Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FIZ1

Protein Details
Accession Q6FIZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-102LMSTPLKKPKTRKQKLKERDPNMPKRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-97KKPKTRKQKLKERDPN
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0045027  F:DNA end binding  
GO:0000404  F:heteroduplex DNA loop binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0000722  P:telomere maintenance via recombination  
KEGG cgr:CAGL0M10505g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MDARNLSDEELKRKVEELKENNEVIGLALQRSRLSVKRLKLEYGVLLERLEARADMDPDVGTFNPLPSLENFQKELMSTPLKKPKTRKQKLKERDPNMPKRPTNAYLLFCEMNKEKIKEGGSVDVTKDLTESWKNLSEQERKPYYRLYNEDRERYQAEMEAYNKKSKTEDAGKEDSMSKNSSKQEDSDQTSNEVEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.46
4 0.47
5 0.5
6 0.54
7 0.53
8 0.5
9 0.44
10 0.36
11 0.26
12 0.22
13 0.15
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.17
20 0.18
21 0.24
22 0.3
23 0.35
24 0.43
25 0.45
26 0.46
27 0.44
28 0.43
29 0.38
30 0.36
31 0.31
32 0.23
33 0.2
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.17
56 0.17
57 0.2
58 0.21
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.24
67 0.32
68 0.36
69 0.4
70 0.47
71 0.53
72 0.6
73 0.68
74 0.73
75 0.74
76 0.81
77 0.86
78 0.9
79 0.9
80 0.83
81 0.83
82 0.82
83 0.82
84 0.79
85 0.77
86 0.66
87 0.59
88 0.59
89 0.51
90 0.48
91 0.42
92 0.36
93 0.3
94 0.32
95 0.29
96 0.24
97 0.24
98 0.19
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.19
103 0.22
104 0.24
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.19
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.18
121 0.19
122 0.23
123 0.3
124 0.35
125 0.38
126 0.46
127 0.51
128 0.48
129 0.5
130 0.53
131 0.52
132 0.51
133 0.53
134 0.51
135 0.54
136 0.59
137 0.64
138 0.58
139 0.57
140 0.5
141 0.45
142 0.39
143 0.31
144 0.27
145 0.25
146 0.26
147 0.3
148 0.31
149 0.36
150 0.35
151 0.33
152 0.33
153 0.31
154 0.37
155 0.38
156 0.44
157 0.45
158 0.5
159 0.5
160 0.5
161 0.52
162 0.46
163 0.39
164 0.34
165 0.29
166 0.3
167 0.35
168 0.38
169 0.36
170 0.36
171 0.42
172 0.47
173 0.52
174 0.51
175 0.47
176 0.45