FuNGI

A0A0R0LXL2

Protein Details

Accession

A0A0R0LXL2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-59	LETKYKKEIESERKKQQIKERI	Hydrophilic
408-436	KKIGTTYQIKKNERRQRHKRDPILGKNVV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-427	KNERRQRHKR

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

ASSDTITPLNDSSDFQNDSSFTKDLTRGESWQTFTSKLETKYKKEIESERKKQQIKERISEEISEESELEESDHSLEERVDVKIQSQLRPTQKSPKLFLIRVKTGNERNVFFRLRGEIDRISNPTTSVTQNSDFITETENQNEQISQTNKIFSIIYKESLPGYLYVESHSRQSVLNIIDNIRFIKKKYISAIPLDEMIEVLTFKEQTIIKGTWARVKKGNQKGEIGQIVQQLSPELVKIKFVPFIGNRRELMNIDLFKEKKIIKDEEFKINGQLYDKEGFLIRKMRISELKMNITPTIDEISIFKKNKNIQKGDTIEIEKGELKNIKGKVASISDSHVQILMKDPSQAENDFFKVTVPLDDIKKSHSLGDSVSVNDVNGVIVHLDQRDAIVAFDNFTREEKVPLTKLKKIGTTYQIKKNERRQRHKRDPILGKNVVITTKKYKGYQGTVKDVSRDKLLVELISNLNRIEVDRKDVILHTERGASPHRSPYKSPYSRSPRYTPDIQKTPGAISGYKTPNTISGYKTPSAISG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.26
4	0.24
5	0.25
6	0.28
7	0.25
8	0.2
9	0.22
10	0.26
11	0.25
12	0.3
13	0.31
14	0.3
15	0.37
16	0.4
17	0.39
18	0.4
19	0.41
20	0.36
21	0.34
22	0.37
23	0.37
24	0.38
25	0.44
26	0.47
27	0.51
28	0.6
29	0.64
30	0.63
31	0.64
32	0.69
33	0.7
34	0.74
35	0.77
36	0.76
37	0.8
38	0.81
39	0.81
40	0.8
41	0.79
42	0.77
43	0.76
44	0.71
45	0.68
46	0.64
47	0.58
48	0.51
49	0.44
50	0.37
51	0.29
52	0.24
53	0.18
54	0.16
55	0.14
56	0.12
57	0.09
58	0.08
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.15
68	0.15
69	0.16
70	0.21
71	0.25
72	0.27
73	0.3
74	0.37
75	0.42
76	0.48
77	0.52
78	0.56
79	0.59
80	0.62
81	0.61
82	0.63
83	0.63
84	0.6
85	0.64
86	0.62
87	0.62
88	0.6
89	0.59
90	0.57
91	0.55
92	0.59
93	0.55
94	0.49
95	0.45
96	0.47
97	0.45
98	0.38
99	0.34
100	0.3
101	0.3
102	0.3
103	0.31
104	0.28
105	0.29
106	0.32
107	0.33
108	0.31
109	0.28
110	0.26
111	0.24
112	0.23
113	0.21
114	0.2
115	0.21
116	0.2
117	0.22
118	0.22
119	0.21
120	0.19
121	0.18
122	0.18
123	0.16
124	0.16
125	0.18
126	0.18
127	0.17
128	0.17
129	0.17
130	0.15
131	0.2
132	0.2
133	0.21
134	0.21
135	0.22
136	0.21
137	0.22
138	0.22
139	0.15
140	0.21
141	0.19
142	0.19
143	0.18
144	0.19
145	0.18
146	0.19
147	0.19
148	0.12
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.15
154	0.14
155	0.16
156	0.15
157	0.14
158	0.12
159	0.13
160	0.17
161	0.16
162	0.18
163	0.18
164	0.19
165	0.19
166	0.2
167	0.21
168	0.19
169	0.18
170	0.17
171	0.24
172	0.26
173	0.28
174	0.32
175	0.37
176	0.36
177	0.39
178	0.4
179	0.32
180	0.3
181	0.27
182	0.22
183	0.16
184	0.13
185	0.09
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.15
195	0.15
196	0.17
197	0.21
198	0.22
199	0.25
200	0.28
201	0.3
202	0.31
203	0.38
204	0.46
205	0.51
206	0.57
207	0.53
208	0.53
209	0.52
210	0.51
211	0.45
212	0.36
213	0.29
214	0.24
