Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FXB1

Protein Details
Accession Q6FXB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
625-671STAAGDKAPKPKKPRKTKAKTADGDAAPKRKKAPTKKKQPSGSEGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
608-663KGKAAAKGAKGGTKRGGSTAAGDKAPKPKKPRKTKAKTADGDAAPKRKKAPTKKKQ
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0036498  P:IRE1-mediated unfolded protein response  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cgr:CAGL0B01353g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MNGSPNYGQDKSMLGVAVNGVGSPGSPVNMASPGSGVGSGATPSSMATGPANGPGNYTGGQGQQMPRMPGGPAGTGIPTGMNGQALNQRQILQQKMLLRQQQVQQAQHQRQIALQNYENQFNQLLMMHNPRPKRNYAFVETPNELLKKYEQYRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQQQKNPELTSDGLILNKSNETLREFLEYVARGRIPYAIMEVLRDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVTIRSDTKGQDHSNGSPHKSPNAVTSAGHSGNPGNLGQAGAVSIKMESPKPVTGSPAASNLKNQIGAVGNMKEDAEKSGNTTLTQTPGQSKPGENQNTKLDSNQTYKRPRVYRTLLRPNDLSQYYDLMSYADHSRFSDTVYQQLESELLTLTKRNLDLSVPMNPYEHKDKLEDELFTAPYWDENVKGIIHQHRDESTAARTKGVVHHIPEHEDNEQKTSEYEQLMLIMNERTTTSTGATFAAIVAMNAMQKMKRSNENAEDDDAVGGIENGLKGSNNNSTGSKVAMAAAAAAASLGGTMNSETNQFRRLKFIEQWKINKEKRKQQALANNMLPTAYNARISMTTPQNGGSSNGMPQGGNSTEGTGKGKAAAKGAKGGTKRGGSTAAGDKAPKPKKPRKTKAKTADGDAAPKRKKAPTKKKQPSGSEGGTPNVPQTPGTAGSPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.13
17 0.14
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.12
36 0.13
37 0.18
38 0.22
39 0.19
40 0.21
41 0.2
42 0.22
43 0.2
44 0.21
45 0.17
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.21
50 0.24
51 0.28
52 0.28
53 0.27
54 0.27
55 0.26
56 0.25
57 0.25
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.14
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.11
71 0.17
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.24
76 0.27
77 0.33
78 0.34
79 0.3
80 0.31
81 0.35
82 0.4
83 0.46
84 0.48
85 0.45
86 0.47
87 0.5
88 0.54
89 0.55
90 0.51
91 0.53
92 0.58
93 0.59
94 0.6
95 0.56
96 0.48
97 0.45
98 0.49
99 0.46
100 0.41
101 0.38
102 0.41
103 0.41
104 0.44
105 0.4
106 0.35
107 0.29
108 0.23
109 0.22
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.22
114 0.26
115 0.31
116 0.36
117 0.41
118 0.44
119 0.49
120 0.51
121 0.53
122 0.55
123 0.56
124 0.59
125 0.58
126 0.6
127 0.56
128 0.5
129 0.46
130 0.39
131 0.33
132 0.27
133 0.25
134 0.26
135 0.29
136 0.35
137 0.38
138 0.43
139 0.49
140 0.52
141 0.52
142 0.46
143 0.44
144 0.38
145 0.32
146 0.36
147 0.33
148 0.33
149 0.32
150 0.3
151 0.3
152 0.28
153 0.27
154 0.2
155 0.2
156 0.22
157 0.26
158 0.34
159 0.36
160 0.41
161 0.48
162 0.53
163 0.56
164 0.59
165 0.62
166 0.6
167 0.62
168 0.58
169 0.51
170 0.45
171 0.4
172 0.34
173 0.26
174 0.19
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.18
194 0.15
195 0.14
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.12
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.23
238 0.22
239 0.25
240 0.27
241 0.28
242 0.33
243 0.36
244 0.35
245 0.34
246 0.34
247 0.31
248 0.3
249 0.29
250 0.25
251 0.25
252 0.23
253 0.18
254 0.19
255 0.22
256 0.21
257 0.2
258 0.17
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.12
