Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2GBD6

Protein Details
Accession A0A0D2GBD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-295LKKAEETRFKKRRERGRDVDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-287RFKKRRER
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPSKRRKLSPEPEETQDRSDDTRETPQTRQEPDRDETLAASPTVEDQTNNDAGDSTSKPKELAADGTSTATTVPTSTNADRLARFAALKSRATQSAKSNLAEAKAEANRAAMDPALLANLNRRSAIAQHNLLKADTEEEEGKGAFERKRAWDYTIEESERWDERQERKKAARDNNAFSDWSDEASRMYDRQIRELEKSSLKDGHRNREEYERQKAEIIENAARTGGLEIVEMENGELVAIDKDGRFYADHDSLGFVEQKPKRENVDRLVNDLKKAEETRFKKRRERGRDVDEGDVTYINDKNKQFNLKLARFYDRYTKDIRESFERGTAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.69
3 0.61
4 0.53
5 0.45
6 0.38
7 0.35
8 0.32
9 0.28
10 0.35
11 0.39
12 0.41
13 0.42
14 0.48
15 0.53
16 0.57
17 0.6
18 0.57
19 0.56
20 0.55
21 0.56
22 0.49
23 0.42
24 0.37
25 0.32
26 0.27
27 0.21
28 0.18
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.18
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.23
49 0.21
50 0.23
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.14
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.13
64 0.14
65 0.17
66 0.2
67 0.22
68 0.22
69 0.23
70 0.22
71 0.19
72 0.19
73 0.17
74 0.21
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.26
79 0.31
80 0.33
81 0.36
82 0.34
83 0.38
84 0.4
85 0.38
86 0.37
87 0.32
88 0.31
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.08
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.1
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.17
113 0.23
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.31
118 0.31
119 0.3
120 0.27
121 0.21
122 0.18
123 0.14
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.16
135 0.19
136 0.23
137 0.24
138 0.25
139 0.26
140 0.29
141 0.32
142 0.33
143 0.31
144 0.27
145 0.26
146 0.27
147 0.23
148 0.2
149 0.16
150 0.18
151 0.25
152 0.35
153 0.39
154 0.43
155 0.47
156 0.53
157 0.59
158 0.62
159 0.64
160 0.6
161 0.6
162 0.57
163 0.53
164 0.47
165 0.39
166 0.34
167 0.24
168 0.2
169 0.15
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.08
175 0.11
176 0.14
177 0.14
178 0.18
179 0.22
180 0.23
181 0.26
182 0.29
183 0.31
184 0.31
185 0.32
186 0.3
187 0.32
188 0.31
189 0.36
190 0.38
191 0.44
192 0.46
193 0.47
194 0.46
195 0.49
196 0.56
197 0.54
198 0.58
199 0.5
200 0.46
201 0.45
202 0.44
203 0.36
204 0.32
205 0.29
206 0.23
207 0.2
208 0.2
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.08
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.18
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.13
244 0.2
245 0.23
246 0.3
247 0.32
248 0.35
249 0.41
250 0.47
251 0.52
252 0.51
253 0.59
254 0.53
255 0.56
256 0.62
257 0.56
258 0.5
259 0.45
260 0.38
261 0.33
262 0.34
263 0.33
264 0.34
265 0.39
266 0.48
267 0.55
268 0.62
269 0.67
270 0.73
271 0.79
272 0.79
273 0.84
274 0.82
275 0.82
276 0.83
277 0.77
278 0.74
279 0.64
280 0.54
281 0.45
282 0.36
283 0.28
284 0.21
285 0.21
286 0.18
287 0.23
288 0.24
289 0.29
290 0.35
291 0.43
292 0.42
293 0.47
294 0.55
295 0.54
296 0.6
297 0.58
298 0.6
299 0.54
300 0.55
301 0.57
302 0.51
303 0.5
304 0.48
305 0.49
306 0.49
307 0.52
308 0.54
309 0.51
310 0.51
311 0.5