Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FV00

Protein Details
Accession Q6FV00    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MEQTNKEHRKSKEKNTAKKKLHTQGHNAKAFAHydrophilic
178-201KSQSTLRASKKRLKHRFWTEVYQGHydrophilic
810-831IVNARLRRHRWHKKILKTHDPLBasic
1061-1087KDLPFKSQIHQMKPQKKKTYMAKRAVIHydrophilic
1102-1161VLTVSKAKEEKRQSKKSDQRKERLKKLAKLEEEKSQKDKEKKKEFFSKYGKKRSNANDDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-20HRKSKEKNTAKKK
1106-1170SKAKEEKRQSKKSDQRKERLKKLAKLEEEKSQKDKEKKKEFFSKYGKKRSNANDDGDFKAKKSRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012948  AARP2CN  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR037875  Bms1_N  
IPR007034  BMS1_TSR1_C  
IPR030387  G_Bms1/Tsr1_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:2000232  P:regulation of rRNA processing  
KEGG cgr:CAGL0E05874g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF08142  AARP2CN  
PF04950  RIBIOP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51714  G_BMS1  
CDD cd01882  BMS1  
Amino Acid Sequences MEQTNKEHRKSKEKNTAKKKLHTQGHNAKAFAVSAPGKMARTMQRSSDVNERKLHVPMVDRTPDDDPPPVIVSVVGPPGTGKTTLIKSLVRRMTKTTLSEINGPVTVVSGKHRRLTFLECPADDLNSMIDVAKISDLVLLMIDGNFGFEMETMEFLNLAQHHGMPRVLGVATHLDLFKSQSTLRASKKRLKHRFWTEVYQGAKLFYLSGVLNGRYPDREILNLSRFISVMKFRPLKWRNEHPYMLADRITDLTHPDLIERKGKKVDRKVALYGYLHGTQLSSVPGQRVHVAGVGDLTVAQVEKLPDPCPTPYYQQKLDEYEREKMKEEAAATGQITSTTTRRRKRLDDKDKLIYAPMSDVGGLLMDKDAVYIDVGKKKDSLSFVPGQEKGEGEKMVTSLQQTDKTIAEKFEGVGLQLFSNSTELHGVEEEEEEENDDDNMDEEMSDNENGVQDQGRTSLRAPRLYGKSIQQKDDEIDNLPSDDELEENEDAEPKLVEIDFDEKSHTKEKLALDSDSEFELSDDDSWERKAAGKLNGTIQKKRVWDIGKLIYMDNITPDECIKRWKNEDTSDDEEEDIEADEDEEFFKKAEAKEQTSAEADLEKFVPYFEKIEKLVTKWSSFDAISDRFVGAPQLDGKKNSTDSANGDDDEEEVYGDFEDLEADGDSDKEKSDENNEEEVESDGSFTNFDAEEKKELTIEEERQLNAAKKEKLRTQFEMEEGENFKEDDPDNEFDTWYELQKAKIAKQLEINEKELQDMTPEQRLRIEGYKAGSYVRVVFEDVPMEFIESFNPRFPVIMGGLLPTEQKFGIVNARLRRHRWHKKILKTHDPLVMSLGWRRFQTLPVYTTSDSRTRIRMLKYTPEHTYCNAYFYGPLCSPNTPFCGVQIVANSDTTGNFRISATGVVEEIDVDVEIVKKLKLVGFPYKIFKNTAFIKDMFSSAMEVARFEGAQIKTVSGIRGEIKRALSKPDGHFRAAFEDKILMSDIVILRSWYPVKVKRFYNPVTSLLLSNKTEWKGVRLTGQIRAAEGVATPVNPDSNYKKIERVERHFNGLKVPKTIQKDLPFKSQIHQMKPQKKKTYMAKRAVILGGDEKKARSFVQKVLTVSKAKEEKRQSKKSDQRKERLKKLAKLEEEKSQKDKEKKKEFFSKYGKKRSNANDDGDFKAKKSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.89
3 0.92
4 0.9
5 0.9
6 0.89
7 0.88
8 0.88
9 0.85
10 0.85
11 0.85
12 0.86
13 0.81
14 0.71
15 0.62
16 0.53
17 0.45
18 0.35
19 0.3
20 0.22
21 0.17
22 0.21
23 0.23
24 0.22
25 0.23
26 0.28
27 0.3
28 0.35
29 0.37
30 0.37
31 0.42
32 0.43
33 0.47
34 0.51
35 0.51
36 0.51
37 0.53
38 0.53
39 0.49
40 0.49
41 0.48
42 0.4
43 0.39
44 0.39
45 0.42
46 0.44
47 0.41
48 0.42
49 0.43
50 0.43
51 0.39
52 0.36
53 0.29
54 0.27
55 0.28
56 0.24
57 0.21
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.18
62 0.15
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.16
70 0.19
71 0.23
72 0.26
73 0.29
74 0.31
75 0.4
76 0.47
77 0.48
78 0.47
79 0.5
80 0.53
81 0.55
82 0.54
83 0.5
84 0.48
85 0.46
86 0.49
87 0.45
88 0.4
89 0.34
90 0.31
91 0.25
92 0.2
93 0.18
94 0.13
95 0.18
96 0.23
97 0.27
98 0.33
99 0.34
100 0.37
101 0.4
102 0.47
103 0.48
104 0.49
105 0.52
106 0.45
107 0.49
108 0.46
109 0.43
110 0.35
111 0.28
112 0.19
113 0.13
114 0.13
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.17
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.18
168 0.24
169 0.31
170 0.39
171 0.47
172 0.53
173 0.59
174 0.68
175 0.73
176 0.78
177 0.78
178 0.8
179 0.81
180 0.84
181 0.81
182 0.8
183 0.73
184 0.7
185 0.64
186 0.56
187 0.46
188 0.37
189 0.31
190 0.23
191 0.19
192 0.12
193 0.12
194 0.09
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.18
205 0.19
206 0.22
207 0.27
208 0.3
209 0.32
210 0.31
211 0.29
212 0.27
213 0.26
214 0.25
215 0.23
216 0.23
217 0.28
218 0.31
219 0.31
220 0.43
221 0.48
222 0.54
223 0.58
224 0.65
225 0.65
226 0.69
227 0.69
228 0.6
229 0.61
230 0.55
231 0.49
232 0.39
233 0.3
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.18
244 0.2
245 0.28
246 0.28
247 0.31
248 0.38
249 0.44
250 0.51
251 0.57
252 0.64
253 0.63
254 0.66
255 0.66
256 0.6
257 0.6
258 0.51
259 0.43
260 0.38
261 0.31
262 0.26
263 0.22
264 0.19
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.14
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.26
298 0.32
299 0.38
300 0.41
301 0.44
302 0.46
303 0.49
304 0.51
305 0.51
306 0.47
307 0.48
308 0.48
309 0.45
310 0.43
311 0.38
312 0.34
313 0.3
314 0.26
315 0.22
316 0.18
317 0.18
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.13
325 0.21
326 0.29
327 0.36
328 0.44
329 0.5
330 0.59
331 0.68
332 0.76
333 0.77
334 0.79
335 0.79
336 0.8
337 0.75
338 0.66
339 0.57
340 0.46
341 0.35
342 0.25
343 0.19
344 0.11
345 0.09
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.07
359 0.1
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.22
366 0.23
367 0.22
368 0.23
369 0.28
370 0.3
371 0.34
372 0.34
373 0.32
374 0.29
375 0.27
376 0.23
377 0.21
378 0.18
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.12
386 0.14
387 0.17
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.18
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.17
446 0.21
447 0.23
448 0.24
449 0.3
450 0.33
451 0.35
452 0.36
453 0.37
454 0.43
455 0.44
456 0.45
457 0.39
458 0.36
459 0.35
460 0.34
461 0.28
462 0.2
463 0.18
464 0.15
465 0.14
466 0.13
467 0.11
468 0.09
469 0.08
470 0.06
471 0.05
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.05
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.12
489 0.12
490 0.15
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.2
495 0.22
496 0.26
497 0.28
498 0.25
499 0.23
500 0.23
501 0.24
502 0.19
503 0.17
504 0.1
505 0.08
506 0.08
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.1
516 0.12
517 0.16
518 0.2
519 0.22
520 0.23
521 0.29
522 0.36
523 0.36
524 0.37
525 0.34
526 0.34
527 0.33
528 0.33
529 0.33
530 0.28
531 0.28
532 0.31
533 0.32
534 0.3
535 0.29
536 0.28
537 0.23
538 0.2
539 0.18
540 0.13
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.15
548 0.17
549 0.21
550 0.25
551 0.3
552 0.34
553 0.37
554 0.4
555 0.4
556 0.43
557 0.4
558 0.36
559 0.31
560 0.26
561 0.21
562 0.18
563 0.11
564 0.06
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.08
575 0.08
576 0.15
577 0.18
578 0.21
579 0.24
580 0.25
581 0.26
582 0.24
583 0.24
584 0.17
585 0.15
586 0.12
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.07
594 0.09
595 0.09
596 0.11
597 0.11
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.21
602 0.21
603 0.21
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.17
608 0.17
609 0.15
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.13
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.07
618 0.07
619 0.09
620 0.13
621 0.14
622 0.15
623 0.17
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.17
628 0.15
629 0.15
630 0.19
631 0.19
632 0.17
633 0.16
634 0.15
635 0.14
636 0.13
637 0.11
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.04
648 0.03
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.07
658 0.12
659 0.16
660 0.19
661 0.22
662 0.22
663 0.21
664 0.21
665 0.21
666 0.17
667 0.12
668 0.09
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.08
677 0.09
678 0.12
679 0.12
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.15
684 0.17
685 0.18
686 0.19
687 0.2
688 0.2
689 0.2
690 0.23
691 0.22
692 0.22
693 0.26
694 0.27
695 0.29
696 0.34
697 0.4
698 0.46
699 0.48
700 0.49
701 0.49
702 0.46
703 0.44
704 0.42
705 0.36
706 0.32
707 0.27
708 0.24
709 0.18
710 0.16
711 0.14
712 0.13
713 0.13
714 0.12
715 0.14
716 0.16
717 0.18
718 0.18
719 0.18
720 0.15
721 0.18
722 0.17
723 0.13
724 0.15
725 0.13
726 0.13
727 0.17
728 0.19
729 0.18
730 0.23
731 0.23
732 0.22
733 0.28
734 0.34
735 0.4
736 0.41
737 0.42
738 0.39
739 0.38
740 0.36
741 0.31
742 0.24
743 0.17
744 0.16
745 0.15
746 0.19
747 0.19
748 0.19
749 0.2
750 0.21
751 0.22
752 0.23
753 0.23
754 0.19
755 0.21
756 0.21
757 0.2
758 0.2
759 0.17
760 0.14
761 0.15
762 0.13
763 0.11
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.11
769 0.1
770 0.09
771 0.1
772 0.08
773 0.08
774 0.1
775 0.11
776 0.12
777 0.13
778 0.14
779 0.13
780 0.13
781 0.13
782 0.14
783 0.12
784 0.12
785 0.1
786 0.1
787 0.1
788 0.1
789 0.1
790 0.08
791 0.08
792 0.07
793 0.07
794 0.07
795 0.08
796 0.14
797 0.18
798 0.23
799 0.29
800 0.37
801 0.41
802 0.44
803 0.53
804 0.58
805 0.64
806 0.67
807 0.71
808 0.73
809 0.79
810 0.86
811 0.86
812 0.86
813 0.8
814 0.76
815 0.7
816 0.62
817 0.51
818 0.43
819 0.35
820 0.26
821 0.25
822 0.23
823 0.2
824 0.19
825 0.22
826 0.21
827 0.22
828 0.28
829 0.28
830 0.26
831 0.27
832 0.32
833 0.29
834 0.31
835 0.31
836 0.3
837 0.29
838 0.29
839 0.29
840 0.29
841 0.34
842 0.36
843 0.39
844 0.39
845 0.45
846 0.48
847 0.5
848 0.51
849 0.49
850 0.48
851 0.43
