FuNGI

Q6FVU7

Protein Details

Accession

Q6FVU7

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-51	ASPFIKPDRMRRNFLRNRRNKNIMVKKNDPE	Hydrophilic
570-593	SEDSQSKKGSPKKQEGKSRQGTPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
312-324	GRAKRGGLRRKTR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0072542 F:protein phosphatase activator activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0051123 P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II GO:0001174 P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter
KEGG	cgr:CAGL0D05478g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSGRGIRTAGGRSGDGPSDASPFIKPDRMRRNFLRNRRNKNIMVKKNDPEDIESREKMMLMGGVEGVKQEEVKPDLSALKDKDNEVYNEFPLRAVSREALENMRTHLLKFQSKKRIQPTENFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKKNQDGSNAQNMTKPKTTPAALTDHPTASNAPAAPLVNSSATMPTGATPTGQVVASATPTPQVSLDEKPMGGPVNAVSASATPGPATTNGATPANGTTDPAQPTVPGATILEDAGPAEDPTKVGLVKYDGKEMDSADLAEEPTVDPMADVAPDGGGRAKRGGLRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRKLKAVADQRTADDEYNHSDNSENELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDEQVSEAEDTELFGEKKIDEEGERIKKALQKTELAALYSSDEDEINPYLSESDLEKEDEAEKEESEDSQSKKGSPKKQEGKSRQGTPSAHTVREQNIRVKSIKDCVIVLKGKPSLLTSFPAGAWNPNAVSLKRTADEVSIKKEPGSESPNKKIKVENGEIPLITEQDIINAMSGGKVNVKEFGKKIRKMFPGPENKKLMFVLVKKLCRKVDDEHMELKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.28
3	0.24
4	0.22
5	0.19
6	0.2
7	0.2
8	0.19
9	0.17
10	0.19
11	0.22
12	0.28
13	0.3
14	0.37
15	0.48
16	0.54
17	0.61
18	0.66
19	0.74
20	0.76
21	0.83
22	0.84
23	0.84
24	0.87
25	0.89
26	0.89
27	0.85
28	0.86
29	0.86
30	0.85
31	0.84
32	0.82
33	0.79
34	0.77
35	0.74
36	0.65
37	0.59
38	0.54
39	0.52
40	0.51
41	0.44
42	0.39
43	0.36
44	0.34
45	0.28
46	0.24
47	0.18
48	0.12
49	0.12
50	0.11
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.09
56	0.09
57	0.1
58	0.14
59	0.16
60	0.18
61	0.18
62	0.19
63	0.22
64	0.24
65	0.3
66	0.27
67	0.32
68	0.34
69	0.35
70	0.37
71	0.38
72	0.38
73	0.36
74	0.36
75	0.32
76	0.32
77	0.31
78	0.26
79	0.24
80	0.23
81	0.2
82	0.2
83	0.19
84	0.17
85	0.2
86	0.22
87	0.23
88	0.24
89	0.23
90	0.24
91	0.28
92	0.26
93	0.24
94	0.27
95	0.3
96	0.36
97	0.42
98	0.48
99	0.54
100	0.59
101	0.67
102	0.72
103	0.76
104	0.72
105	0.75
106	0.74
107	0.73
108	0.74
109	0.68
110	0.58
111	0.53
112	0.49
113	0.5
114	0.5
115	0.46
116	0.46
117	0.51
118	0.57
119	0.6
120	0.7
121	0.71
122	0.7
123	0.67
124	0.67
125	0.63
126	0.58
127	0.56
128	0.47
129	0.38
130	0.29
131	0.31
132	0.3
133	0.34
134	0.37
135	0.32
136	0.31
137	0.31
138	0.34
139	0.36
140	0.39
141	0.41
142	0.41
143	0.45
144	0.51
145	0.53
146	0.49
147	0.48
148	0.46
149	0.42
150	0.46
151	0.44
152	0.38
153	0.39
154	0.41
155	0.42
156	0.4
157	0.34
158	0.27
159	0.29
160	0.3
161	0.29
162	0.3
163	0.3
164	0.28
165	0.32
166	0.32
167	0.27
168	0.26
169	0.25
170	0.22
171	0.17
172	0.18
173	0.14
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.08
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.11
206	0.12
207	0.14
208	0.18
209	0.18
210	0.18
211	0.18
212	0.19
213	0.17
214	0.14
215	0.12
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.08
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.08
229	0.1
230	0.09
231	0.1
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.13
237	0.12
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.14
246	0.14
247	0.14
248	0.12
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.07
268	0.11
269	0.16
