Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNA5

Protein Details
Accession Q6FNA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-76EQEIKRAKRVQEEKIKRRERNKKSNAKSEIIRBasic
79-103AGFKLRASSTNKKTKNRQSDPPYTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-76KRAKRVQEEKIKRRERNKKSNAKSEIIR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10.5, cyto_mito 7, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
KEGG cgr:CAGL0K01485g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MIRAVLNFFRAGKPKLDGVTASTATKRSFTEIQDKDKSTFDAQLEQEIKRAKRVQEEKIKRRERNKKSNAKSEIIRDGAGFKLRASSTNKKTKNRQSDPPYTIEVDGPLRKIVPYYFTYNTYCKLRWRDRNLLDVFTNEFRDRPAEYYKKTIERGAVLLNDKPATLESIIKNGDLITHKVHRHEPPVTSRPIEIVFEDNDILVINKPSGIPVHPTGRYRFNTITKALEKERGYVVHPCNRLDRMTSGLMFLAKTSKGADKIGDQLKAREVEKEYLAKVVGEFPEGTTVVDKPLKLLEPRLTLNVVCEETDPDAKHARTIFERVSVSKDKQTSIVKCKPLTGRSHQIRVHLQHLGHPIANDPIYSSPEVWGDGKDYDEVIKRLDNVGKSYPAGTWQLPSSRSNGTMLTGELCPECETELYSDPGPNDIELYLHAFRYSTKEDTEQQWSYETKLPHWAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.38
4 0.33
5 0.31
6 0.35
7 0.33
8 0.32
9 0.29
10 0.3
11 0.29
12 0.3
13 0.27
14 0.26
15 0.29
16 0.32
17 0.4
18 0.43
19 0.51
20 0.57
21 0.59
22 0.55
23 0.52
24 0.51
25 0.43
26 0.43
27 0.36
28 0.35
29 0.32
30 0.39
31 0.4
32 0.36
33 0.38
34 0.4
35 0.39
36 0.4
37 0.45
38 0.41
39 0.48
40 0.55
41 0.61
42 0.65
43 0.75
44 0.76
45 0.81
46 0.87
47 0.85
48 0.88
49 0.89
50 0.89
51 0.89
52 0.9
53 0.9
54 0.89
55 0.91
56 0.87
57 0.82
58 0.76
59 0.72
60 0.68
61 0.59
62 0.5
63 0.4
64 0.35
65 0.32
66 0.31
67 0.24
68 0.17
69 0.2
70 0.2
71 0.25
72 0.31
73 0.38
74 0.44
75 0.54
76 0.63
77 0.66
78 0.76
79 0.81
80 0.84
81 0.81
82 0.82
83 0.81
84 0.83
85 0.79
86 0.72
87 0.65
88 0.56
89 0.5
90 0.4
91 0.33
92 0.27
93 0.25
94 0.22
95 0.19
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.17
102 0.22
103 0.24
104 0.27
105 0.3
106 0.31
107 0.34
108 0.34
109 0.32
110 0.33
111 0.41
112 0.47
113 0.54
114 0.61
115 0.67
116 0.66
117 0.74
118 0.69
119 0.62
120 0.53
121 0.45
122 0.39
123 0.31
124 0.31
125 0.21
126 0.19
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.25
132 0.28
133 0.3
134 0.37
135 0.41
136 0.44
137 0.45
138 0.44
139 0.37
140 0.32
141 0.31
142 0.27
143 0.25
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.1
153 0.14
154 0.12
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.14
160 0.16
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.21
165 0.22
166 0.25
167 0.31
168 0.31
169 0.34
170 0.36
171 0.36
172 0.38
173 0.42
174 0.42
175 0.38
176 0.35
177 0.31
178 0.28
179 0.25
180 0.18
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.12
199 0.17
200 0.2
201 0.22
202 0.24
203 0.31
204 0.31
205 0.32
206 0.33
207 0.33
208 0.33
209 0.33
210 0.35
211 0.3
212 0.32
213 0.29
214 0.31
215 0.27
216 0.26
217 0.26
218 0.22
219 0.22
220 0.25
221 0.28
222 0.28
223 0.3
224 0.29
225 0.3
226 0.31
227 0.29
228 0.24
229 0.21
230 0.18
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.19
248 0.22
249 0.25
250 0.23
251 0.23
252 0.25
253 0.27
254 0.26
255 0.23
256 0.22
257 0.21
258 0.23
259 0.24
260 0.21
261 0.19
262 0.19
263 0.15
264 0.13
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.13
280 0.16
281 0.16
282 0.2
283 0.21
284 0.23
285 0.25
286 0.26
287 0.25
288 0.22
289 0.23
290 0.21
291 0.17
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.21
300 0.2
301 0.23
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.26
306 0.25
307 0.24
308 0.26
309 0.24
310 0.29
311 0.32
312 0.32
313 0.33
314 0.34
315 0.3
316 0.35
317 0.41
318 0.42
319 0.47
320 0.52
321 0.52
322 0.51
323 0.56
324 0.56
325 0.55
326 0.55
327 0.53
328 0.56
329 0.56
330 0.64
331 0.6
332 0.6
333 0.61
334 0.57
335 0.53
336 0.47
337 0.41
338 0.38
339 0.41
340 0.37
341 0.31
342 0.27
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.17
347 0.14
348 0.13
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.18
364 0.18
365 0.17
366 0.19
367 0.19
368 0.23
369 0.27
370 0.26
371 0.26
372 0.29
373 0.3
374 0.29
375 0.29
376 0.25
377 0.24
378 0.25
379 0.22
380 0.2
381 0.22
382 0.25
383 0.27
384 0.28
385 0.28
386 0.27
387 0.28
388 0.27
389 0.24
390 0.22
391 0.2
392 0.2
393 0.19
394 0.16
395 0.16
396 0.14
397 0.15
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.12
403 0.14
404 0.17
405 0.18
406 0.19
407 0.21
408 0.2
409 0.22
410 0.21
411 0.18
412 0.17
413 0.13
414 0.13
415 0.11
416 0.17
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.16
422 0.22
423 0.26
424 0.24
425 0.26
426 0.3
427 0.35
428 0.4
429 0.48
430 0.43
431 0.39
432 0.4
433 0.38
434 0.37
435 0.39
436 0.35
437 0.29