Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FIP6

Protein Details
Accession Q6FIP6    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
564-592EFYQELKDTPKPKKYRKISISKKTLRSMWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
574-581KPKKYRKI
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016573  Hop1  
IPR003511  HORMA_dom  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000800  C:lateral element  
GO:0000400  F:four-way junction DNA binding  
GO:0051598  P:meiotic recombination checkpoint signaling  
GO:0007130  P:synaptonemal complex assembly  
KEGG cgr:CAGL0M12771g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02301  HORMA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50815  HORMA  
Amino Acid Sequences MATTQLTRQKVDTRTAISVDQSQKLVQTMLTMSFGCLAFLRGLFPDDSFVDQRFVPDKVDKNYDRNNCAQNNSIKIKTLARGRNSEVDVLLDWLEKAVFKSIRLKFLKALSLGIFLDENNPQEMIENYIFSFEYDNDEVKMNVTNKNTTGNRDDSISLLDSRRMAQQLMRRFIIITQSLEPLPQRKFLTMRLMFNENTDPEYQPPFFRDATFEKQATIKIPTTMEKEITEIGTLDTKTHKLSLNILSACDLKEGEQTIELNPFDLVTKKFTKVEKTEHHEVSHHEVSQTTSILGHLLESTQCSLQPTQAVVNHQSLTTGACECRETLSKSCTAFKTCRKCAKVVHGICYGNVGTQKIDQCIECLCGPEFNYSNTYFKDLMLLRKVYRQINRQKGLLPSALSDLFNNVTSNKRDDSESTERFQFCISALLFDGILVINANNGIQGQTSQHKTNEQQVLVDYDNIWCPVNGKLTKNQLYHIKYFQIKAIPSCHRDIIPQSKTQVLLWIEEVKERRTQLNRYISDTLEMGQLSLKEHKETTYNVQAQEPHKRKNSDIADSMPIDTQEFYQELKDTPKPKKYRKISISKKTLRSMW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.45
4 0.39
5 0.43
6 0.41
7 0.38
8 0.34
9 0.31
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.16
19 0.15
20 0.17
21 0.17
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.11
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.23
40 0.23
41 0.23
42 0.23
43 0.27
44 0.33
45 0.37
46 0.46
47 0.47
48 0.52
49 0.6
50 0.63
51 0.62
52 0.62
53 0.65
54 0.6
55 0.59
56 0.58
57 0.55
58 0.55
59 0.56
60 0.51
61 0.45
62 0.43
63 0.44
64 0.43
65 0.46
66 0.46
67 0.46
68 0.5
69 0.52
70 0.56
71 0.54
72 0.5
73 0.41
74 0.34
75 0.29
76 0.24
77 0.2
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.14
85 0.15
86 0.17
87 0.27
88 0.3
89 0.4
90 0.43
91 0.44
92 0.42
93 0.45
94 0.48
95 0.39
96 0.38
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.22
101 0.18
102 0.13
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.09
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.21
128 0.17
129 0.21
130 0.23
131 0.24
132 0.24
133 0.33
134 0.34
135 0.32
136 0.36
137 0.34
138 0.32
139 0.32
140 0.31
141 0.24
142 0.24
143 0.21
144 0.18
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.16
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.19
153 0.25
154 0.32
155 0.36
156 0.35
157 0.32
158 0.31
159 0.31
160 0.33
161 0.28
162 0.22
163 0.19
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.21
169 0.2
170 0.23
171 0.22
172 0.23
173 0.26
174 0.29
175 0.38
176 0.36
177 0.38
178 0.36
179 0.39
180 0.36
181 0.36
182 0.35
183 0.25
184 0.23
185 0.21
186 0.19
187 0.17
188 0.21
189 0.2
190 0.18
191 0.19
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.21
196 0.23
197 0.28
198 0.32
199 0.3
200 0.28
201 0.28
202 0.29
203 0.27
204 0.25
205 0.2
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.23
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.17
216 0.14
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.18
229 0.22
230 0.26
231 0.26
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.22
236 0.17
237 0.13
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.16
256 0.21
257 0.23
258 0.28
259 0.3
260 0.38
261 0.41
262 0.46
263 0.51
264 0.49
265 0.48
266 0.43
267 0.41
268 0.4
269 0.35
270 0.27
271 0.2
272 0.19
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.09
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.15
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.13
312 0.15
313 0.17
314 0.19
315 0.22
316 0.23
317 0.27
318 0.26
319 0.28
320 0.31
321 0.36
322 0.43
323 0.48
324 0.55
325 0.54
326 0.55
327 0.56
328 0.59
329 0.61
330 0.54
331 0.52
332 0.48
333 0.46
334 0.42
335 0.4
336 0.3
337 0.21
338 0.2
339 0.15
340 0.1
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.16
356 0.15
357 0.18
358 0.18
359 0.2
360 0.19
361 0.22
362 0.19
363 0.18
364 0.22
365 0.21
366 0.23
367 0.26
368 0.28
369 0.25
370 0.29
371 0.34
372 0.35
373 0.39
374 0.44
375 0.49
376 0.57
377 0.59
378 0.56
379 0.55
380 0.52
381 0.49
382 0.42
383 0.33
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.19
388 0.16
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.14
395 0.16
396 0.19
397 0.19
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.29
402 0.34
403 0.35
404 0.35
405 0.39
406 0.38
407 0.37
408 0.35
409 0.27
410 0.18
411 0.2
412 0.17
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.08
432 0.14
433 0.18
434 0.21
435 0.23
436 0.27
437 0.3
438 0.38
439 0.42
440 0.36
441 0.33
442 0.31
443 0.34
444 0.3
445 0.28
446 0.2
447 0.14
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.1
452 0.11
453 0.13
454 0.21
455 0.24
456 0.26
457 0.31
458 0.41
459 0.48
460 0.48
461 0.5
462 0.51
463 0.52
464 0.54
465 0.5
466 0.48
467 0.44
468 0.44
469 0.43
470 0.39
471 0.36
472 0.35
473 0.4
474 0.4
475 0.41
476 0.43
477 0.41
478 0.37
479 0.38
480 0.42
481 0.45
482 0.42
483 0.42
484 0.41
485 0.41
486 0.42
487 0.39
488 0.37
489 0.28
490 0.26
491 0.24
492 0.27
493 0.24
494 0.28
495 0.3
496 0.26
497 0.29
498 0.3
499 0.35
500 0.36
501 0.42
502 0.47
503 0.55
504 0.55
505 0.57
506 0.58
507 0.51
508 0.46
509 0.4
510 0.32
511 0.24
512 0.21
513 0.15
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.23
522 0.25
523 0.28
524 0.34
525 0.38
526 0.41
527 0.4
528 0.42
529 0.47
530 0.49
531 0.56
532 0.55
533 0.53
534 0.57
535 0.59
536 0.58
537 0.62
538 0.64
539 0.61
540 0.58
541 0.54
542 0.52
543 0.49
544 0.48
545 0.39
546 0.32
547 0.26
548 0.22
549 0.18
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.17
555 0.18
556 0.24
557 0.31
558 0.36
559 0.44
560 0.53
561 0.61
562 0.7
563 0.78
564 0.82
565 0.86
566 0.88
567 0.9
568 0.91
569 0.92
570 0.92
571 0.91
572 0.9