Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2H3Y3

Protein Details
Accession A0A0D2H3Y3    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-400AARERERARRERRQENERQLRQSRBasic
561-582QAEDRDRDERERQRKRARVDDDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-238EPPKFKHKKIPRGPPSPPP
340-343KKAR
383-388RARRER
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATGLFASLPKPKYTGEHEEVPIHAQPRGPRIVGPGVIDESQIVLKRSGPPPYGQRSGWRPRSAEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTASTSNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHSEGRIIHSSFKDLIPLRQRADAGDLSLDRPSAEEAQATAERTKLALEKLVSGAVAAQKPKNVKGVNREEPTYVRYTPANQMGDNSKKNDRIFKIVKKQEDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVRLRAQMQQKLAEKEKLAKEEHLREMAKKAREERQRATETHTKRSRSRSYSGSSYDSRSDSEDEAARERERARRERRQENERQLRQSRMGAEKRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQNQETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDQHYDKPLFAAHDAINSIYRPSAGNQDDEEYGEEAAESAMGKISKSNRFEVLGKAKEGFKGADVAEREAGPVQFEKDKDDPFGIDSLIGEASARAGGEGKKRYGLEQAEDRDRDERERQRKRARVDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.42
4 0.47
5 0.48
6 0.49
7 0.48
8 0.46
9 0.42
10 0.34
11 0.3
12 0.26
13 0.27
14 0.32
15 0.36
16 0.33
17 0.3
18 0.34
19 0.38
20 0.37
21 0.35
22 0.31
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.21
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.17
33 0.25
34 0.29
35 0.35
36 0.34
37 0.38
38 0.45
39 0.52
40 0.55
41 0.49
42 0.52
43 0.55
44 0.63
45 0.67
46 0.64
47 0.58
48 0.55
49 0.62
50 0.57
51 0.5
52 0.42
53 0.34
54 0.28
55 0.27
56 0.24
57 0.17
58 0.14
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.2
84 0.18
85 0.13
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.13
97 0.15
98 0.2
99 0.25
100 0.26
101 0.29
102 0.3
103 0.31
104 0.28
105 0.29
106 0.24
107 0.22
108 0.26
109 0.23
110 0.26
111 0.26
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.27
116 0.24
117 0.31
118 0.34
119 0.38
120 0.37
121 0.38
122 0.38
123 0.33
124 0.36
125 0.3
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.16
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.29
165 0.29
166 0.31
167 0.38
168 0.47
169 0.53
170 0.54
171 0.53
172 0.47
173 0.46
174 0.45
175 0.39
176 0.29
177 0.22
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.26
185 0.31
186 0.37
187 0.37
188 0.36
189 0.33
190 0.37
191 0.39
192 0.45
193 0.41
194 0.43
195 0.48
196 0.53
197 0.58
198 0.59
199 0.63
200 0.58
201 0.6
202 0.57
203 0.55
204 0.52
205 0.51
206 0.54
207 0.5
208 0.48
209 0.55
210 0.56
211 0.52
212 0.56
213 0.57
214 0.58
215 0.66
216 0.76
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.65
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.5
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.48
232 0.51
233 0.46
234 0.43
235 0.42
236 0.41
237 0.4
238 0.36
239 0.34
240 0.33
241 0.32
242 0.31
243 0.28
244 0.22
245 0.16
246 0.18
247 0.19
248 0.28
249 0.3
250 0.38
251 0.43
252 0.47
253 0.52
254 0.49
255 0.5
256 0.42
257 0.41
258 0.38
259 0.4
260 0.38
261 0.38
262 0.39
263 0.35
264 0.33
265 0.32
266 0.28
267 0.2
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.14
298 0.2
299 0.23
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.32
304 0.38
305 0.39
306 0.34
307 0.36
308 0.35
309 0.38
310 0.4
311 0.35
312 0.3
313 0.34
314 0.35
315 0.33
316 0.31
317 0.3
318 0.33
319 0.36
320 0.38
321 0.37
322 0.34
323 0.31
324 0.36
325 0.38
326 0.36
327 0.34
328 0.35
329 0.38
330 0.46
331 0.51
332 0.51
333 0.54
334 0.54
335 0.52
336 0.54
337 0.54
338 0.5
339 0.54
340 0.54
341 0.5
342 0.51
343 0.59
344 0.61
345 0.58
346 0.59
347 0.54
348 0.53
349 0.54
350 0.52
351 0.48
352 0.41
353 0.38
354 0.36
355 0.31
356 0.27
357 0.23
358 0.22
359 0.18
360 0.19
361 0.19
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.19
366 0.2
367 0.21
368 0.25
369 0.3
370 0.39
371 0.46
372 0.54
373 0.62
374 0.7
375 0.76
376 0.79
377 0.81
378 0.83
379 0.85
380 0.81
381 0.8
382 0.75
383 0.71
384 0.64
385 0.57
386 0.52
387 0.5
388 0.48
389 0.44
390 0.44
391 0.44
392 0.43
393 0.43
394 0.38
395 0.3
396 0.33
397 0.37
398 0.4
399 0.4
400 0.38
401 0.4
402 0.41
403 0.43
404 0.36
405 0.29
406 0.23
407 0.19
408 0.19
409 0.16
410 0.14
411 0.12
412 0.14
413 0.14
414 0.16
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.21
419 0.22
420 0.21
421 0.25
422 0.24
423 0.26
424 0.27
425 0.25
426 0.26
427 0.29
428 0.28
429 0.21
430 0.21
431 0.19
432 0.19
433 0.22
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.2
438 0.21
439 0.2
440 0.18
441 0.16
442 0.17
443 0.18
444 0.21
445 0.17
446 0.15
447 0.15
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.18
452 0.15
453 0.16
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.15
459 0.11
460 0.12
461 0.1
462 0.12
463 0.2
464 0.2
465 0.22
466 0.22
467 0.25
468 0.25
469 0.25
470 0.25
471 0.17
472 0.15
473 0.12
474 0.11
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.04
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.12
484 0.19
485 0.27
486 0.3
487 0.34
488 0.34
489 0.38
490 0.4
491 0.44
492 0.47
493 0.43
494 0.42
495 0.41
496 0.4
497 0.38
498 0.38
499 0.3
500 0.21
501 0.21
502 0.2
503 0.23
504 0.23
505 0.24
506 0.24
507 0.23
508 0.23
509 0.21
510 0.21
511 0.17
512 0.17
513 0.18
514 0.2
515 0.21
516 0.26
517 0.29
518 0.31
519 0.32
520 0.32
521 0.3
522 0.27
523 0.28
524 0.22
525 0.17
526 0.15
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.09
537 0.13
538 0.21
539 0.27
540 0.29
541 0.34
542 0.35
543 0.37
544 0.42
545 0.42
546 0.41
547 0.44
548 0.49
549 0.52
550 0.53
551 0.53
552 0.49
553 0.48
554 0.47
555 0.48
556 0.51
557 0.53
558 0.63
559 0.71
560 0.78
561 0.84
562 0.86