FuNGI

Q6FV06

Protein Details

Accession

Q6FV06

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
547-579	TSILRAQKKKLDIKKKKKRTARANKFLAKREVV	Hydrophilic
589-609	LPLKDRSSYRVNKKQAGKTTQ	Hydrophilic
624-647	TKKNTASKSGKGKAKPKKKGKGRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
550-596	LRAQKKKLDIKKKKKRTARANKFLAKREVVKKNPDPERWLPLKDRSS
598-602	RVNKK
625-647	KKNTASKSGKGKAKPKKKGKGRK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	cgr:CAGL0E05742g -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72

Amino Acid Sequences

MVQKNLTELLSQLNVQSNNSEHVDAAKTCKELIDNGCSKEGEVFRQWLVALIKQDKYQAAFDLIKHYKDLDNRHGSEFVLEKLYVYYKLNSVHEFEQVYKTYSEHVTNKNQMERGILHIRAQFCYKNGINKEAHEIYEHLSESNKDEADDNSELICNILVPLTADPKLSETWANLKHEITDMLSSEKSYDVLFNYSIILVALKEYELAFKVLDKAHELAVPEGYQNDLDTIELQKSYLLQITGQTVQSKEILKPLLDRLVPGSPLQLIANSNYHAFVDYSKFTTNFDLLLRQINQERFYSYHLQKYTHEQWKLINNNLLFLNLFNNNQINRKETILAKTLHNYKNLIDNVAIEPYKTQAKKLYHFTMQSIDSGINGSAIGNLLLTVQLLVVEKQYDNAIRICENFLSKSGYAEKSPKLFDQNHLVVCTILFQLYRMSSRIGNINRLVAILEMLPEEYINDNSSFWIYVAYEALANGNIEKSREILQRLSTDQTNITPEQNELINAVLSSSESAFDEAVRLVEDIDVEQIRSAGIRPIAPKSAEKSATSILRAQKKKLDIKKKKKRTARANKFLAKREVVKKNPDPERWLPLKDRSSYRVNKKQAGKTTQGGASSKKIEQALDITKKNTASKSGKGKAKPKKKGKGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.25
4	0.23
5	0.25
6	0.27
7	0.25
8	0.19
9	0.21
10	0.25
11	0.23
12	0.27
13	0.27
14	0.25
15	0.25
16	0.26
17	0.25
18	0.26
19	0.3
20	0.34
21	0.35
22	0.37
23	0.41
24	0.39
25	0.38
26	0.39
27	0.36
28	0.32
29	0.31
30	0.31
31	0.28
32	0.29
33	0.29
34	0.27
35	0.27
36	0.25
37	0.28
38	0.3
39	0.32
40	0.33
41	0.36
42	0.33
43	0.34
44	0.32
45	0.27
46	0.28
47	0.28
48	0.27
49	0.34
50	0.34
51	0.32
52	0.32
53	0.32
54	0.31
55	0.35
56	0.41
57	0.41
58	0.47
59	0.49
60	0.52
61	0.5
62	0.46
63	0.43
64	0.37
65	0.29
66	0.23
67	0.2
68	0.17
69	0.18
70	0.19
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.24
76	0.27
77	0.27
78	0.29
79	0.28
80	0.3
81	0.3
82	0.28
83	0.29
84	0.27
85	0.28
86	0.24
87	0.23
88	0.23
89	0.24
90	0.28
91	0.29
92	0.35
93	0.41
94	0.48
95	0.53
96	0.54
97	0.53
98	0.48
99	0.45
100	0.39
101	0.38
102	0.37
103	0.32
104	0.31
105	0.33
106	0.34
107	0.32
108	0.35
109	0.29
110	0.24
111	0.31
112	0.29
113	0.34
114	0.35
115	0.4
116	0.38
117	0.38
118	0.45
119	0.39
120	0.37
121	0.31
122	0.29
123	0.24
124	0.26
125	0.25
126	0.17
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.21
131	0.18
132	0.15
133	0.16
134	0.16
135	0.21
136	0.21
137	0.18
138	0.15
139	0.15
140	0.15
141	0.14
142	0.12
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.04
147	0.05
148	0.07
149	0.1
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.13
154	0.13
155	0.14
156	0.14
157	0.13
158	0.2
159	0.25
160	0.28
161	0.28
162	0.27
163	0.27
164	0.27
165	0.26
166	0.19
167	0.15
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.11
179	0.11
180	0.1
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.08
185	0.07
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.11
198	0.12
199	0.12
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.16
204	0.16
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.09
