Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LZC7

Protein Details
Accession A0A0R0LZC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-439LNRNEKFQKEKKKKLVFPMRNQSKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-427KKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, E.R. 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027075  CPSF2  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16661  Lactamase_B_6  
Amino Acid Sequences MGIKSFYSLQAISPIHTDVYCQLLEIDSYRILINCGSNEKLQVEYFEKLEEILPKIDCIIISHAELKYFGGILHVFKKQKTKIIMALPIHAFSKIIFQEILQNIKIRNESSDIMTENDISVYNTSDLDKNILEELYDFITIVKFSQPLEIGTLRLVAKNAGHSLGGSLWQIQKDSDIITVAIDINHKKENHIDGCNLTNIKKSFLFITNCDFVGECPFPRKEKEKIFFNILKKDKDRKIIFVCDFMRSLEICCVINEFFATRKFDKECAYLSFNSKSVHEKFKGFLEWTGDIALQKFTNEKTNPFKFDKIHFVESFNSIPKDTNFFVIPNDGNNSVFLDRLIYENNERKNLLIFLNEDLEFSQIQNNSTVASVLKEERRPVNVPIFMTVDQIENPQPELLSKPGHRSFIEEAPFLNRNEKFQKEKKKKLVFPMRNQSKPRDLYGEFFDRTIVQTEEEFQPVVEQDEPEIKPEEKKEIVKMTDQTFIPEISTRFVNFKGLIDGNAMKDILESVDIEKMILFGKDRVFVNFFRDRCLLTKCIKETVVLDTQKVNLSSDTLISRVDLEENFLEDVGLQQFGNLHISPFIGSIKENLLIYDRPLTKDFCFGLLNFKKLQTALLDKNFKVRKLNENSIIIDESVTIEKKDNKYYISADYSNKYVFIRNIIYQNIVFIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.14
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.17
21 0.17
22 0.21
23 0.23
24 0.23
25 0.26
26 0.26
27 0.27
28 0.24
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.21
35 0.19
36 0.21
37 0.21
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.18
45 0.16
46 0.18
47 0.16
48 0.17
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.22
53 0.2
54 0.17
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.12
59 0.14
60 0.19
61 0.25
62 0.27
63 0.3
64 0.4
65 0.41
66 0.48
67 0.5
68 0.51
69 0.51
70 0.56
71 0.6
72 0.53
73 0.55
74 0.48
75 0.44
76 0.39
77 0.32
78 0.25
79 0.16
80 0.22
81 0.16
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.24
86 0.27
87 0.31
88 0.25
89 0.27
90 0.26
91 0.3
92 0.32
93 0.25
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.26
99 0.24
100 0.23
101 0.23
102 0.21
103 0.17
104 0.16
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.19
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.09
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.18
173 0.18
174 0.19
175 0.23
176 0.3
177 0.32
178 0.34
179 0.33
180 0.3
181 0.32
182 0.35
183 0.31
184 0.25
185 0.25
186 0.23
187 0.24
188 0.22
189 0.21
190 0.21
191 0.26
192 0.28
193 0.24
194 0.29
195 0.28
196 0.27
197 0.27
198 0.23
199 0.17
200 0.2
201 0.19
202 0.15
203 0.18
204 0.2
205 0.22
206 0.27
207 0.32
208 0.34
209 0.43
210 0.49
211 0.51
212 0.53
213 0.59
214 0.61
215 0.6
216 0.62
217 0.57
218 0.56
219 0.54
220 0.59
221 0.56
222 0.6
223 0.57
224 0.55
225 0.55
226 0.58
227 0.53
228 0.51
229 0.47
230 0.39
231 0.37
232 0.31
233 0.27
234 0.18
235 0.18
236 0.13
237 0.13
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.16
248 0.16
249 0.19
250 0.21
251 0.24
252 0.26
253 0.26
254 0.26
255 0.25
256 0.28
257 0.26
258 0.28
259 0.27
260 0.26
261 0.25
262 0.24
263 0.25
264 0.25
265 0.31
266 0.29
267 0.29
268 0.28
269 0.3
270 0.31
271 0.26
272 0.24
273 0.21
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.15
