Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LXC4

Protein Details
Accession A0A0R0LXC4    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-36AGSSERRSSNQKQKTQHRQRFHDNDFRDHydrophilic
203-232WELVQDKKRKLKTKQKFGNKPKNNSYNKKNHydrophilic
589-627LGYRISKNKLKPKLIRAQGIIDFPKPKNKRKLHSFLGLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-224KKRKLKTKQKFGNKPK
612-619PKPKNKRK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001969  Aspartic_peptidase_AS  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR000477  RT_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0004190  F:aspartic-type endopeptidase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00141  ASP_PROTEASE  
PS50878  RT_POL  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MFSDNDSYAGSSERRSSNQKQKTQHRQRFHDNDFRDESHTQKKWAEQGKSGHSENPAIIREIYKGMERDEVLVKIFILENEKDFNKLKELEKMASVVKNCDLKIQKWFFGKGAKEELPIKFELFKDMLVDFVCDDGIDTYYKFRDESWESYLKRLKLLQEVKGLSDKDIIKHLRTSIAPIGLQTLFLTPGITLSNLNEMIKDWELVQDKKRKLKTKQKFGNKPKNNSYNKKNVTCYTCNESGHISTSCPNKSSVKKKKDGVNFAMNGSKVQNTDSDEIKVNDFEYTAIFDSGSSENIVTENFLNSMENKITAKRVKEKFEICLLNGNRMVSYEKILLKITYKTKTQYAFFRIVEHGIFDLIVGHNLSQLLRGDKCFPIECEIRTGTGKVVSWTRPFRSRKDRVEFLELIKDLEKNGIIEESSSKWLNPVRLTRKSNGKLRFTLDLRKVNDLCDLDEFQIPNMSEMIRSLHNEKFFSVLDLKDGYFQVPLKKEDRDKTAFLSPDNRILHFTRMPQGYKNSPATFQRRMTLMLSGLLGKICFVYLDDVLVFGKDKQTHDQNLEEVIKRLEKHGMIINNEKSIICQEEVTFLGYRISKNKLKPKLIRAQGIIDFPKPKNKRKLHSFLGLINFDREFVPDLADRTKPLYELLNDKNKALIWTEETEKLFEEIKALWAEKNGIGDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.38
3 0.48
4 0.55
5 0.64
6 0.7
7 0.73
8 0.8
9 0.86
10 0.89
11 0.89
12 0.89
13 0.87
14 0.9
15 0.9
16 0.88
17 0.86
18 0.78
19 0.76
20 0.72
21 0.66
22 0.61
23 0.52
24 0.5
25 0.5
26 0.5
27 0.47
28 0.45
29 0.47
30 0.51
31 0.57
32 0.56
33 0.53
34 0.57
35 0.61
36 0.64
37 0.6
38 0.55
39 0.49
40 0.46
41 0.41
42 0.39
43 0.32
44 0.28
45 0.27
46 0.24
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.25
54 0.24
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.2
61 0.17
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.21
68 0.22
69 0.24
70 0.26
71 0.26
72 0.27
73 0.31
74 0.32
75 0.36
76 0.39
77 0.37
78 0.37
79 0.37
80 0.35
81 0.35
82 0.33
83 0.28
84 0.29
85 0.31
86 0.3
87 0.35
88 0.36
89 0.34
90 0.43
91 0.45
92 0.45
93 0.45
94 0.48
95 0.42
96 0.45
97 0.46
98 0.4
99 0.43
100 0.39
101 0.38
102 0.41
103 0.4
104 0.37
105 0.35
106 0.31
107 0.27
108 0.26
109 0.27
110 0.22
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.15
116 0.15
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.18
132 0.22
133 0.26
134 0.3
135 0.37
136 0.37
137 0.44
138 0.5
139 0.44
140 0.41
141 0.41
142 0.37
143 0.39
144 0.44
145 0.42
146 0.44
147 0.44
148 0.43
149 0.45
150 0.42
151 0.33
152 0.34
153 0.3
154 0.23
155 0.3
156 0.31
157 0.27
158 0.3
159 0.3
160 0.28
161 0.27
162 0.3
163 0.26
164 0.26
165 0.24
166 0.22
167 0.24
168 0.19
169 0.19
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.1
190 0.15
191 0.19
192 0.22
193 0.29
194 0.34
195 0.39
196 0.47
197 0.55
198 0.59
199 0.65
200 0.73
201 0.76
202 0.79
203 0.84
204 0.86
205 0.89
206 0.91
207 0.93
208 0.9
209 0.88
210 0.87
211 0.87
212 0.86
213 0.83
214 0.8
215 0.79
216 0.78
217 0.75
218 0.69
219 0.64
220 0.62
221 0.57
222 0.54
223 0.5
224 0.47
225 0.42
226 0.38
227 0.35
228 0.28
229 0.28
230 0.24
231 0.18
232 0.17
233 0.22
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.26
238 0.34
239 0.44
240 0.51
241 0.54
242 0.6
243 0.65
244 0.71