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.16
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.22
286 0.23
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.19
292 0.17
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.1
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.16
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.19
321 0.28
322 0.34
323 0.31
324 0.33
325 0.35
326 0.37
327 0.37
328 0.34
329 0.29
330 0.25
331 0.29
332 0.32
333 0.34
334 0.37
335 0.39
336 0.46
337 0.47
338 0.46
339 0.49
340 0.51
341 0.52
342 0.56
343 0.64
344 0.59
345 0.57
346 0.55
347 0.48
348 0.46
349 0.38
350 0.3
351 0.19
352 0.18
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.18
367 0.15
368 0.2
369 0.21
370 0.21
371 0.19
372 0.19
373 0.18
374 0.11
375 0.12
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.12
387 0.14
388 0.2
389 0.19
390 0.19
391 0.2
392 0.19
393 0.22
394 0.25
395 0.24
396 0.19
397 0.19
398 0.2
399 0.24
400 0.26
401 0.22
402 0.18
403 0.19
404 0.18
405 0.16
406 0.16
407 0.11
408 0.09
409 0.11
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.14
417 0.18
418 0.22
419 0.22
420 0.23
421 0.23
422 0.25
423 0.25
424 0.23
425 0.23
426 0.25
427 0.25
428 0.23
429 0.23
430 0.22
431 0.25
432 0.29
433 0.27
434 0.23
435 0.29
436 0.3
437 0.33
438 0.33
439 0.31
440 0.28
441 0.28
442 0.27
443 0.23
444 0.22
445 0.19
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.15
450 0.15
451 0.12
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.14
481 0.18
482 0.24
483 0.29
484 0.35
485 0.42
486 0.48
487 0.48
488 0.45
489 0.42
490 0.35
491 0.3
492 0.23
493 0.16
494 0.09
495 0.07
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.09
504 0.14
505 0.15
506 0.17
507 0.18
508 0.19
509 0.2
510 0.21
511 0.18
512 0.14
513 0.12
514 0.1
515 0.09
516 0.08
517 0.07
518 0.05
519 0.04
520 0.04
521 0.03
522 0.02
523 0.03
524 0.02
525 0.02
526 0.03
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.09
531 0.1
532 0.12
533 0.2
534 0.23
535 0.23
536 0.3
537 0.32
538 0.36
539 0.41
540 0.5
541 0.53
542 0.58
543 0.65
544 0.65
545 0.73
546 0.73
547 0.76
548 0.74
549 0.74
550 0.76
551 0.79
552 0.76
553 0.74
554 0.77
555 0.74
556 0.74
557 0.68
558 0.58
559 0.48
560 0.43
561 0.34
562 0.27
563 0.25
564 0.18
565 0.15
566 0.15
567 0.17
568 0.18
569 0.19
570 0.25
571 0.25
572 0.26
573 0.25
574 0.27
575 0.26
576 0.26
577 0.27
578 0.22
579 0.18
580 0.18
581 0.2
582 0.19
583 0.18
584 0.17
585 0.19
586 0.17
587 0.18
588 0.16
589 0.16
590 0.16
591 0.18
592 0.21
593 0.17
594 0.17
595 0.2
596 0.24
597 0.24
598 0.29
599 0.31
600 0.3
601 0.36
602 0.38
603 0.39
604 0.36
605 0.4
606 0.4
607 0.4
608 0.4
609 0.35
610 0.36
611 0.3
612 0.33
613 0.36
614 0.33
615 0.31
616 0.32
617 0.34
618 0.41
619 0.48
620 0.5
621 0.53
622 0.59
623 0.68
624 0.78
625 0.85
626 0.86
627 0.89
628 0.93
629 0.93
630 0.94
631 0.88
632 0.84
633 0.82
634 0.73
635 0.72
636 0.68
637 0.67
638 0.59
639 0.58
640 0.57
641 0.56
642 0.63
643 0.66
644 0.7
645 0.72
646 0.79
647 0.87
648 0.91
649 0.92
650 0.9
651 0.87
652 0.85
653 0.78
654 0.75
655 0.66
656 0.59
657 0.51
658 0.43
659 0.38
660 0.32
661 0.28
662 0.2
663 0.19
664 0.21
665 0.21