Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LYA1

Protein Details
Accession A0A0R0LYA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35EISAKDIKKDIKKTRNHNSNALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015712  DNA-dir_RNA_pol_su2  
IPR007120  DNA-dir_RNAP_su2_dom  
IPR037033  DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf  
IPR007121  RNA_pol_bsu_CS  
IPR014724  RNA_pol_RPB2_OB-fold  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0032549  F:ribonucleoside binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00562  RNA_pol_Rpb2_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01166  RNA_POL_BETA  
Amino Acid Sequences NSFKGSLKRSNDLEISAKDIKKDIKKTRNHNSNALNQNINDSKHDAKNQNSKDPNIKNYQVDTKNPEQSDVTNLNSSENKSVDKTLNTTEPVKKTTSNRKNDDGIVSPGDIVRNDCLVNKKRPNGSNSSLFTKSLDQRHVHSVLRYNNLIKIKLRETRAPIIGDKFSSRHGQKGVVGRILSFTDLPFNTDGLIPDLIMNPHGFPSRMTVGKIKEMIVGLLGLKIGKRMSCMPFSSNSITYKEIYDCLDDSFKQGAFYQGEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.41
4 0.39
5 0.34
6 0.36
7 0.41
8 0.44
9 0.53
10 0.57
11 0.59
12 0.67
13 0.76
14 0.83
15 0.85
16 0.81
17 0.8
18 0.76
19 0.76
20 0.75
21 0.69
22 0.61
23 0.51
24 0.52
25 0.48
26 0.42
27 0.35
28 0.32
29 0.33
30 0.35
31 0.43
32 0.42
33 0.46
34 0.54
35 0.57
36 0.63
37 0.62
38 0.61
39 0.63
40 0.63
41 0.62
42 0.59
43 0.58
44 0.51
45 0.51
46 0.56
47 0.5
48 0.49
49 0.49
50 0.49
51 0.51
52 0.48
53 0.46
54 0.38
55 0.34
56 0.36
57 0.32
58 0.28
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.24
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.23
74 0.24
75 0.27
76 0.3
77 0.3
78 0.31
79 0.3
80 0.32
81 0.35
82 0.44
83 0.49
84 0.53
85 0.56
86 0.58
87 0.59
88 0.56
89 0.52
90 0.43
91 0.36
92 0.28
93 0.23
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.17
104 0.22
105 0.3
106 0.35
107 0.39
108 0.45
109 0.49
110 0.51
111 0.5
112 0.49
113 0.48
114 0.45
115 0.45
116 0.39
117 0.35
118 0.32
119 0.29
120 0.29
121 0.26
122 0.28
123 0.24
124 0.26
125 0.3
126 0.32
127 0.29
128 0.26
129 0.28
130 0.28
131 0.3
132 0.29
133 0.25
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.24
138 0.24
139 0.25
140 0.3
141 0.32
142 0.32
143 0.35
144 0.38
145 0.4
146 0.38
147 0.34
148 0.32
149 0.3
150 0.26
151 0.23
152 0.19
153 0.18
154 0.23
155 0.22
156 0.23
157 0.24
158 0.25
159 0.28
160 0.35
161 0.35
162 0.32
163 0.31
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.22
168 0.14
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.15
192 0.2
193 0.21
194 0.23
195 0.26
196 0.28
197 0.33
198 0.34
199 0.29
200 0.27
201 0.25
202 0.23
203 0.18
204 0.16
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.13
214 0.19
215 0.23
216 0.28
217 0.31
218 0.32
219 0.34
220 0.39
221 0.41
222 0.38
223 0.36
224 0.34
225 0.34
226 0.32
227 0.31
228 0.27
229 0.24
230 0.22
231 0.23
232 0.2
233 0.22
234 0.24
235 0.22
236 0.24
237 0.25
238 0.23
239 0.22
240 0.22
241 0.25