Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FRD8

Protein Details
Accession Q6FRD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-376KGYPQVVPEKTKKVKKPKNKGTRYPGATKTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-367KTKKVKKPKNKGT
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 12.833, nucl 9, mito_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG cgr:CAGL0H09372g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MDAEEQYEWITKNLQEVLNPQIIKDVLKEGRPLKLYWGTAPTGRPHCGYFVAMTKLAHFLKAGVEVTVLLADLHAFLDNMKAPLEVVNYRTKYYEYTVKAILKSINVPIEKLKFVVGSSYQLGGDYTLDLFKLSNMVSQNDAKRAGADVVKQVANPLLSGLIYPLMQALDEQFLDVDVQFGGVDQRKIFVLAEENLPRIGYKKRAHLMNPMVPGLTQGGKMSASDPNSKIDLLEEPKKVGKKINSAYCSPGDIENNGLLSFVEYVIEPIQELKKGTGKFEFFINRPEKFGGPVTYTSFKDLQTAFKEQQLMPVDLKIGVTDAINELLAPIREEFANSKEYQEAEAKGYPQVVPEKTKKVKKPKNKGTRYPGATKTEEPKVEAVTEELKEASI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.27
4 0.32
5 0.35
6 0.34
7 0.29
8 0.28
9 0.28
10 0.27
11 0.25
12 0.28
13 0.25
14 0.28
15 0.34
16 0.33
17 0.39
18 0.41
19 0.39
20 0.38
21 0.41
22 0.41
23 0.38
24 0.4
25 0.35
26 0.36
27 0.39
28 0.39
29 0.38
30 0.38
31 0.36
32 0.33
33 0.33
34 0.32
35 0.3
36 0.25
37 0.25
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.24
42 0.28
43 0.27
44 0.25
45 0.19
46 0.16
47 0.16
48 0.19
49 0.18
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.09
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.15
72 0.14
73 0.16
74 0.24
75 0.25
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.25
80 0.28
81 0.33
82 0.27
83 0.3
84 0.34
85 0.36
86 0.36
87 0.36
88 0.33
89 0.26
90 0.25
91 0.25
92 0.25
93 0.22
94 0.23
95 0.25
96 0.26
97 0.25
98 0.23
99 0.21
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.07
120 0.06
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.09
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.03
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.18
188 0.2
189 0.27
190 0.31
191 0.35
192 0.37
193 0.43
194 0.46
195 0.43
196 0.42
197 0.35
198 0.31
199 0.27
200 0.26
201 0.19
202 0.13
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.23
221 0.21
222 0.22
223 0.26
224 0.28
225 0.28
226 0.3
227 0.3
228 0.33
229 0.39
230 0.46
231 0.46
232 0.46
233 0.48
234 0.43
235 0.39
236 0.32
237 0.27
238 0.19
239 0.16
240 0.16
241 0.13
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.18
261 0.19
262 0.21
263 0.25
264 0.25
265 0.24
266 0.29
267 0.32
268 0.27
269 0.36
270 0.38
271 0.33
272 0.34
273 0.36
274 0.31
275 0.28
276 0.31
277 0.25
278 0.23
279 0.24
280 0.26
281 0.28
282 0.28
283 0.3
284 0.28
285 0.25
286 0.27
287 0.25
288 0.27
289 0.27
290 0.33
291 0.31
292 0.32
293 0.36
294 0.31
295 0.38
296 0.36
297 0.34
298 0.28
299 0.28
300 0.25
301 0.22
302 0.22
303 0.14
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.19
323 0.18
324 0.2
325 0.21
326 0.22
327 0.23
328 0.25
329 0.25
330 0.24
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.26
335 0.23
336 0.23
337 0.28
338 0.27
339 0.32
340 0.38
341 0.46
342 0.54
343 0.63
344 0.69
345 0.74
346 0.8
347 0.84
348 0.89
349 0.9
350 0.92
351 0.93
352 0.94
353 0.92
354 0.92
355 0.88
356 0.86
357 0.82
358 0.78
359 0.72
360 0.67
361 0.64
362 0.62
363 0.57
364 0.51
365 0.45
366 0.41
367 0.37
368 0.32
369 0.29
370 0.25
371 0.24
372 0.22