Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2HN30

Protein Details
Accession A0A0D2HN30    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32ATDQPLKKSKQSKSTDKGDASHydrophilic
55-77SDNAAVTKSKKSRKRASDFMDDGHydrophilic
95-122TEEAAEPAKKKSKKNKKDKTSNNGETLTHydrophilic
211-235TTPPLPKYKKTQKKLEKEKAKGNDDHydrophilic
350-376EEQWQKKIDKEQRKRDKKAKKMKAIGLBasic
425-466PAVEEGKKSKKDKKDKKDKTEKKEKKEKKEKKSKAGKETDADBasic
572-605SSPAGGNKLKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-112AKKKSKKNKKD
220-227KTQKKLEK
329-372KKYRKIPHEKLERERLAAPKTEEQWQKKIDKEQRKRDKKAKKMK
430-461GKKSKKDKKDKKDKTEKKEKKEKKEKKSKAGK
503-518KAEKKALKKAKKAAKE
576-662GGNKLKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNLVSTKPKPDPNATGKIPGLPLLGKAKYDKAARQAHKELKKKLLAERAAKGGRGRGRAG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGTKKRKESSGATDQPLKKSKQSKSTDKGDASKAELKDNESIEVPSDHKQKTLQSDNAAVTKSKKSRKRASDFMDDGEAPVPADTANEVEGQNGTEEAAEPAKKKSKKNKKDKTSNNGETLTADGVNGVIEHTGAEILETATLHKPVSTSMQAEAERTVDHEFEEGFGGFASEDEQEDAGEVEADDNAAALLAGFDSDTEDKQDEGFDFGTTPPLPKYKKTQKKLEKEKAKGNDDGPGTVYVGRIPHGFYEKEMRAYFSQFGDITRLRLSRNKRTGASKHFAFIEFASNEVAKIVAETMDNYLMFGHILKCKYAEPGSLHPDVWKGADKKYRKIPHEKLERERLAAPKTEEQWQKKIDKEQRKRDKKAKKMKAIGLDMPSSTLTAPSAALSQKLAGQAELKQIENGENGPSPALEAPSDLAKDTPAVEEGKKSKKDKKDKKDKTEKKEKKEKKEKKSKAGKETDADIALTSTSADLPTEGEAQGTSTDVTDNHAETVSKEMSKAEKKALKKAKKAAKEPTTAAKPAEVQEEAEESAHVPAEDGVAATKEELSADFISFGQFDEGEAKPEAGSSPAGGNKLKPWKVKKPKKERKNLVKARGPKSNLVSTKPKPDPNATGKIPGLPLLGKAKYDKAARQAHKELKKKLLAERAAKGGRGRGRAGTQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.69
3 0.69
4 0.64
5 0.61
6 0.63
7 0.66
8 0.67
9 0.72
10 0.74
11 0.75
12 0.8
13 0.81
14 0.77
15 0.75
16 0.71
17 0.64
18 0.6
19 0.59
20 0.51
21 0.49
22 0.45
23 0.42
24 0.42
25 0.4
26 0.35
27 0.29
28 0.29
29 0.24
30 0.24
31 0.23
32 0.25
33 0.32
34 0.3
35 0.31
36 0.34
37 0.38
38 0.45
39 0.51
40 0.49
41 0.46
42 0.51
43 0.52
44 0.52
45 0.48
46 0.4
47 0.35
48 0.39
49 0.43
50 0.47
51 0.52
52 0.59
53 0.68
54 0.77
55 0.82
56 0.83
57 0.81
58 0.82
59 0.77
60 0.69
61 0.64
62 0.53
63 0.45
64 0.35
65 0.28
66 0.18
67 0.15
68 0.12
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.21
89 0.3
90 0.36
91 0.45
92 0.54
93 0.62
94 0.71
95 0.81
96 0.86
97 0.88
98 0.93
99 0.94
100 0.94
101 0.93
102 0.9
103 0.84
104 0.75
105 0.64
106 0.53
107 0.44
108 0.35
109 0.24
110 0.16
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.18
138 0.23
139 0.23
140 0.24
141 0.23
142 0.19
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.12
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.33
205 0.41
206 0.51
207 0.58
208 0.67
209 0.71
210 0.8
211 0.88
212 0.89
213 0.88
214 0.83
215 0.84
216 0.82
217 0.76
218 0.68
219 0.58
220 0.53
221 0.43
222 0.38
223 0.3
224 0.22
225 0.19
226 0.15
227 0.15
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.2
238 0.21
239 0.25
240 0.24
241 0.25
242 0.23
243 0.25
244 0.26
245 0.19
246 0.2
247 0.15
248 0.15
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.23
256 0.3
257 0.35
258 0.42
259 0.45
260 0.46
261 0.52
262 0.58
263 0.6
264 0.59
265 0.49
266 0.44
267 0.4
268 0.38
269 0.31
270 0.24
271 0.21
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.2
304 0.25
305 0.25
306 0.25
307 0.22
308 0.22
309 0.19
310 0.17
311 0.18
312 0.15
313 0.19
314 0.26
315 0.28
316 0.33
317 0.42
318 0.48
319 0.48
320 0.57
321 0.59
322 0.62
323 0.7
324 0.71
325 0.68
326 0.7
327 0.65
328 0.58
329 0.53
330 0.48
331 0.39
332 0.35
333 0.32
334 0.26
335 0.27
336 0.32
337 0.36
338 0.35
339 0.39
340 0.41
341 0.41
342 0.41
343 0.48
344 0.5
345 0.54
346 0.61
347 0.67
348 0.73
349 0.8
350 0.85
351 0.85
352 0.86
353 0.86
354 0.87
355 0.86
356 0.85
357 0.82
358 0.79
359 0.77
360 0.7
361 0.64
362 0.55
363 0.46
364 0.36
365 0.29
366 0.24
367 0.16
368 0.12
369 0.09
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.11
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.15
416 0.2
417 0.28
418 0.34
419 0.39
420 0.46
421 0.54
422 0.65
423 0.71
424 0.77
425 0.81
426 0.84
427 0.9
428 0.93
429 0.93
430 0.92
431 0.93
432 0.91
433 0.9
434 0.9
435 0.89
436 0.88
437 0.9
438 0.9
439 0.9
440 0.92
441 0.91
442 0.9
443 0.92
444 0.9
445 0.89
446 0.87
447 0.81
448 0.72
449 0.66
450 0.58
451 0.47
452 0.38
453 0.28
454 0.19
455 0.14
456 0.11
457 0.08
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.14
487 0.16
488 0.22
489 0.28
490 0.3
491 0.33
492 0.38
493 0.41
494 0.51
495 0.59
496 0.61
497 0.64
498 0.71
499 0.72
500 0.75
501 0.79
502 0.8
503 0.77
504 0.73
505 0.68
506 0.68
507 0.64
508 0.56
509 0.49
510 0.41
511 0.35
512 0.31
513 0.32
514 0.23
515 0.18
516 0.18
517 0.19
518 0.18
519 0.15
520 0.14
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.11
550 0.12
551 0.14
552 0.15
553 0.15
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.11
558 0.11
559 0.09
560 0.13
561 0.15
562 0.18
563 0.19
564 0.2
565 0.26
566 0.35
567 0.41
568 0.45
569 0.52
570 0.6
571 0.71
572 0.8
573 0.84
574 0.85
575 0.9
576 0.92
577 0.95
578 0.95
579 0.95
580 0.96
581 0.95
582 0.93
583 0.92
584 0.91
585 0.86
586 0.85
587 0.77
588 0.73
589 0.69
590 0.68
591 0.63
592 0.6
593 0.62
594 0.58
595 0.64
596 0.64
597 0.64
598 0.6
599 0.63
600 0.66
601 0.64
602 0.68
603 0.6
604 0.59
605 0.54
606 0.51
607 0.45
608 0.37
609 0.32
610 0.23
611 0.25
612 0.25
613 0.26
614 0.25
615 0.27
616 0.3
617 0.34
618 0.39
619 0.4
620 0.43
621 0.52
622 0.56
623 0.62
624 0.67
625 0.71
626 0.75
627 0.79
628 0.78
629 0.77
630 0.78
631 0.74
632 0.72
633 0.72
634 0.71
635 0.7
636 0.67
637 0.67
638 0.62
639 0.6
640 0.55
641 0.53
642 0.51
643 0.49
644 0.47
645 0.43