215	0.22
216	0.19
217	0.17
218	0.12
219	0.1
220	0.1
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.08
225	0.09
226	0.1
227	0.12
228	0.12
229	0.17
230	0.17
231	0.24
232	0.27
233	0.3
234	0.29
235	0.28
236	0.29
237	0.25
238	0.24
239	0.21
240	0.18
241	0.16
242	0.2
243	0.19
244	0.18
245	0.22
246	0.21
247	0.2
248	0.24
249	0.26
250	0.25
251	0.34
252	0.37
253	0.41
254	0.42
255	0.38
256	0.36
257	0.32
258	0.3
259	0.22
260	0.2
261	0.15
262	0.14
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.17
269	0.15
270	0.17
271	0.18
272	0.21
273	0.23
274	0.27
275	0.32
276	0.31
277	0.35
278	0.32
279	0.33
280	0.3
281	0.27
282	0.23
283	0.16
284	0.14
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.12
289	0.18
290	0.19
291	0.19
292	0.23
293	0.3
294	0.36
295	0.44
296	0.45
297	0.4
298	0.48
299	0.51
300	0.47
301	0.45
302	0.4
303	0.32
304	0.27
305	0.26
306	0.2
307	0.16
308	0.17
309	0.16
310	0.15
311	0.21
312	0.21
313	0.22
314	0.2
315	0.21
316	0.21
317	0.21
318	0.22
319	0.16
320	0.18
321	0.18
322	0.18
323	0.18
324	0.16
325	0.13
326	0.12
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.18
334	0.19
335	0.17
336	0.17
337	0.18
338	0.17
339	0.17
340	0.14
341	0.13
342	0.13
343	0.11
344	0.11
345	0.13
346	0.14
347	0.17
348	0.17
349	0.19
350	0.21
351	0.2
352	0.21
353	0.19
354	0.17
355	0.16
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.17
360	0.14
361	0.13
362	0.12
363	0.11
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.15
385	0.13
386	0.16
387	0.17
388	0.22
389	0.25
390	0.33
391	0.38
392	0.4
393	0.45
394	0.46
395	0.49
396	0.47
397	0.49
398	0.49
399	0.54
400	0.56
401	0.6
402	0.66
403	0.68
404	0.73
405	0.77
406	0.79
407	0.79
408	0.83
409	0.85
410	0.87
411	0.91
412	0.93
413	0.92
414	0.92
415	0.91
416	0.9
417	0.88
418	0.8
419	0.69
420	0.61
421	0.54
422	0.48
423	0.39
424	0.34
425	0.31
426	0.35
427	0.39
428	0.38
429	0.42
430	0.45
431	0.52
432	0.56
433	0.55
434	0.57
435	0.59
436	0.58
437	0.57
438	0.54
439	0.48
440	0.42
441	0.36
442	0.28
443	0.26
444	0.26
445	0.21
446	0.18
447	0.2
448	0.2
449	0.22
450	0.22
451	0.19
452	0.18
453	0.17
454	0.18
455	0.2
456	0.18
457	0.22
458	0.23
459	0.24
460	0.26
461	0.26
462	0.31
463	0.31
464	0.31
465	0.26
466	0.3
467	0.29
468	0.31
469	0.35
470	0.35
471	0.34
472	0.42
473	0.49
474	0.48
475	0.51
476	0.56
477	0.62
478	0.64
479	0.65
480	0.66
481	0.67
482	0.72
483	0.76
484	0.74
485	0.71
486	0.7
487	0.75
488	0.74
489	0.74
490	0.73
491	0.69
492	0.66
493	0.6
494	0.55
495	0.49
496	0.43
497	0.34
498	0.29
499	0.35
500	0.37
501	0.36
502	0.35
503	0.31
504	0.34
505	0.38
506	0.38
507	0.33
508	0.35
509	0.4
510	0.41
511	0.42

A0A0R0LXL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer