Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LT45

Protein Details
Accession A0A0R0LT45    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-246LDNCKNFKRKKEIHKLLKRAKRQARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-246KRKKEIHKLLKRAKRQAR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
Amino Acid Sequences SYVKFHEYAVELDNNLMDLREFREELESDPRYLAQRDMLSSKLQAVTFHVSAKIFKEHEEPFVDFMINLALEKGVKNFPSLYFDIVLKLKTEYQRYYDDEISPSLMDFIENLFDLSNRNVNFQSDIISVLRIDNIWLTLKLFNQLIIFYSDLNQFPEFINEKYSLRYKIHEIFLTDTSSQFQNMEPTKENLRFVSFMLDDFQERLNAGLSAIADIKRLSEELDNCKNFKRKKEIHKLLKRAKRQARPSFEFVMSSYRILFTLADETNLLLRSEILKKFISILNCNLKTIVGPKCSNLAIKSPEKYGFFPKEFLAKILRIYLTMDNEKYLQTIVSDLSYFNIQLFKKCLYLIDSKGIFNKNEESEDFKLFVNKLEKIQKDTIEDDDIVPDEFIDPITCDVMEDPVLLKTSKVIIDRTTFDSLMLSDRIDPFNREILDDSKIEAVTELKQKIEKYWADKKMKRAIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.14
4 0.1
5 0.09
6 0.12
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.21
11 0.22
12 0.25
13 0.33
14 0.32
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.29
19 0.3
20 0.28
21 0.25
22 0.25
23 0.28
24 0.29
25 0.29
26 0.28
27 0.27
28 0.29
29 0.27
30 0.25
31 0.22
32 0.24
33 0.28
34 0.27
35 0.28
36 0.27
37 0.24
38 0.25
39 0.27
40 0.29
41 0.24
42 0.25
43 0.29
44 0.29
45 0.33
46 0.36
47 0.34
48 0.29
49 0.3
50 0.28
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.18
65 0.18
66 0.24
67 0.25
68 0.24
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.22
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.24
78 0.3
79 0.29
80 0.32
81 0.37
82 0.41
83 0.44
84 0.42
85 0.39
86 0.35
87 0.33
88 0.3
89 0.24
90 0.2
91 0.15
92 0.11
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.15
104 0.14
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.18
110 0.19
111 0.15
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.17
144 0.18
145 0.15
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.2
150 0.24
151 0.23
152 0.23
153 0.24
154 0.27
155 0.31
156 0.33
157 0.32
158 0.3
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.24
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.12
168 0.11
169 0.15
170 0.16
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.27
175 0.28
176 0.29
177 0.23
178 0.23
179 0.21
180 0.19
181 0.21
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.12
208 0.18
209 0.26
210 0.27
211 0.28
212 0.32
213 0.38
214 0.39
215 0.42
216 0.46
217 0.46
218 0.56
219 0.66
220 0.73
221 0.77
222 0.82
223 0.86
224 0.85
225 0.85
226 0.81
227 0.8
228 0.79
229 0.76
230 0.78
231 0.77
232 0.77
233 0.74
234 0.71
235 0.65
236 0.56
237 0.48
238 0.38
239 0.33
240 0.25
241 0.2
242 0.15
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.07
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.14
260 0.15
261 0.17
262 0.16
263 0.16
264 0.18
265 0.21
266 0.21
267 0.18
268 0.24
269 0.31
270 0.31
271 0.31
272 0.29
273 0.27
274 0.24
275 0.27
276 0.26
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.25
281 0.26
282 0.27
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.27
287 0.28
288 0.29
289 0.32
290 0.32
291 0.33
292 0.36
293 0.36
294 0.33
295 0.33
296 0.31
297 0.33
298 0.31
299 0.31
300 0.27
301 0.21
302 0.21
303 0.22
304 0.21
305 0.16
306 0.19
307 0.2
308 0.21
309 0.23
310 0.23
311 0.2
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.15
316 0.11
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.13
328 0.13
329 0.15
330 0.18
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.2
335 0.2
336 0.25
337 0.25
338 0.3
339 0.3
340 0.3
341 0.35
342 0.37
343 0.33
344 0.29
345 0.32
346 0.26
347 0.27
348 0.28
349 0.29
350 0.29
351 0.31
352 0.29
353 0.25
354 0.26
355 0.24
356 0.29
357 0.27
358 0.26
359 0.3
360 0.37
361 0.39
362 0.42
363 0.47
364 0.44
365 0.43
366 0.43
367 0.4
368 0.35
369 0.34
370 0.28
371 0.24
372 0.21
373 0.18
374 0.15
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.14
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.23
400 0.27
401 0.31
402 0.35
403 0.36
404 0.32
405 0.29
406 0.28
407 0.24
408 0.23
409 0.21
410 0.16
411 0.15
412 0.18
413 0.22
414 0.23
415 0.26
416 0.25
417 0.31
418 0.3
419 0.28
420 0.29
421 0.28
422 0.29
423 0.27
424 0.25
425 0.22
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.17
430 0.19
431 0.26
432 0.26
433 0.26
434 0.29
435 0.31
436 0.34
437 0.41
438 0.42
439 0.43
440 0.51
441 0.59
442 0.66
443 0.7
444 0.75