Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2G666

Protein Details
Accession A0A0D2G666    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-159MLKTKPASKLKRAKPSKRDSSPSSHydrophilic
371-398LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-153KPASKLKRAKPSKR
177-205AKAKAKAPRKKSSNTSNEGEKAPTLKRKA
377-390KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MKAASTESSRDASKPSTQVLSLVSSFLAENGFHSAVKAFQKDLKRMKQSVEVLSVADSQDGVNLQEIVDNWNKQEALQSTQHSSDSTTSDSSEDAMSGSDSESGSASSSEESDAVKSSEDTSPSESESDSGTDEDMLKTKPASKLKRAKPSKRDSSPSSSSSVSSDSDADDEREIGAKAKAKAPRKKSSNTSNEGEKAPTLKRKARSSSPESTSSDSDSDSDSDDRPSKRAKIEANEDEDESSSSNVSSSSSEEDSGDAKDSSSEADEAESGAMSTDVSKGHVKLDNAADGLSDSSSGTVTGDVVEPDESSARQADATINRGKKQAVATKKAHEGARPTPLAQLSAQATADSHISNAYRSYDYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKGFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.34
4 0.33
5 0.33
6 0.32
7 0.31
8 0.25
9 0.22
10 0.18
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.08
16 0.09
17 0.13
18 0.14
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.18
23 0.23
24 0.24
25 0.22
26 0.27
27 0.35
28 0.44
29 0.53
30 0.58
31 0.61
32 0.63
33 0.64
34 0.67
35 0.65
36 0.61
37 0.55
38 0.46
39 0.38
40 0.36
41 0.34
42 0.25
43 0.19
44 0.14
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.14
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.21
59 0.21
60 0.19
61 0.26
62 0.23
63 0.24
64 0.28
65 0.3
66 0.3
67 0.32
68 0.33
69 0.27
70 0.26
71 0.23
72 0.2
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.13
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.15
127 0.21
128 0.29
129 0.35
130 0.43
131 0.52
132 0.6
133 0.7
134 0.76
135 0.8
136 0.81
137 0.85
138 0.85
139 0.82
140 0.81
141 0.75
142 0.73
143 0.69
144 0.6
145 0.53
146 0.44
147 0.37
148 0.31
149 0.27
150 0.19
151 0.15
152 0.13
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.13
165 0.15
166 0.2
167 0.26
168 0.34
169 0.41
170 0.48
171 0.55
172 0.57
173 0.62
174 0.64
175 0.68
176 0.68
177 0.65
178 0.6
179 0.55
180 0.51
181 0.46
182 0.39
183 0.29
184 0.24
185 0.22
186 0.25
187 0.26
188 0.29
189 0.34
190 0.4
191 0.44
192 0.48
193 0.53
194 0.54
195 0.57
196 0.55
197 0.54
198 0.5
199 0.47
200 0.41
201 0.35
202 0.28
203 0.21
204 0.18
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.21
215 0.24
216 0.25
217 0.3
218 0.31
219 0.32
220 0.4
221 0.43
222 0.45
223 0.42
224 0.4
225 0.35
226 0.31
227 0.26
228 0.18
229 0.13
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.14
269 0.18
270 0.18
271 0.21
272 0.23
273 0.23
274 0.22
275 0.21
276 0.17
277 0.14
278 0.14
279 0.09
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.14
303 0.16
304 0.21
305 0.28
306 0.3
307 0.32
308 0.34
309 0.34
310 0.33
311 0.37
312 0.4
313 0.42
314 0.47
315 0.5
316 0.53
317 0.59
318 0.6
319 0.55
320 0.5
321 0.47
322 0.45
323 0.48
324 0.44
325 0.39
326 0.38
327 0.36
328 0.34
329 0.28
330 0.27
331 0.21
332 0.21
333 0.21
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.21
348 0.22
349 0.25
350 0.3
351 0.33
352 0.32
353 0.33
354 0.33
355 0.3
356 0.28
357 0.29
358 0.29
359 0.31
360 0.32
361 0.34
362 0.38
363 0.38
364 0.43
365 0.47
366 0.52
367 0.55
368 0.64
369 0.71
370 0.76
371 0.85
372 0.87
373 0.9
374 0.91
375 0.9
376 0.9
377 0.88
378 0.86
379 0.84
380 0.78
381 0.67
382 0.56
383 0.49
384 0.4
385 0.33
386 0.25
387 0.17
388 0.14