Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FTR1

Protein Details
Accession Q6FTR1    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
470-495TNIVFSKLKLRKRKRDKGKDIKESFAHydrophilic
869-897VNETNRYIRNKRKDGRVLRIVRKKRDENGHydrophilic
907-933KDPRIIQGYLKRKEKQRKDNLNVDKLLHydrophilic
960-979LEKSQQRRARLNLKKSEGKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-488KLKLRKRKRDKGK
878-893NKRKDGRVLRIVRKKR
971-981NLKKSEGKVGK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG cgr:CAGL0G00418g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MKGNSKGKNKDLSNEDDAYNAIFAGDFGSMEIGSYIGKDDEGATEHLPDAVDFEDEDELADEELPEEEDVVGEFGVTSHNNKDDGYISGYDGGEQDLFEVGPSANGDADVRNHFMSTIPNENSSMVGSDLSNEEYQGQNALFMGIEQNNDSMYMDNTHAFPAPDSGNAERVQQRQQQRLAELVKKEQKTILEKKLLKKYFPTFSKGKILKWNKLIYRKTMDYNWYYKILAQEDLLKPLFPLKLKLHVQPDQRKLFELPENRWNMMSKAKSKEGQRKGIVSVEIEDADLDNLREKNVQAKDNGISDELIIATTDWNEDQIINGHLNDESKSRMSFETKSYDTPSDWNWNEDDLVNGKLKQANMAELSMNDPNLLLIEDKKRITNINQENKEKQTYDIQAIMKRFNISNDDKYNILRQAHQTKIRAIISNLNIEHSKPAARLQSPFYKVTAPKSQLRHFHRPNFNSTIRAGTNIVFSKLKLRKRKRDKGKDIKESFATTPDLTVGDTAPIYLMEFSEENPLALSKFGMGNKLINYYRKISEEDTLRPKLPVGETHVLGVQDKSPFWNFGLVEPGHIVPTLYNNMLRAPVFKHEVSGTDFLLVRSTGNGISNRFYLRNINHLFTVGQTFPVDEIPGPNSRRVTSMKAIRLRMIVYRLLNKASTRSISIDPIAVHFPEAEYGQNRQKIKEFMKYQREGPDKGLWRLKEGEPLLDGENIKKLLTPEQVAEVEVMGHGIQNQDDNEVFNFDNDLVKLEESLTPWNISKNFINATQMRAMVQIHGAGDPTGCGEGFSFLKTSMKGGFLKSTTSLANLAASSPAPATKKGSSSSGYSYNVAQQQKVYEDEITRTWYTHTKSLSISNPFEEINDPDEVNETNRYIRNKRKDGRVLRIVRKKRDENGIIQRQTVIIKDPRIIQGYLKRKEKQRKDNLNVDKLLEETDTDIHNIEDIEMQKKILETELANLEKSQQRRARLNLKKSEGKVGKGAKNTSRRCATCGQVGHIRTNKSCPMYYSDNGPGGRNAPGDTPSAATPDVTATPPANI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.5
3 0.41
4 0.39
5 0.31
6 0.25
7 0.17
8 0.1
9 0.07
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.1
28 0.12
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.09
64 0.11
65 0.14
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.23
73 0.2
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.13
96 0.15
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.21
103 0.23
104 0.28
105 0.27
106 0.28
107 0.29
108 0.3
109 0.29
110 0.24
111 0.2
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.18
153 0.21
154 0.21
155 0.26
156 0.28
157 0.3
158 0.36
159 0.4
160 0.46
161 0.5
162 0.56
163 0.55
164 0.51
165 0.55
166 0.53
167 0.52
168 0.48
169 0.49
170 0.52
171 0.48
172 0.48
173 0.44
174 0.44
175 0.47
176 0.52
177 0.52
178 0.53
179 0.58
180 0.65
181 0.72
182 0.7
183 0.64
184 0.63
185 0.61
186 0.6
187 0.58
188 0.56
189 0.49
190 0.5
191 0.58
192 0.53
193 0.51
194 0.52
195 0.56
196 0.58
197 0.62
198 0.65
199 0.62
200 0.69
201 0.68
202 0.65
203 0.65
204 0.61
205 0.58
206 0.54
207 0.53
208 0.49
209 0.49
210 0.45
211 0.39
212 0.36
213 0.33
214 0.33
215 0.29
216 0.24
217 0.21
218 0.26
219 0.24
220 0.29
221 0.27
222 0.23
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.18
227 0.23
228 0.21
229 0.3
230 0.34
231 0.4
232 0.43
233 0.46
234 0.55
235 0.59
236 0.65
237 0.62
238 0.6
239 0.57
240 0.51
241 0.49
242 0.47
243 0.44
244 0.4
245 0.41
246 0.45
247 0.43
248 0.42
249 0.39
250 0.33
251 0.35
252 0.36
253 0.35
254 0.36
255 0.41
256 0.45
257 0.52
258 0.6
259 0.61
260 0.64
261 0.61
262 0.58
263 0.55
264 0.54
265 0.46
266 0.37
267 0.3
268 0.23
269 0.19
270 0.16
271 0.14
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.2
282 0.24
283 0.27
284 0.24
285 0.27
286 0.28
287 0.29
288 0.3
289 0.22
290 0.18
291 0.15
292 0.14
293 0.11
294 0.08
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.2
321 0.22
322 0.27
323 0.27
324 0.29
325 0.3
326 0.3
327 0.27
328 0.27
329 0.26
330 0.29
331 0.28
332 0.27
333 0.24
334 0.23
335 0.23
336 0.21
337 0.19
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.16
344 0.15
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.16
351 0.14
352 0.16
353 0.14
354 0.13
355 0.1
356 0.09
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.05
361 0.08
362 0.11
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.2
368 0.22
369 0.3
370 0.36
371 0.43
372 0.49
373 0.53
374 0.56
375 0.57
376 0.57
377 0.47
378 0.39
379 0.36
380 0.31
381 0.29
382 0.3
383 0.29
384 0.3
385 0.3
386 0.3
387 0.25
388 0.24
389 0.22
390 0.18
391 0.22
392 0.23
393 0.28
394 0.29
395 0.29
396 0.29
397 0.29
398 0.31
399 0.29
400 0.26
401 0.22
402 0.26
403 0.32
404 0.37
405 0.41
406 0.39
407 0.37
408 0.42
409 0.41
410 0.36
411 0.3
412 0.31
413 0.27
414 0.3
415 0.28
416 0.24
417 0.22
418 0.21
419 0.21
420 0.15
421 0.14
422 0.1
423 0.14
424 0.16
425 0.17
426 0.19
427 0.23
428 0.3
429 0.32
430 0.32
431 0.3
432 0.3
433 0.3
434 0.33
435 0.36
436 0.32
437 0.35
438 0.39
439 0.44
440 0.48
441 0.55
442 0.6
443 0.59
444 0.65
445 0.68
446 0.65
447 0.66
448 0.64
449 0.57
450 0.49
451 0.43
452 0.37
453 0.28
454 0.27
455 0.22
456 0.16
457 0.18
458 0.16
459 0.18
460 0.14
461 0.14
462 0.21
463 0.27
464 0.33
465 0.4
466 0.49
467 0.58
468 0.69
469 0.8
470 0.82
471 0.87
472 0.91
473 0.92
474 0.92
475 0.92
476 0.84
477 0.77
478 0.67
479 0.59
480 0.48
481 0.39
482 0.3
483 0.2
484 0.17
485 0.14
486 0.12
487 0.09
488 0.09
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.03
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.04
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.18
520 0.2
521 0.21
522 0.21
523 0.23
524 0.2
525 0.23
526 0.24
527 0.27
528 0.3
529 0.31
530 0.3
531 0.28
532 0.26
533 0.24
534 0.22
535 0.19
536 0.2
537 0.2
538 0.2
539 0.2
540 0.21
541 0.19
542 0.19
543 0.17
544 0.11
545 0.09
546 0.09
547 0.11
548 0.1
549 0.11
550 0.11
551 0.14
552 0.13
553 0.12
554 0.18
555 0.16
556 0.15
557 0.15
558 0.15
559 0.12
560 0.11
561 0.11
562 0.05
563 0.07
564 0.09
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.12
574 0.16
575 0.15
576 0.16
577 0.15
578 0.17
579 0.19
580 0.19
581 0.16
582 0.14
583 0.14
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.08
588 0.07
589 0.08
590 0.07
591 0.09
592 0.11
593 0.12
594 0.13
595 0.15
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.19
600 0.18
601 0.26
602 0.27
603 0.27
604 0.25
605 0.25
606 0.24
607 0.19
608 0.21
609 0.12
610 0.11
611 0.1
612 0.1
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.06
617 0.07
618 0.09
619 0.14
620 0.16
621 0.18
622 0.19
623 0.19
624 0.23
625 0.24
626 0.27
627 0.28
628 0.34
629 0.39
630 0.44
631 0.44
632 0.43
633 0.41
634 0.37
635 0.33
636 0.28
637 0.24
638 0.21
639 0.24
640 0.24
641 0.24
642 0.25
643 0.23
644 0.23
645 0.21
646 0.2
647 0.17
648 0.19
649 0.19
650 0.2
651 0.2
652 0.19
653 0.16
654 0.17
655 0.16
656 0.13
657 0.12
658 0.1
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.09
664 0.13
665 0.19
666 0.24
