Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FJZ3

Protein Details
Accession Q6FJZ3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-34KVNERPAQYKQSSRKGKKAWRKNIDLTDIEHydrophilic
68-92DIDLKKALIKRKQIKKNLKSKEILDHydrophilic
301-335LSINPVVKNKKKTKYQKNKAKRHEEKVKMHKEIKEBasic
351-383QEVEKRHEEKDKKVKKEKKNKKGKLGTKYHILNBasic
418-447SGKVEARIPRTKGRRYKQKITEKWTYKDFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-24RKGKKAW
73-88KALIKRKQIKKNLKSK
308-335KNKKKTKYQKNKAKRHEEKVKMHKEIKE
355-375KRHEEKDKKVKKEKKNKKGKL
426-432PRTKGRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG cgr:CAGL0M02409g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MAPLKVNERPAQYKQSSRKGKKAWRKNIDLTDIEKSIETQKDLEITHGTSDLASLQDTALFQVDEEGDIDLKKALIKRKQIKKNLKSKEILDSIKTASKIKSVIHPRHQEHQTKEGGKVQGVSKKELKKLLSLAGKIQGESKLKNRSDKDGLVKSAAADLWNEEESNKVKLPSGIEFKKKRDEIPEELIKYSTTSWSIAEVKPKTLEHKPVKVAEYEDLPHAGKSYNPDSKHWNSLISKEYESEKKREDARNKIQEYQAKIQRLMEVLDDKEEESSSEEDEEDEEDETEETTESTDVTLGLSINPVVKNKKKTKYQKNKAKRHEEKVKMHKEIKELKQQIKELEKIEEIEQEVEKRHEEKDKKVKKEKKNKKGKLGTKYHILNEGLEVKFKDELSDSLRKVRPEGSLLYDTVRKLQSSGKVEARIPRTKGRRYKQKITEKWTYKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.72
3 0.76
4 0.77
5 0.81
6 0.82
7 0.86
8 0.87
9 0.89
10 0.9
11 0.88
12 0.89
13 0.89
14 0.87
15 0.83
16 0.76
17 0.7
18 0.64
19 0.55
20 0.47
21 0.37
22 0.31
23 0.3
24 0.29
25 0.26
26 0.22
27 0.22
28 0.25
29 0.25
30 0.26
31 0.22
32 0.2
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.14
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.11
60 0.15
61 0.23
62 0.3
63 0.4
64 0.5
65 0.6
66 0.7
67 0.78
68 0.84
69 0.86
70 0.89
71 0.89
72 0.87
73 0.81
74 0.74
75 0.73
76 0.69
77 0.61
78 0.53
79 0.46
80 0.4
81 0.39
82 0.37
83 0.31
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.24
88 0.3
89 0.37
90 0.44
91 0.51
92 0.6
93 0.6
94 0.67
95 0.73
96 0.72
97 0.67
98 0.65
99 0.63
100 0.56
101 0.55
102 0.52
103 0.46
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.32
108 0.32
109 0.34
110 0.35
111 0.39
112 0.43
113 0.45
114 0.42
115 0.41
116 0.42
117 0.44
118 0.42
119 0.37
120 0.35
121 0.35
122 0.34
123 0.3
124 0.3
125 0.28
126 0.25
127 0.27
128 0.31
129 0.34
130 0.36
131 0.44
132 0.44
133 0.46
134 0.49
135 0.51
136 0.52
137 0.48
138 0.47
139 0.4
140 0.38
141 0.31
142 0.27
143 0.22
144 0.15
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.2
160 0.26
161 0.29
162 0.37
163 0.41
164 0.44
165 0.51
166 0.5
167 0.48
168 0.48
169 0.49
170 0.46
171 0.49
172 0.52
173 0.45
174 0.44
175 0.41
176 0.33
177 0.28
178 0.22
179 0.16
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.15
185 0.15
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.24
190 0.24
191 0.25
192 0.26
193 0.35
194 0.33
195 0.38
196 0.41
197 0.42
198 0.42
199 0.39
200 0.36
201 0.27
202 0.24
203 0.19
204 0.16
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.11
212 0.16
213 0.2
214 0.22
215 0.23
216 0.3
217 0.33
218 0.37
219 0.34
220 0.33
221 0.28
222 0.3
223 0.33
224 0.28
225 0.25
226 0.22
227 0.25
228 0.27
229 0.29
230 0.29
231 0.28
232 0.3
233 0.36
234 0.43
235 0.47
236 0.5
237 0.58
238 0.64
239 0.64
240 0.63
241 0.61
242 0.57
243 0.56
244 0.54
245 0.49
246 0.42
247 0.4
248 0.37
249 0.34
250 0.31
251 0.25
252 0.19
253 0.16
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.1
292 0.13
293 0.19
294 0.25
295 0.35
296 0.44
297 0.52
298 0.6
299 0.7
300 0.78
301 0.83
302 0.88
303 0.89
304 0.91
305 0.93
306 0.93
307 0.94
308 0.92
309 0.91
310 0.9
311 0.89
312 0.88
313 0.88
314 0.87
315 0.84
316 0.8
317 0.74
318 0.71
319 0.71
320 0.68
321 0.68
322 0.66
323 0.65
324 0.66
325 0.65
326 0.63
327 0.59
328 0.56
329 0.47
330 0.44
331 0.38
332 0.33
333 0.32
334 0.28
335 0.23
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.19
340 0.19
341 0.2
342 0.19
343 0.22
344 0.29
345 0.33
346 0.42
347 0.5
348 0.58
349 0.66
350 0.75
351 0.82
352 0.83
353 0.9
354 0.91
355 0.9
356 0.92
357 0.92
358 0.92
359 0.93
360 0.91
361 0.9
362 0.89
363 0.83
364 0.81
365 0.76
366 0.67
367 0.63
368 0.55
369 0.45
370 0.39
371 0.41
372 0.32
373 0.3
374 0.28
375 0.23
376 0.25
377 0.24
378 0.22
379 0.16
380 0.19
381 0.23
382 0.31
383 0.31
384 0.38
385 0.41
386 0.41
387 0.42
388 0.43
389 0.4
390 0.36
391 0.37
392 0.35
393 0.34
394 0.34
395 0.35
396 0.35
397 0.31
398 0.33
399 0.32
400 0.25
401 0.24
402 0.29
403 0.34
404 0.37
405 0.43
406 0.44
407 0.46
408 0.5
409 0.56
410 0.58
411 0.57
412 0.56
413 0.59
414 0.62
415 0.68
416 0.74
417 0.77
418 0.81
419 0.82
420 0.88
421 0.89
422 0.91
423 0.9
424 0.88
425 0.88
426 0.85
427 0.82