852 0.46
853 0.36
854 0.33
855 0.29
856 0.23
857 0.21
858 0.2
859 0.23
860 0.17
861 0.19
862 0.19
863 0.2
864 0.22
865 0.22
866 0.25
867 0.23
868 0.22
869 0.2
870 0.22
871 0.21
872 0.2
873 0.2
874 0.2
875 0.18
876 0.18
877 0.18
878 0.14
879 0.14
880 0.15
881 0.14
882 0.11
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.12
887 0.12
888 0.12
889 0.1
890 0.1
891 0.09
892 0.09
893 0.08
894 0.07
895 0.06
896 0.05
897 0.04
898 0.05
899 0.05
900 0.06
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.09
905 0.11
906 0.15
907 0.19
908 0.28
909 0.32
910 0.36
911 0.41
912 0.43
913 0.43
914 0.42
915 0.37
916 0.35
917 0.36
918 0.37
919 0.36
920 0.33
921 0.35
922 0.33
923 0.33
924 0.27
925 0.21
926 0.18
927 0.14
928 0.16
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.12
933 0.11
934 0.1
935 0.16
936 0.14
937 0.18
938 0.18
939 0.18
940 0.19
941 0.2
942 0.21
943 0.14
944 0.16
945 0.17
946 0.2
947 0.23
948 0.25
949 0.27
950 0.33
951 0.34
952 0.37
953 0.38
954 0.42
955 0.46
956 0.52
957 0.52
958 0.48
959 0.48
960 0.44
961 0.46
962 0.42
963 0.35
964 0.26
965 0.25
966 0.22
967 0.22
968 0.22
969 0.14
970 0.1
971 0.15
972 0.15
973 0.14
974 0.14
975 0.13
976 0.12
977 0.16
978 0.17
979 0.16
980 0.22
981 0.28
982 0.35
983 0.42
984 0.46
985 0.5
986 0.57
987 0.59
988 0.6
989 0.57
990 0.53
991 0.5
992 0.47
993 0.42
994 0.37
995 0.38
996 0.3
997 0.29
998 0.32
999 0.29
1000 0.32
1001 0.3
1002 0.31
1003 0.29
1004 0.3
1005 0.33
1006 0.34
1007 0.35
1008 0.38
1009 0.42
1010 0.39
1011 0.35
1012 0.34
1013 0.29
1014 0.22
1015 0.19
1016 0.15
1017 0.1
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.12
1022 0.12
1023 0.16
1024 0.19
1025 0.25
1026 0.3
1027 0.31
1028 0.36
1029 0.41
1030 0.51
1031 0.56
1032 0.58
1033 0.62
1034 0.61
1035 0.68
1036 0.66
1037 0.61
1038 0.6
1039 0.58
1040 0.54
1041 0.48
1042 0.49
1043 0.47
1044 0.49
1045 0.55
1046 0.53
1047 0.55
1048 0.61
1049 0.6
1050 0.66
1051 0.64
1052 0.58
1053 0.56
1054 0.57
1055 0.56
1056 0.54
1057 0.6
1058 0.61
1059 0.66
1060 0.75
1061 0.82
1062 0.82
1063 0.8
1064 0.82
1065 0.83
1066 0.84
1067 0.84
1068 0.83
1069 0.79
1070 0.72
1071 0.71
1072 0.63
1073 0.53
1074 0.44
1075 0.41
1076 0.36
1077 0.33
1078 0.32
1079 0.29
1080 0.29
1081 0.3
1082 0.3
1083 0.31
1084 0.3
1085 0.34
1086 0.41
1087 0.45
1088 0.46
1089 0.5
1090 0.53
1091 0.49
1092 0.46
1093 0.48
1094 0.48
1095 0.46
1096 0.52
1097 0.58
1098 0.62
1099 0.69
1100 0.78
1101 0.77
1102 0.8
1103 0.87
1104 0.89
1105 0.89
1106 0.9
1107 0.89
1108 0.9
1109 0.93
1110 0.91
1111 0.92
1112 0.91
1113 0.88
1114 0.87
1115 0.87
1116 0.85
1117 0.82
1118 0.76
1119 0.75
1120 0.74
1121 0.71
1122 0.67
1123 0.65
1124 0.65
1125 0.68
1126 0.74
1127 0.75
1128 0.77
1129 0.8
1130 0.83
1131 0.86
1132 0.84
1133 0.85
1134 0.86
1135 0.86
1136 0.85
1137 0.88
1138 0.87
1139 0.8
1140 0.82
1141 0.82
1142 0.82
1143 0.78
1144 0.74
1145 0.71
1146 0.67
1147 0.69
1148 0.66
1149 0.57
1150 0.47