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.16
286 0.17
287 0.21
288 0.28
289 0.32
290 0.37
291 0.39
292 0.41
293 0.37
294 0.39
295 0.43
296 0.39
297 0.4
298 0.35
299 0.34
300 0.32
301 0.32
302 0.3
303 0.23
304 0.19
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.16
309 0.14
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.14
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.12
331 0.17
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.16
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.1
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.1
361 0.13
362 0.15
363 0.18
364 0.19
365 0.23
366 0.25
367 0.27
368 0.3
369 0.28
370 0.27
371 0.26
372 0.27
373 0.23
374 0.22
375 0.19
376 0.14
377 0.11
378 0.13
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.1
386 0.1
387 0.13
388 0.14
389 0.21
390 0.24
391 0.27
392 0.27
393 0.3
394 0.31
395 0.33
396 0.34
397 0.26
398 0.24
399 0.25
400 0.28
401 0.24
402 0.27
403 0.21
404 0.24
405 0.29
406 0.33
407 0.37
408 0.43
409 0.54
410 0.58
411 0.68
412 0.74
413 0.78
414 0.79
415 0.82
416 0.85
417 0.83
418 0.82
419 0.83
420 0.82
421 0.8
422 0.78
423 0.72
424 0.69
425 0.62
426 0.55
427 0.5
428 0.42
429 0.37
430 0.39
431 0.39
432 0.31
433 0.29
434 0.27
435 0.21
436 0.21
437 0.2
438 0.15
439 0.11
440 0.1
441 0.14
442 0.15
443 0.15
444 0.14
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.1
450 0.08
451 0.09
452 0.15
453 0.15
454 0.17
455 0.19
456 0.18
457 0.21
458 0.23
459 0.28
460 0.26
461 0.28
462 0.31
463 0.35
464 0.36
465 0.37
466 0.4
467 0.36
468 0.37
469 0.35
470 0.32
471 0.27
472 0.25
473 0.21
474 0.2
475 0.18
476 0.14
477 0.16
478 0.14
479 0.15
480 0.16
481 0.18
482 0.16
483 0.16
484 0.19
485 0.18
486 0.18
487 0.19
488 0.2
489 0.17
490 0.18
491 0.17
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.12
509 0.16
510 0.17
511 0.2
512 0.22
513 0.22
514 0.28
515 0.32
516 0.31
517 0.31
518 0.32
519 0.31
520 0.31
521 0.35
522 0.33
523 0.32
524 0.39
525 0.37
526 0.4
527 0.38
528 0.37
529 0.33
530 0.34
531 0.37
532 0.31
533 0.3
534 0.26
535 0.28
536 0.29
537 0.28
538 0.24
539 0.16
540 0.17
541 0.16
542 0.17
543 0.16
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.13
548 0.11
549 0.13
550 0.11
551 0.13
552 0.13
553 0.15
554 0.15
555 0.13
556 0.12
557 0.1
558 0.12
559 0.09
560 0.1
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.14
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.12
573 0.1
574 0.1
575 0.11
576 0.13
577 0.15
578 0.15
579 0.14
580 0.17
581 0.17
582 0.18
583 0.25
584 0.25
585 0.26
586 0.29
587 0.32
588 0.29
589 0.35
590 0.33
591 0.28
592 0.28
593 0.24
594 0.33
595 0.35
596 0.37
597 0.33
598 0.33
599 0.32
600 0.31
601 0.32
602 0.27
603 0.3
604 0.35
605 0.42
606 0.47
607 0.45
608 0.55
609 0.57
610 0.55
611 0.55
612 0.52
613 0.54
614 0.57
615 0.66
616 0.64
617 0.64
618 0.63
619 0.58
620 0.54
621 0.43
622 0.34
623 0.25
624 0.19
625 0.18
626 0.17
627 0.15
628 0.19
629 0.26
630 0.31
631 0.38
632 0.4
633 0.38
634 0.42
635 0.44
636 0.46
637 0.45
638 0.46
639 0.43
640 0.42
641 0.43
642 0.39
643 0.38
644 0.32
645 0.3
646 0.27
647 0.29
648 0.31
649 0.32
650 0.37
651 0.37
652 0.39
653 0.34