Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2GTU8

Protein Details
Accession A0A0D2GTU8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
505-529TPLMGRGERSKKKRRFRSLSPVAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-521GERSKKKRRFR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037363  Sec13/Seh1_fam  
IPR006939  SNF5  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAPAQAYVTSYPPRIRQYTNTLLQPVLQTQNVVPGGRTTKRGTTIINYADDAYDEDDFEDSEGPRRPTGLRSLRREELEKKEPQHEKVGKEIHEPVDVQPIYRDWIIRRTVRPTTDAQAHIQSQLPLTLIPIRIDLDVPPYQPEAPFPLPRTGDIGVNPSLPMFKKPEPLPGYKIRDIFLWNLHENLLTPDDFAQCFVRELDLPNQTGLAMNVSQQIRTQLEDYAGVAMHPLFHTQQKRSQMPDTNPAPTPSAFVNGSSRGGTPRAHLGASISRPTSTTPGTPAISTPHPITLTNGASITAVASPLPPEPLIEQQDDSEDPFLNPDDTYRCIITLSIYLSSKLYQDKFEWSLLHPPGAAEAFARQTCADMGLGGEWVMAITHAIYEAVLRLKKEACEGGMVMIGGNHLSGEIDNQAVRGEEGAGWRYDIDDFGAEWEPKFEALSKEELEKREGDRERQLRRLRRETAKFSSTAGMVPSAREQEAQQRGSYFDYTTIGSAGTGEDTPLMGRGERSKKKRRFRSLSPVAKAQTPDATGSSAGAGWGGEGNRLQEYERQNWRCKHCLIWGSAVWAVRDGPMGPRTLCNSCGLVYERDKKLPAQVIANSGHDDMIHDAVLDYYGRRLATCSSDKTIKIFEIEGDQHRLTETLKGHEGAVWCVSWAHPKFGTLLASSSYDGRVHIYRETPSQQSQPGQQSQSSWTLVFTSTFHTASVNMVSWAPPDLGCLLACASSDGNVSVLEFRDNQWGHIIFPAHPMGVNAVSWAPSAPPGAITRKDPGTAAAGSGGGLVKRFVTGGSDNNVKLWELNPQSGTYENVLVLPNGHGDWVRDVAWSPTLLSKSYIASASQDKTVKIWTCTNMNSGPGNVGDWTLAKTLEFDAVTWRVSWSLSGNVLAVSGGDNKVTLWKEDLKGNWEMVREVTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.49
4 0.54
5 0.59
6 0.62
7 0.6
8 0.56
9 0.51
10 0.48
11 0.43
12 0.39
13 0.34
14 0.27
15 0.24
16 0.22
17 0.29
18 0.3
19 0.28
20 0.23
21 0.24
22 0.31
23 0.32
24 0.37
25 0.34
26 0.37
27 0.42
28 0.44
29 0.42
30 0.41
31 0.46
32 0.45
33 0.44
34 0.38
35 0.34
36 0.31
37 0.28
38 0.24
39 0.18
40 0.14
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.1
48 0.16
49 0.22
50 0.24
51 0.24
52 0.26
53 0.27
54 0.29
55 0.39
56 0.44
57 0.47
58 0.53
59 0.61
60 0.64
61 0.67
62 0.69
63 0.66
64 0.65
65 0.64
66 0.63
67 0.61
68 0.64
69 0.66
70 0.64
71 0.67
72 0.63
73 0.58
74 0.59
75 0.61
76 0.53
77 0.52
78 0.54
79 0.46
80 0.43
81 0.42
82 0.34
83 0.37
84 0.35
85 0.3
86 0.26
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.19
92 0.26
93 0.33
94 0.38
95 0.41
96 0.45
97 0.51
98 0.51
99 0.52
100 0.49
101 0.48
102 0.49
103 0.47
104 0.43
105 0.41
106 0.4
107 0.38
108 0.36
109 0.3
110 0.24
111 0.22
112 0.19
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.22
132 0.25
133 0.29
134 0.3
135 0.35
136 0.35
137 0.36
138 0.39
139 0.32
140 0.3
141 0.26
142 0.27
143 0.22
144 0.21
145 0.2
146 0.16
147 0.18
148 0.17
149 0.19
150 0.21
151 0.23
152 0.3
153 0.31
154 0.41
155 0.43
156 0.47
157 0.5
158 0.54
159 0.59
160 0.56
161 0.56
162 0.47
163 0.43
164 0.41
165 0.38
166 0.33
167 0.31
168 0.27
169 0.26
170 0.26
171 0.24
172 0.22
173 0.21
174 0.18
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.17
188 0.22
189 0.24
190 0.24
191 0.23
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.17
196 0.13
197 0.09
198 0.09
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.19
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.15
221 0.21
222 0.24
223 0.31
224 0.38
225 0.42
226 0.45
227 0.51
228 0.52
229 0.51
230 0.57
231 0.54
232 0.49
233 0.47
234 0.44
235 0.39
236 0.31
237 0.29
238 0.2
239 0.2
240 0.16
241 0.16
242 0.18
243 0.17
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.19
252 0.2
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.22
257 0.24
258 0.25
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.22
264 0.18
265 0.16
266 0.16
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.21
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.14
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.17
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.14
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.17
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.21
338 0.27
339 0.25
340 0.24
341 0.2
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.15
381 0.14
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.02
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.1
