.42
159 0.45
160 0.4
161 0.36
162 0.37
163 0.29
164 0.3
165 0.3
166 0.25
167 0.19
168 0.18
169 0.16
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.16
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.18
183 0.19
184 0.17
185 0.23
186 0.24
187 0.23
188 0.26
189 0.27
190 0.26
191 0.25
192 0.26
193 0.22
194 0.18
195 0.17
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.12
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.12
253 0.15
254 0.19
255 0.24
256 0.28
257 0.3
258 0.31
259 0.31
260 0.3
261 0.27
262 0.28
263 0.24
264 0.2
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.2
270 0.16
271 0.2
272 0.21
273 0.2
274 0.22
275 0.25
276 0.26
277 0.23
278 0.23
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.12
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.13
293 0.19
294 0.23
295 0.26
296 0.27
297 0.33
298 0.38
299 0.45
300 0.5
301 0.54
302 0.56
303 0.53
304 0.55
305 0.49
306 0.47
307 0.4
308 0.41
309 0.35
310 0.38
311 0.43
312 0.43
313 0.51
314 0.56
315 0.57
316 0.58
317 0.63
318 0.63
319 0.61
320 0.61
321 0.56
322 0.48
323 0.45
324 0.36
325 0.3
326 0.22
327 0.23
328 0.18
329 0.15
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.1
335 0.06
336 0.07
337 0.09
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.08
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.07
364 0.08
365 0.13
366 0.16
367 0.18
368 0.2
369 0.25
370 0.25
371 0.26
372 0.3
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.26
377 0.23
378 0.22
379 0.2
380 0.16
381 0.17
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.12
391 0.16
392 0.18
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.19
399 0.17
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.2
410 0.23
411 0.23
412 0.22
413 0.19
414 0.22
415 0.25
416 0.29
417 0.31
418 0.36
419 0.36
420 0.43
421 0.47
422 0.47
423 0.47
424 0.46
425 0.47
426 0.49
427 0.57
428 0.53
429 0.53
430 0.5
431 0.48
432 0.47
433 0.4
434 0.32
435 0.24
436 0.25
437 0.25
438 0.25
439 0.23
440 0.21
441 0.2
442 0.19
443 0.21
444 0.2
445 0.21
446 0.23
447 0.25
448 0.26
449 0.28
450 0.27
451 0.28
452 0.32
453 0.29
454 0.32
455 0.32
456 0.32
457 0.3
458 0.32
459 0.29
460 0.22
461 0.24
462 0.26
463 0.27
464 0.25
465 0.24
466 0.21
467 0.24
468 0.24
469 0.25
470 0.28
471 0.3
472 0.33
473 0.37
474 0.42
475 0.41
476 0.47
477 0.52
478 0.47
479 0.48
480 0.5
481 0.5
482 0.51
483 0.5
484 0.44
485 0.35
486 0.33
487 0.31
488 0.27
489 0.23
490 0.17
491 0.16
492 0.16
493 0.17
494 0.14
495 0.09
496 0.08
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.09
502 0.11
503 0.13
504 0.15
505 0.14
506 0.14
507 0.13
508 0.17
509 0.2
510 0.17
511 0.17
512 0.15
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.17
517 0.16
518 0.16
519 0.14
520 0.16
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.15
526 0.18
527 0.18
528 0.17
529 0.17
530 0.18
531 0.2
532 0.19
533 0.15
534 0.12
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.08
539 0.04
540 0.04
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.04
546 0.04
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.08
551 0.11
552 0.17
553 0.23
554 0.26
555 0.26
556 0.27
557 0.27
558 0.26
559 0.26
560 0.29
561 0.3
562 0.32
563 0.4
564 0.41
565 0.45
566 0.51
567 0.52
568 0.45
569 0.47
570 0.5
571 0.52
572 0.61
573 0.63
574 0.61
575 0.6
576 0.58
577 0.51
578 0.45
579 0.43
580 0.37
581 0.36
582 0.37
583 0.37
584 0.37
585 0.41
586 0.43
587 0.42
588 0.38
589 0.39
590 0.35
591 0.35
592 0.37
593 0.4
594 0.42
595 0.44