245 0.73
246 0.73
247 0.68
248 0.66
249 0.58
250 0.52
251 0.49
252 0.41
253 0.33
254 0.26
255 0.21
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.17
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.15
298 0.18
299 0.21
300 0.29
301 0.34
302 0.38
303 0.43
304 0.44
305 0.42
306 0.45
307 0.43
308 0.34
309 0.37
310 0.32
311 0.3
312 0.29
313 0.26
314 0.19
315 0.19
316 0.19
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.19
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.26
331 0.29
332 0.29
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.31
337 0.31
338 0.28
339 0.26
340 0.24
341 0.18
342 0.14
343 0.08
344 0.08
345 0.05
346 0.06
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.14
361 0.16
362 0.15
363 0.15
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.19
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.15
377 0.16
378 0.21
379 0.24
380 0.27
381 0.34
382 0.37
383 0.44
384 0.51
385 0.57
386 0.61
387 0.65
388 0.67
389 0.62
390 0.66
391 0.6
392 0.51
393 0.47
394 0.38
395 0.31
396 0.26
397 0.22
398 0.15
399 0.15
400 0.13
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.14
412 0.16
413 0.19
414 0.22
415 0.29
416 0.34
417 0.43
418 0.47
419 0.5
420 0.58
421 0.61
422 0.65
423 0.64
424 0.61
425 0.56
426 0.55
427 0.57
428 0.49
429 0.5
430 0.49
431 0.49
432 0.46
433 0.49
434 0.46
435 0.4
436 0.42
437 0.35
438 0.28
439 0.24
440 0.23
441 0.18
442 0.2
443 0.19
444 0.15
445 0.18
446 0.16
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.1
454 0.12
455 0.15
456 0.18
457 0.21
458 0.22
459 0.21
460 0.22
461 0.21
462 0.22
463 0.2
464 0.17
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.13
471 0.13
472 0.15
473 0.19
474 0.21
475 0.25
476 0.25
477 0.31
478 0.37
479 0.41
480 0.47
481 0.46
482 0.44
483 0.44
484 0.47
485 0.43
486 0.38
487 0.39
488 0.33
489 0.37
490 0.36
491 0.33
492 0.3
493 0.31
494 0.34
495 0.31
496 0.32
497 0.31
498 0.34
499 0.35
500 0.35
501 0.39
502 0.38
503 0.43
504 0.46
505 0.4
506 0.4
507 0.46
508 0.49
509 0.5
510 0.48
511 0.44
512 0.39
513 0.4
514 0.38
515 0.32
516 0.26
517 0.2
518 0.18
519 0.16
520 0.14
521 0.12
522 0.11
523 0.08
524 0.08
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.08
529 0.07
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.1
536 0.08
537 0.13
538 0.16
539 0.19
540 0.25
541 0.32
542 0.37
543 0.4
544 0.41
545 0.37
546 0.4
547 0.42
548 0.36
549 0.31
550 0.29
551 0.29
552 0.27
553 0.27
554 0.27
555 0.23
556 0.24
557 0.29
558 0.31
559 0.32
560 0.4
561 0.41
562 0.37
563 0.38
564 0.34
565 0.29
566 0.27
567 0.25
568 0.18
569 0.16
570 0.15
571 0.17
572 0.18
573 0.2
574 0.17
575 0.14
576 0.17
577 0.18
578 0.2
579 0.22
580 0.28
581 0.32
582 0.4
583 0.5
584 0.56
585 0.64
586 0.7
587 0.76
588 0.79
589 0.81
590 0.79
591 0.72
592 0.68
593 0.62
594 0.6
595 0.53
596 0.48
597 0.46
598 0.41
599 0.49
600 0.5
601 0.56
602 0.6
603 0.67
604 0.72
605 0.76
606 0.84
607 0.81
608 0.82
609 0.76
610 0.72
611 0.7
612 0.63
613 0.54
614 0.47
615 0.39
616 0.31
617 0.27
618 0.22
619 0.19
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.21
624 0.24
625 0.25
626 0.25
627 0.24
628 0.25
629 0.22
630 0.22
631 0.25
632 0.25
633 0.32
634 0.39
635 0.45
636 0.45
637 0.45
638 0.46
639 0.41
640 0.39
641 0.34
642 0.29
643 0.23
644 0.27
645 0.31
646 0.34
647 0.34
648 0.33
649 0.32
650 0.3
651 0.27
652 0.22
653 0.21
654 0.16
655 0.19
656 0.21
657 0.21
658 0.21
659 0.21
660 0.24
661 0.24