Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FKM0

Protein Details
Accession Q6FKM0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MIRTVKPKNARAKRALEKRESKLVEHydrophilic
48-71DLSALKKPDIKRFNKKNDIHPFEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18PKNARAKRALEK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG cgr:CAGL0L10516g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTVKPKNARAKRALEKRESKLVENTKQALFVPGQTSNKLLHDVMVDLSALKKPDIKRFNKKNDIHPFEDPEPLEFFSEKNDASLLVLSTSSKKRKNNLTFVRTFGYKIYDMIELLIAENYKLLNDFRKRTFTVGLKPMFSFQGSAFETHPVYKQIKSLFLDFFRGQTTDLQDVAGLQHVISISIQGDFQEGEPLPNVLFRVYKLRTYKSEQGGKTLPRVELDEVGPRLDFKIGRVRTPSPEMEKEAHKRAKQLDVKTKKNVEIDTMGDKLGRIHMGKQDLNKLQTRKMKGLKSKFDQVDDDEEDYLNDSEEDLQGSMSEHEDTFGEDFVTADEIDENQPASKKQRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.86
3 0.85
4 0.84
5 0.8
6 0.82
7 0.75
8 0.69
9 0.68
10 0.68
11 0.65
12 0.63
13 0.61
14 0.51
15 0.5
16 0.46
17 0.4
18 0.31
19 0.27
20 0.24
21 0.26
22 0.28
23 0.28
24 0.29
25 0.28
26 0.28
27 0.28
28 0.24
29 0.19
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.16
41 0.2
42 0.3
43 0.4
44 0.48
45 0.57
46 0.67
47 0.77
48 0.82
49 0.83
50 0.84
51 0.85
52 0.83
53 0.77
54 0.71
55 0.67
56 0.58
57 0.58
58 0.48
59 0.39
60 0.34
61 0.29
62 0.27
63 0.2
64 0.18
65 0.16
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.1
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.13
78 0.2
79 0.27
80 0.32
81 0.37
82 0.44
83 0.55
84 0.63
85 0.69
86 0.72
87 0.73
88 0.69
89 0.67
90 0.63
91 0.53
92 0.45
93 0.35
94 0.29
95 0.21
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.14
113 0.19
114 0.24
115 0.27
116 0.32
117 0.33
118 0.35
119 0.4
120 0.36
121 0.38
122 0.41
123 0.4
124 0.36
125 0.35
126 0.34
127 0.29
128 0.25
129 0.19
130 0.11
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.23
146 0.24
147 0.23
148 0.22
149 0.25
150 0.22
151 0.22
152 0.18
153 0.17
154 0.15
155 0.14
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.06
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.14
190 0.15
191 0.21
192 0.24
193 0.28
194 0.32
195 0.38
196 0.45
197 0.46
198 0.52
199 0.47
200 0.48
201 0.49
202 0.46
203 0.44
204 0.39
205 0.32
206 0.25
207 0.27
208 0.23
209 0.21
210 0.2
211 0.21
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.14
217 0.15
218 0.13
219 0.11
220 0.2
221 0.21
222 0.24
223 0.29
224 0.31
225 0.33
226 0.38
227 0.4
228 0.36
229 0.38
230 0.39
231 0.37
232 0.42
233 0.43
234 0.48
235 0.51
236 0.46
237 0.48
238 0.48
239 0.55
240 0.55
241 0.59
242 0.6
243 0.62
244 0.68
245 0.7
246 0.71
247 0.66
248 0.63
249 0.55
250 0.48
251 0.41
252 0.38
253 0.33
254 0.29
255 0.25
256 0.2
257 0.2
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.13
262 0.16
263 0.21
264 0.27
265 0.3
266 0.33
267 0.4
268 0.41
269 0.45
270 0.48
271 0.46
272 0.48
273 0.53
274 0.55
275 0.55
276 0.58
277 0.62
278 0.66
279 0.73
280 0.74
281 0.73
282 0.77
283 0.72
284 0.67
285 0.62
286 0.55
287 0.52
288 0.46
289 0.41
290 0.32
291 0.28
292 0.25
293 0.24
294 0.21
295 0.14
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.16
328 0.2
329 0.28