Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FX90

Protein Details
Accession Q6FX90    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-174REYRHKQSSSPRRRADRRNAFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-169KKRSKTFGRLAELGSRVKREYRHKQSSSPRRRADR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
Gene Ontology GO:0030479  C:actin cortical patch  
GO:0051666  P:actin cortical patch localization  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
KEGG cgr:CAGL0B00814g  -  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MGFLTDHPYTAVTANIDRVVSNREYSLEVELAEIVDLIGFRNTVNQEEAARALRKKLKYGSKVQQSRSLDLLDLLLSQELKFGVIYNDDKLLDRLEVIALNRDTDGNGVKYNPAIVSKAAKYEIQWYEHIASIGKKRSKTFGRLAELGSRVKREYRHKQSSSPRRRADRRNAFLDDEADPFESLEDDNVTTERNRGNASTDADRLYRIPQIDIRKHAPKIKLIISDALAASVALKHSLLTLPADKYSTDDMEATDNFIKARKIRKKVLAYLQVVTEGEFLGSLIQANDELVASLTEYDEKSDKAEHDTREDRNDGNDSDDVNESVDYEYSDDDADEVSRADHSIYSVPQSTASNPFGDQNHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.17
5 0.18
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.19
10 0.19
11 0.21
12 0.22
13 0.24
14 0.19
15 0.17
16 0.16
17 0.15
18 0.13
19 0.11
20 0.09
21 0.06
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.11
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.19
35 0.22
36 0.22
37 0.25
38 0.24
39 0.3
40 0.36
41 0.37
42 0.43
43 0.49
44 0.54
45 0.57
46 0.66
47 0.68
48 0.72
49 0.77
50 0.74
51 0.74
52 0.68
53 0.64
54 0.56
55 0.47
56 0.37
57 0.29
58 0.26
59 0.17
60 0.13
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.15
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.11
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.24
110 0.26
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.25
115 0.25
116 0.25
117 0.18
118 0.17
119 0.2
120 0.28
121 0.29
122 0.3
123 0.3
124 0.38
125 0.42
126 0.45
127 0.48
128 0.48
129 0.49
130 0.48
131 0.48
132 0.45
133 0.42
134 0.39
135 0.32
136 0.26
137 0.22
138 0.23
139 0.28
140 0.33
141 0.41
142 0.48
143 0.57
144 0.58
145 0.65
146 0.73
147 0.78
148 0.8
149 0.79
150 0.75
151 0.74
152 0.79
153 0.8
154 0.81
155 0.8
156 0.75
157 0.71
158 0.67
159 0.6
160 0.52
161 0.45
162 0.35
163 0.25
164 0.2
165 0.14
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.15
185 0.18
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.13
195 0.13
196 0.17
197 0.25
198 0.28
199 0.32
200 0.36
201 0.39
202 0.42
203 0.47
204 0.45
205 0.41
206 0.41
207 0.41
208 0.39
209 0.34
210 0.33
211 0.28
212 0.26
213 0.22
214 0.18
215 0.13
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.15
245 0.17
246 0.18
247 0.29
248 0.35
249 0.42
250 0.49
251 0.59
252 0.64
253 0.7
254 0.75
255 0.74
256 0.68
257 0.61
258 0.54
259 0.46
260 0.38
261 0.31
262 0.21
263 0.12
264 0.09
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.16
289 0.17
290 0.23
291 0.29
292 0.29
293 0.36
294 0.41
295 0.44
296 0.46
297 0.48
298 0.41
299 0.39
300 0.41
301 0.33
302 0.32
303 0.29
304 0.24
305 0.24
306 0.24
307 0.2
308 0.17
309 0.16
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.13
331 0.15
332 0.19
333 0.21
334 0.21
335 0.23
336 0.24
337 0.25
338 0.29
339 0.29
340 0.26
341 0.24
342 0.29