228	0.11
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.14
234	0.16
235	0.17
236	0.15
237	0.17
238	0.17
239	0.16
240	0.18
241	0.19
242	0.21
243	0.19
244	0.19
245	0.17
246	0.18
247	0.18
248	0.16
249	0.15
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.1
265	0.1
266	0.12
267	0.13
268	0.13
269	0.14
270	0.15
271	0.14
272	0.12
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.15
277	0.14
278	0.15
279	0.18
280	0.19
281	0.21
282	0.2
283	0.21
284	0.18
285	0.21
286	0.27
287	0.25
288	0.29
289	0.28
290	0.3
291	0.29
292	0.36
293	0.41
294	0.41
295	0.4
296	0.34
297	0.36
298	0.42
299	0.44
300	0.39
301	0.34
302	0.27
303	0.27
304	0.27
305	0.24
306	0.16
307	0.13
308	0.12
309	0.09
310	0.1
311	0.09
312	0.11
313	0.11
314	0.16
315	0.17
316	0.18
317	0.17
318	0.18
319	0.2
320	0.2
321	0.22
322	0.22
323	0.23
324	0.21
325	0.24
326	0.32
327	0.32
328	0.32
329	0.29
330	0.25
331	0.31
332	0.31
333	0.27
334	0.19
335	0.17
336	0.16
337	0.18
338	0.17
339	0.1
340	0.09
341	0.1
342	0.16
343	0.15
344	0.16
345	0.2
346	0.24
347	0.29
348	0.36
349	0.38
350	0.37
351	0.38
352	0.37
353	0.34
354	0.31
355	0.26
356	0.2
357	0.16
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.16
394	0.15
395	0.16
396	0.2
397	0.2
398	0.21
399	0.25
400	0.26
401	0.25
402	0.27
403	0.27
404	0.29
405	0.29
406	0.3
407	0.34
408	0.35
409	0.34
410	0.33
411	0.31
412	0.24
413	0.22
414	0.21
415	0.12
416	0.09
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.14
426	0.21
427	0.22
428	0.25
429	0.25
430	0.25
431	0.24
432	0.23
433	0.22
434	0.14
435	0.12
436	0.07
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.1
450	0.1
451	0.08
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.15
469	0.19
470	0.22
471	0.23
472	0.26
473	0.29
474	0.31
475	0.33
476	0.28
477	0.26
478	0.25
479	0.24
480	0.24
481	0.22
482	0.21
483	0.19
484	0.18
485	0.18
486	0.17
487	0.16
488	0.12
489	0.11
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.1
512	0.1
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.1
520	0.11
521	0.14
522	0.17
523	0.21
524	0.25
525	0.27
526	0.3
527	0.3
528	0.37
529	0.37
530	0.35
531	0.35
532	0.36
533	0.37
534	0.36
535	0.37
536	0.37
537	0.44
538	0.46
539	0.47
540	0.49
541	0.54
542	0.62
543	0.66
544	0.7
545	0.72
546	0.8
547	0.87
548	0.91
549	0.93
550	0.93
551	0.93
552	0.93
553	0.93
554	0.93
555	0.93
556	0.92
557	0.9
558	0.88
559	0.85
560	0.81
561	0.75
562	0.72
563	0.71
564	0.71
565	0.69
566	0.72
567	0.72
568	0.74
569	0.78
570	0.75
571	0.73
572	0.68
573	0.71
574	0.66
575	0.64
576	0.6
577	0.6
578	0.62
579	0.6
580	0.61
581	0.56
582	0.61
583	0.65
584	0.7
585	0.71
586	0.72
587	0.74
588	0.77
589	0.81
590	0.81
591	0.79
592	0.74
593	0.69
594	0.67
595	0.62
596	0.57
597	0.5
598	0.44
599	0.43
600	0.41
601	0.38
602	0.37
603	0.36
604	0.31
605	0.31
606	0.34
607	0.38
608	0.41
609	0.43
610	0.4
611	0.42
612	0.45
613	0.48
614	0.44
615	0.44
616	0.41
617	0.47
618	0.56
619	0.61
620	0.66
621	0.7
622	0.77
623	0.78
624	0.83
625	0.85
626	0.86
627	0.88

Q6FV06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer