Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FJF5

Protein Details
Accession Q6FJF5    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33MEVQKRLTSKDVPRKDKRRVNLENRVGKIQHydrophilic
304-329GKDGNKSSSDKKKPRGTQRYSMKTAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0043709  P:cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0061188  P:negative regulation of rDNA heterochromatin formation  
GO:0061186  P:negative regulation of silent mating-type cassette heterochromatin formation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0061408  P:positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress  
GO:2000217  P:regulation of invasive growth in response to glucose limitation  
KEGG cgr:CAGL0M06699g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MEEMEVQKRLTSKDVPRKDKRRVNLENRVGKIQQSFILERDSYYRDRLTSLQTDLTSLHQGNNELFMRKLRDLEEARDLELVRLRLYEEYRVYRSGIEFQEEIEKTKEDHERLVKICKERLYQNIEMKTKKLQEERLLMDVANIHTYSMDYDRPHYQKNTRSHTASGWESSSNDFGRDTANESATDTGLSGFGNERRSLRRRVVLGREGSGLEGGNGGNATSGYTSGGINGDGYNYGKSYNTEDSDGGRYGANPYASPSGRGSQRQNNSGGYRTDMNSDTEFLQSIGDSSELYNLLFGDKNVGGKDGNKSSSDKKKPRGTQRYSMKTAPPLQSLKTEEVSEDIALIRELTGQPPAPFKVDKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.75
4 0.83
5 0.88
6 0.88
7 0.87
8 0.87
9 0.87
10 0.87
11 0.87
12 0.88
13 0.86
14 0.81
15 0.77
16 0.67
17 0.6
18 0.52
19 0.44
20 0.37
21 0.34
22 0.32
23 0.28
24 0.32
25 0.29
26 0.27
27 0.29
28 0.29
29 0.26
30 0.29
31 0.29
32 0.25
33 0.28
34 0.29
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.31
39 0.29
40 0.29
41 0.27
42 0.27
43 0.26
44 0.22
45 0.22
46 0.19
47 0.21
48 0.2
49 0.25
50 0.24
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.26
55 0.26
56 0.28
57 0.23
58 0.3
59 0.31
60 0.35
61 0.39
62 0.35
63 0.35
64 0.34
65 0.33
66 0.26
67 0.27
68 0.24
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.18
74 0.21
75 0.22
76 0.26
77 0.28
78 0.29
79 0.29
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.25
84 0.23
85 0.21
86 0.2
87 0.27
88 0.26
89 0.27
90 0.22
91 0.22
92 0.19
93 0.25
94 0.3
95 0.23
96 0.29
97 0.32
98 0.35
99 0.37
100 0.44
101 0.43
102 0.41
103 0.44
104 0.43
105 0.41
106 0.4
107 0.45
108 0.44
109 0.46
110 0.49
111 0.52
112 0.53
113 0.5
114 0.48
115 0.46
116 0.43
117 0.42
118 0.41
119 0.39
120 0.4
121 0.45
122 0.46
123 0.43
124 0.38
125 0.32
126 0.28
127 0.24
128 0.18
129 0.13
130 0.1
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.1
138 0.13
139 0.2
140 0.22
141 0.26
142 0.29
143 0.33
144 0.39
145 0.47
146 0.52
147 0.5
148 0.5
149 0.48
150 0.45
151 0.43
152 0.36
153 0.29
154 0.23
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.13
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.08
180 0.1
181 0.11
182 0.13
183 0.19
184 0.23
185 0.28
186 0.31
187 0.33
188 0.35
189 0.41
190 0.46
191 0.46
192 0.44
193 0.4
194 0.37
195 0.32
196 0.28
197 0.22
198 0.15
199 0.09
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.13
227 0.16
228 0.17
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.23
233 0.22
234 0.18
235 0.15
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.14
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.19
244 0.21
245 0.21
246 0.23
247 0.27
248 0.32
249 0.36
250 0.39
251 0.45
252 0.47
253 0.48
254 0.48
255 0.46
256 0.45
257 0.39
258 0.34
259 0.3
260 0.27
261 0.27
262 0.24
263 0.24
264 0.21
265 0.22
266 0.2
267 0.17
268 0.17
269 0.13
270 0.12
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.18
292 0.25
293 0.26
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.39
298 0.49
299 0.57
300 0.6
301 0.63
302 0.71
303 0.79
304 0.86
305 0.88
306 0.86
307 0.85
308 0.87
309 0.87
310 0.82
311 0.78
312 0.72
313 0.69
314 0.68
315 0.63
316 0.59
317 0.53
318 0.49
319 0.5
320 0.5
321 0.46
322 0.41
323 0.36
324 0.3
325 0.29
326 0.28
327 0.22
328 0.18
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.16
338 0.18
339 0.2
340 0.25
341 0.27
342 0.28