430 0.12
431 0.12
432 0.16
433 0.19
434 0.2
435 0.2
436 0.2
437 0.2
438 0.26
439 0.27
440 0.26
441 0.31
442 0.38
443 0.4
444 0.47
445 0.53
446 0.53
447 0.59
448 0.64
449 0.63
450 0.64
451 0.66
452 0.65
453 0.63
454 0.57
455 0.49
456 0.43
457 0.37
458 0.28
459 0.23
460 0.16
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.16
470 0.22
471 0.23
472 0.22
473 0.21
474 0.22
475 0.23
476 0.24
477 0.16
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.13
498 0.22
499 0.3
500 0.39
501 0.49
502 0.58
503 0.69
504 0.78
505 0.82
506 0.81
507 0.82
508 0.84
509 0.85
510 0.84
511 0.77
512 0.71
513 0.61
514 0.56
515 0.47
516 0.37
517 0.29
518 0.2
519 0.18
520 0.14
521 0.13
522 0.11
523 0.1
524 0.09
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.04
529 0.03
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.12
539 0.17
540 0.24
541 0.33
542 0.38
543 0.45
544 0.51
545 0.56
546 0.56
547 0.53
548 0.48
549 0.45
550 0.45
551 0.4
552 0.38
553 0.33
554 0.31
555 0.31
556 0.29
557 0.22
558 0.17
559 0.15
560 0.11
561 0.11
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.12
567 0.14
568 0.17
569 0.18
570 0.19
571 0.18
572 0.17
573 0.16
574 0.18
575 0.19
576 0.2
577 0.24
578 0.3
579 0.31
580 0.32
581 0.33
582 0.31
583 0.34
584 0.35
585 0.31
586 0.27
587 0.27
588 0.29
589 0.3
590 0.3
591 0.26
592 0.21
593 0.19
594 0.14
595 0.13
596 0.1
597 0.09
598 0.08
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.1
611 0.16
612 0.2
613 0.22
614 0.25
615 0.29
616 0.29
617 0.3
618 0.3
619 0.25
620 0.22
621 0.19
622 0.16
623 0.17
624 0.2
625 0.2
626 0.24
627 0.23
628 0.21
629 0.21
630 0.21
631 0.17
632 0.19
633 0.18
634 0.17
635 0.19
636 0.19
637 0.19
638 0.21
639 0.21
640 0.17
641 0.16
642 0.13
643 0.11
644 0.11
645 0.11
646 0.17
647 0.17
648 0.2
649 0.19
650 0.19
651 0.21
652 0.23
653 0.24
654 0.16
655 0.16
656 0.14
657 0.15
658 0.15
659 0.14
660 0.14
661 0.12
662 0.12
663 0.14
664 0.14
665 0.14
666 0.16
667 0.18
668 0.19
669 0.23
670 0.27
671 0.28
672 0.3
673 0.32
674 0.33
675 0.33
676 0.38
677 0.4
678 0.42
679 0.4
680 0.37
681 0.36
682 0.35
683 0.37
684 0.32
685 0.25
686 0.19
687 0.18
688 0.18
689 0.17
690 0.14
691 0.14
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.14
696 0.14
697 0.15
698 0.16
699 0.12
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.08
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.07
722 0.08
723 0.08
724 0.09
725 0.1
726 0.1
727 0.12
728 0.2
729 0.21
730 0.21
731 0.25
732 0.25
733 0.23
734 0.26
735 0.27
736 0.18
737 0.22
738 0.22
739 0.17
740 0.17
741 0.16
742 0.15
743 0.14
744 0.13
745 0.1
746 0.09
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.08
754 0.1
755 0.13
756 0.19
757 0.21
758 0.23
759 0.27
760 0.28
761 0.29
762 0.27
763 0.25
764 0.24
765 0.22
766 0.19
767 0.15
768 0.13
769 0.12
770 0.13
771 0.12
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.07
776 0.07
777 0.08
778 0.07
779 0.1
780 0.12
781 0.16
782 0.21
783 0.25
784 0.25
785 0.26
786 0.27
787 0.23
788 0.21
789 0.18
790 0.22
791 0.2
792 0.24
793 0.24
794 0.25
795 0.26
796 0.26
797 0.28
798 0.21
799 0.19
800 0.16
801 0.16
802 0.16
803 0.14
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.1
808 0.11
809 0.1
810 0.11
811 0.13
812 0.15
813 0.14
814 0.13
815 0.14
816 0.16
817 0.17
818 0.16
819 0.15
820 0.17
821 0.19
822 0.19
823 0.2
824 0.2
825 0.19
826 0.21
827 0.21
828 0.17
829 0.19
830 0.24
831 0.24
832 0.29
833 0.29
834 0.27
835 0.28
836 0.35
837 0.35
838 0.34
839 0.37
840 0.36
841 0.39
842 0.41
843 0.45
844 0.39
845 0.38
846 0.36
847 0.31
848 0.28
849 0.23
850 0.22
851 0.17
852 0.15
853 0.13
854 0.12
855 0.13
856 0.13
857 0.12
858 0.11
859 0.12
860 0.13
861 0.16
862 0.15
863 0.13
864 0.18
865 0.2
866 0.21
867 0.2
868 0.19
869 0.16
870 0.16
871 0.17
872 0.14
873 0.16
874 0.17
875 0.18
876 0.17
877 0.16
878 0.16
879 0.14
880 0.12
881 0.09
882 0.11
883 0.1
884 0.1
885 0.1
886 0.1
887 0.17
888 0.19
889 0.19
890 0.2
891 0.27
892 0.29
893 0.35
894 0.39
895 0.37
896 0.39
897 0.41
898 0.39
899 0.34
900 0.32