Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FVX3

Protein Details
Accession Q6FVX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-310LDSAKRKKNKVSKPSSSASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-304LKRKSALDSAKRKKNKVSKP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0034243  P:regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cgr:CAGL0D04818g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSEVKDVPVAPVEEVEAPVEAPVEAALEPSVEAPVEAPVESTVEAGEPAPERTRKHIESDDDDEEVQAPVEEQVTIDSSEDPKSQRQILEDRLDRLLKKTSGRRQRADEHDLEQYLDEKILRLKDEMNIAAQMDIETLNKRIEEGENKSQDKKPLVAIQKVKLLPKVMSILSKANLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFAALDDLPIKTEHLKESGLGRVVIFYTKSKRVEPQLARLAEKLIAEWTRPIIGASDNYRDKRIMQLEFDSEKLKRKSALDSAKRKKNKVSKPSSSASKGSSAQTLYEQAAARRNRAAAPAQTTTDYKYAPVSNITSVPTNARTVGVGSSLNNNELYKKLSSRLAKPGKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.12
38 0.18
39 0.22
40 0.24
41 0.31
42 0.4
43 0.39
44 0.45
45 0.49
46 0.5
47 0.52
48 0.57
49 0.52
50 0.45
51 0.43
52 0.36
53 0.3
54 0.24
55 0.17
56 0.1
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.2
72 0.24
73 0.27
74 0.27
75 0.3
76 0.33
77 0.38
78 0.44
79 0.44
80 0.42
81 0.43
82 0.44
83 0.4
84 0.37
85 0.37
86 0.31
87 0.35
88 0.42
89 0.48
90 0.56
91 0.63
92 0.66
93 0.66
94 0.71
95 0.72
96 0.7
97 0.63
98 0.56
99 0.51
100 0.46
101 0.4
102 0.31
103 0.24
104 0.17
105 0.14
106 0.11
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.1
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.13
132 0.18
133 0.24
134 0.31
135 0.37
136 0.39
137 0.43
138 0.44
139 0.46
140 0.42
141 0.36
142 0.31
143 0.32
144 0.35
145 0.38
146 0.4
147 0.38
148 0.42
149 0.43
150 0.41
151 0.35
152 0.32
153 0.25
154 0.23
155 0.23
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.15
226 0.21
227 0.23
228 0.24
229 0.28
230 0.33
231 0.42
232 0.43
233 0.46
234 0.49
235 0.49
236 0.48
237 0.44
238 0.39
239 0.31
240 0.28
241 0.2
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.09
252 0.13
253 0.15
254 0.21
255 0.26
256 0.27
257 0.29
258 0.29
259 0.28
260 0.32
261 0.35
262 0.3
263 0.28
264 0.29
265 0.33
266 0.34
267 0.34
268 0.3
269 0.26
270 0.32
271 0.31
272 0.31
273 0.29
274 0.3
275 0.34
276 0.41
277 0.5
278 0.51
279 0.6
280 0.68
281 0.74
282 0.79
283 0.77
284 0.77
285 0.77
286 0.77
287 0.77
288 0.78
289 0.77
290 0.77
291 0.8
292 0.78
293 0.73
294 0.65
295 0.57
296 0.51
297 0.45
298 0.4
299 0.36
300 0.29
301 0.25
302 0.24
303 0.24
304 0.2
305 0.22
306 0.21
307 0.2
308 0.27
309 0.28
310 0.29
311 0.29
312 0.3
313 0.28
314 0.31
315 0.34
316 0.31
317 0.36
318 0.36
319 0.35
320 0.36
321 0.35
322 0.34
323 0.32
324 0.27
325 0.21
326 0.23
327 0.23
328 0.22
329 0.25
330 0.24
331 0.24
332 0.25
333 0.27
334 0.25
335 0.24
336 0.26
337 0.25
338 0.24
339 0.22
340 0.21
341 0.19
342 0.18
343 0.18
344 0.16
345 0.15
346 0.14
347 0.2
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.22
352 0.22
353 0.23
354 0.26
355 0.23
356 0.24
357 0.27
358 0.33
359 0.4
360 0.44
361 0.53
362 0.6