Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0M843

Protein Details
Accession A0A0R0M843    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-319SEKMSQIRSKFRKQTVKKKWETTSNLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-147KKFRGRKGKRER
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MKLNRLEVKTKKILIGNLISKENGEITLDMAYFEDDPDLKFRITISEKDVISFKAEQKIESPKTKYDQFKKNEEVYGIKMKFEESVYTTILDKESKFYKENVEEAKRIEREIQADNSKNKKEIEDEETRYSAVIGKKFRGRKGKRERFGDGAPDSGWLPSYDAKNDQSSVKPHEKNRFNRYQYSGTENSGSRKTNQYYTNENTDRRGIDHQQHKSDGFKSYHSSKQPQYTRHEYSKDDSRKHDKSLETTPVITKDNEKQDKKDHYSKTDPDLKTLPGLDTPESIEPKQRISLSEKMSQIRSKFRKQTVKKKWETTSNLLPAISKAENSPFLRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.5
4 0.47
5 0.46
6 0.41
7 0.36
8 0.34
9 0.29
10 0.21
11 0.16
12 0.11
13 0.1
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.09
23 0.1
24 0.13
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.2
30 0.24
31 0.26
32 0.28
33 0.32
34 0.32
35 0.34
36 0.35
37 0.28
38 0.28
39 0.29
40 0.27
41 0.29
42 0.29
43 0.28
44 0.31
45 0.4
46 0.43
47 0.46
48 0.47
49 0.44
50 0.49
51 0.56
52 0.62
53 0.61
54 0.64
55 0.63
56 0.67
57 0.69
58 0.68
59 0.63
60 0.56
61 0.49
62 0.44
63 0.48
64 0.4
65 0.33
66 0.29
67 0.27
68 0.26
69 0.24
70 0.21
71 0.14
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.21
83 0.22
84 0.23
85 0.28
86 0.3
87 0.34
88 0.39
89 0.39
90 0.38
91 0.38
92 0.44
93 0.37
94 0.35
95 0.33
96 0.27
97 0.26
98 0.28
99 0.31
100 0.31
101 0.35
102 0.41
103 0.45
104 0.44
105 0.43
106 0.4
107 0.36
108 0.33
109 0.33
110 0.33
111 0.34
112 0.37
113 0.37
114 0.37
115 0.35
116 0.31
117 0.27
118 0.24
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.22
123 0.29
124 0.34
125 0.4
126 0.47
127 0.49
128 0.55
129 0.65
130 0.72
131 0.73
132 0.74
133 0.71
134 0.65
135 0.61
136 0.56
137 0.45
138 0.36
139 0.28
140 0.23
141 0.19
142 0.14
143 0.13
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.18
156 0.23
157 0.29
158 0.33
159 0.37
160 0.46
161 0.53
162 0.59
163 0.64
164 0.68
165 0.63
166 0.64
167 0.63
168 0.59
169 0.52
170 0.51
171 0.44
172 0.36
173 0.35
174 0.3
175 0.28
176 0.26
177 0.25
178 0.21
179 0.25
180 0.26
181 0.29
182 0.33
183 0.34
184 0.37
185 0.4
186 0.47
187 0.45
188 0.44
189 0.4
190 0.38
191 0.34
192 0.3
193 0.31
194 0.26
195 0.3
196 0.38
197 0.42
198 0.43
199 0.45
200 0.43
201 0.42
202 0.4
203 0.38
204 0.3
205 0.27
206 0.28
207 0.31
208 0.36
209 0.38
210 0.42
211 0.4
212 0.48
213 0.52
214 0.54
215 0.57
216 0.59
217 0.6
218 0.61
219 0.6
220 0.53
221 0.52
222 0.56
223 0.56
224 0.53
225 0.54
226 0.56
227 0.56
228 0.58
229 0.59
230 0.52
231 0.49
232 0.52
233 0.51
234 0.44
235 0.42
236 0.39
237 0.36
238 0.35
239 0.31
240 0.28
241 0.28
242 0.37
243 0.45
244 0.46
245 0.47
246 0.54
247 0.63
248 0.67
249 0.69
250 0.65
251 0.63
252 0.68
253 0.68
254 0.67
255 0.67
256 0.6
257 0.55
258 0.51
259 0.45
260 0.39
261 0.36
262 0.29
263 0.22
264 0.24
265 0.2
266 0.19
267 0.2
268 0.22
269 0.25
270 0.24
271 0.29
272 0.28
273 0.29
274 0.33
275 0.32
276 0.31
277 0.33
278 0.4
279 0.39
280 0.44
281 0.46
282 0.45
283 0.49
284 0.51
285 0.5
286 0.53
287 0.56
288 0.59
289 0.63
290 0.69
291 0.75
292 0.79
293 0.86
294 0.87
295 0.9
296 0.89
297 0.89
298 0.87
299 0.86
300 0.83
301 0.8
302 0.79
303 0.73
304 0.67
305 0.58
306 0.51
307 0.41
308 0.39
309 0.32
310 0.23
311 0.19
312 0.22
313 0.3