667 0.25
668 0.26
669 0.3
670 0.34
671 0.37
672 0.42
673 0.44
674 0.48
675 0.57
676 0.58
677 0.57
678 0.6
679 0.6
680 0.53
681 0.49
682 0.48
683 0.43
684 0.46
685 0.48
686 0.39
687 0.38
688 0.4
689 0.36
690 0.36
691 0.32
692 0.28
693 0.23
694 0.25
695 0.22
696 0.21
697 0.21
698 0.14
699 0.16
700 0.15
701 0.14
702 0.14
703 0.14
704 0.16
705 0.19
706 0.2
707 0.17
708 0.21
709 0.21
710 0.2
711 0.19
712 0.14
713 0.11
714 0.09
715 0.08
716 0.05
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.07
722 0.07
723 0.09
724 0.09
725 0.1
726 0.1
727 0.12
728 0.12
729 0.1
730 0.11
731 0.1
732 0.11
733 0.1
734 0.11
735 0.09
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.11
740 0.11
741 0.14
742 0.13
743 0.14
744 0.15
745 0.19
746 0.18
747 0.2
748 0.2
749 0.21
750 0.22
751 0.21
752 0.27
753 0.24
754 0.27
755 0.26
756 0.25
757 0.22
758 0.21
759 0.2
760 0.15
761 0.15
762 0.12
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.08
767 0.08
768 0.07
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.08
775 0.08
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.12
780 0.12
781 0.13
782 0.13
783 0.16
784 0.17
785 0.18
786 0.22
787 0.21
788 0.23
789 0.22
790 0.22
791 0.19
792 0.19
793 0.17
794 0.13
795 0.14
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.09
800 0.09
801 0.08
802 0.11
803 0.12
804 0.13
805 0.18
806 0.2
807 0.23
808 0.24
809 0.27
810 0.26
811 0.28
812 0.31
813 0.32
814 0.31
815 0.29
816 0.28
817 0.3
818 0.34
819 0.33
820 0.29
821 0.25
822 0.25
823 0.26
824 0.27
825 0.24
826 0.2
827 0.2
828 0.22
829 0.22
830 0.25
831 0.23
832 0.22
833 0.22
834 0.25
835 0.27
836 0.3
837 0.3
838 0.28
839 0.29
840 0.35
841 0.39
842 0.4
843 0.38
844 0.35
845 0.34
846 0.32
847 0.31
848 0.26
849 0.22
850 0.18
851 0.18
852 0.16
853 0.15
854 0.16
855 0.16
856 0.16
857 0.17
858 0.15
859 0.18
860 0.23
861 0.29
862 0.36
863 0.45
864 0.54
865 0.62
866 0.68
867 0.74
868 0.8
869 0.82
870 0.84
871 0.84
872 0.84
873 0.84
874 0.86
875 0.85
876 0.84
877 0.85
878 0.82
879 0.78
880 0.78
881 0.73
882 0.72
883 0.74
884 0.74
885 0.67
886 0.6
887 0.54
888 0.45
889 0.41
890 0.33
891 0.28
892 0.24
893 0.25
894 0.27
895 0.3
896 0.33
897 0.36
898 0.35
899 0.35
900 0.39
901 0.47
902 0.53
903 0.57
904 0.59
905 0.65
906 0.76
907 0.8
908 0.82
909 0.83
910 0.86
911 0.86
912 0.9
913 0.9
914 0.87
915 0.78
916 0.69
917 0.58
918 0.47
919 0.4
920 0.3
921 0.21
922 0.14
923 0.14
924 0.14
925 0.13
926 0.13
927 0.12
928 0.12
929 0.12
930 0.11
931 0.13
932 0.14
933 0.16
934 0.16
935 0.16
936 0.17
937 0.17
938 0.17
939 0.15
940 0.16
941 0.13
942 0.18
943 0.25
944 0.26
945 0.26
946 0.25
947 0.29
948 0.31
949 0.33
950 0.38
951 0.36
952 0.42
953 0.5
954 0.58
955 0.64
956 0.68
957 0.76
958 0.76
959 0.79
960 0.8
961 0.75
962 0.77
963 0.71
964 0.65
965 0.63
966 0.62
967 0.6
968 0.59
969 0.63
970 0.61
971 0.67
972 0.68
973 0.69
974 0.7
975 0.65
976 0.63
977 0.62
978 0.58
979 0.56
980 0.54
981 0.51
982 0.49
983 0.5
984 0.54
985 0.53
986 0.54
987 0.48
988 0.51
989 0.51
990 0.49
991 0.48
992 0.42
993 0.43
994 0.45
995 0.44
996 0.45
997 0.44
998 0.45
999 0.45
1000 0.44
1001 0.39
1002 0.33
1003 0.35
1004 0.29
1005 0.25
1006 0.21
1007 0.22
1008 0.22
1009 0.22
1010 0.22
1011 0.19
1012 0.21
1013 0.19
1014 0.17
1015 0.16
1016 0.16
1017 0.17
1018 0.16
1019 0.18