270	0.17
271	0.21
272	0.2
273	0.2
274	0.21
275	0.2
276	0.18
277	0.12
278	0.11
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.1
302	0.14
303	0.22
304	0.31
305	0.38
306	0.47
307	0.55
308	0.65
309	0.73
310	0.73
311	0.73
312	0.69
313	0.66
314	0.62
315	0.63
316	0.61
317	0.54
318	0.55
319	0.52
320	0.49
321	0.41
322	0.36
323	0.3
324	0.23
325	0.24
326	0.24
327	0.23
328	0.23
329	0.24
330	0.23
331	0.2
332	0.19
333	0.17
334	0.11
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.11
373	0.12
374	0.16
375	0.19
376	0.27
377	0.36
378	0.38
379	0.39
380	0.39
381	0.39
382	0.37
383	0.35
384	0.29
385	0.21
386	0.17
387	0.19
388	0.18
389	0.16
390	0.15
391	0.16
392	0.15
393	0.15
394	0.17
395	0.14
396	0.17
397	0.26
398	0.33
399	0.33
400	0.35
401	0.37
402	0.4
403	0.41
404	0.39
405	0.33
406	0.25
407	0.28
408	0.27
409	0.27
410	0.21
411	0.21
412	0.21
413	0.2
414	0.19
415	0.15
416	0.14
417	0.15
418	0.17
419	0.24
420	0.32
421	0.41
422	0.51
423	0.54
424	0.59
425	0.62
426	0.64
427	0.67
428	0.68
429	0.65
430	0.6
431	0.57
432	0.51
433	0.48
434	0.44
435	0.34
436	0.25
437	0.19
438	0.18
439	0.19
440	0.18
441	0.15
442	0.14
443	0.14
444	0.18
445	0.18
446	0.14
447	0.12
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.14
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.11
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.15
472	0.17
473	0.19
474	0.25
475	0.29
476	0.32
477	0.35
478	0.37
479	0.39
480	0.45
481	0.47
482	0.43
483	0.37
484	0.35
485	0.33
486	0.32
487	0.29
488	0.19
489	0.15
490	0.14
491	0.12
492	0.12
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.11
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.12
511	0.1
512	0.13
513	0.22
514	0.28
515	0.29
516	0.28
517	0.3
518	0.33
519	0.36
520	0.4
521	0.35
522	0.31
523	0.33
524	0.39
525	0.37
526	0.33
527	0.3
528	0.22
529	0.2
530	0.17
531	0.15
532	0.1
533	0.08
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.12
547	0.12
548	0.13
549	0.15
550	0.14
551	0.17
552	0.16
553	0.14
554	0.15
555	0.16
556	0.15
557	0.17
558	0.22
559	0.21
560	0.24
561	0.26
562	0.27
563	0.35
564	0.43
565	0.48
566	0.52
567	0.61
568	0.66
569	0.74
570	0.82
571	0.83
572	0.85
573	0.84
574	0.83
575	0.76
576	0.74
577	0.66
578	0.58
579	0.6
580	0.54
581	0.47
582	0.4
583	0.4
584	0.39
585	0.45
586	0.46
587	0.43
588	0.43
589	0.46
590	0.46
591	0.46
592	0.43
593	0.41
594	0.42
595	0.36
596	0.33
597	0.31
598	0.37
599	0.37
600	0.35
601	0.35
602	0.32
603	0.31
604	0.3
605	0.3
606	0.26
607	0.24
608	0.26
609	0.21
610	0.21
611	0.21
612	0.23
613	0.21
614	0.21
615	0.2
616	0.2
617	0.17
618	0.2
619	0.23
620	0.2
621	0.22
622	0.23
623	0.25
624	0.24
625	0.25
626	0.22
627	0.23
628	0.31
629	0.33
630	0.36
631	0.37
632	0.37
633	0.36
634	0.38
635	0.36
636	0.34
637	0.38
638	0.41
639	0.45
640	0.54
641	0.62
642	0.61
643	0.61
644	0.6
645	0.6
646	0.6
647	0.58
648	0.55
649	0.52
650	0.53
651	0.51
652	0.47
653	0.4
654	0.31
655	0.25
656	0.18
657	0.13
658	0.11
659	0.13
660	0.11
661	0.1
662	0.1
663	0.09
664	0.09
665	0.1
666	0.09
667	0.12
668	0.14
669	0.15
670	0.21
671	0.24
672	0.29
673	0.32
674	0.42
675	0.48
676	0.53
677	0.59
678	0.62
679	0.68
680	0.68
681	0.73
682	0.73
683	0.75
684	0.75
685	0.77
686	0.76
687	0.68
688	0.64
689	0.56
690	0.51
691	0.47
692	0.43
693	0.45
694	0.45
695	0.53
696	0.56
697	0.63
698	0.62
699	0.58
700	0.59
701	0.55
702	0.58
703	0.58
704	0.57

Q6FVU7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer