Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FMS7

Protein Details
Accession Q6FMS7    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-99AILEKQRIREKRKKENERLKEQQLEHydrophilic
166-190VPEVKEQIKKRKKNALKQLCKTTMNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-92QRIREKRKKENER
175-177KRK
220-230KWLKRRSLNRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cgr:CAGL0K05555g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
Amino Acid Sequences MTVSTRSKEHIKFDDNDETAHTETETQESVKSLRSKSVDVSDSDSDSDDDAPEEEGLGNAKDEVEDQIKKQEQAAILEKQRIREKRKKENERLKEQQLEKKMRTEEMQKQIAELEKLQSQTVESDEEELQELPEDLLAKINNVDPTAGQTIPKHINFNDIDTQDFVPEVKEQIKKRKKNALKQLCKTTMNKGVVKVSVLSSNLSKSAPKKEGNVTNLRNKWLKRRSLNRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.52
3 0.48
4 0.43
5 0.38
6 0.33
7 0.3
8 0.24
9 0.15
10 0.16
11 0.17
12 0.16
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.2
18 0.25
19 0.24
20 0.29
21 0.31
22 0.32
23 0.34
24 0.4
25 0.36
26 0.33
27 0.37
28 0.32
29 0.31
30 0.29
31 0.26
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.09
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.22
55 0.24
56 0.24
57 0.25
58 0.25
59 0.22
60 0.26
61 0.3
62 0.27
63 0.28
64 0.34
65 0.34
66 0.36
67 0.42
68 0.45
69 0.49
70 0.52
71 0.59
72 0.64
73 0.74
74 0.8
75 0.83
76 0.86
77 0.87
78 0.88
79 0.85
80 0.8
81 0.77
82 0.71
83 0.66
84 0.64
85 0.61
86 0.53
87 0.51
88 0.46
89 0.4
90 0.38
91 0.39
92 0.38
93 0.39
94 0.42
95 0.37
96 0.36
97 0.35
98 0.34
99 0.28
100 0.19
101 0.14
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.11
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.17
138 0.22
139 0.24
140 0.23
141 0.2
142 0.27
143 0.26
144 0.3
145 0.31
146 0.26
147 0.26
148 0.25
149 0.25
150 0.19
151 0.18
152 0.14
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.14
157 0.21
158 0.26
159 0.37
160 0.47
161 0.54
162 0.62
163 0.71
164 0.74
165 0.79
166 0.85
167 0.85
168 0.86
169 0.86
170 0.88
171 0.83
172 0.79
173 0.71
174 0.68
175 0.65
176 0.61
177 0.55
178 0.48
179 0.45
180 0.41
181 0.4
182 0.33
183 0.26
184 0.23
185 0.21
186 0.2
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.3
194 0.35
195 0.37
196 0.41
197 0.48
198 0.56
199 0.59
200 0.64
201 0.62
202 0.66
203 0.66
204 0.67
205 0.65
206 0.61
207 0.65
208 0.64
209 0.67
210 0.68