Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LR31

Protein Details
Accession A0A0R0LR31    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-141KRMTMKKTTMKKKTMKKAEKEEQKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-136KKTTMKKKTMKKAEK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 10.833, cyto_nucl 10.333, mito 6.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001233  RtcB  
IPR036025  RtcB-like_sf  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008452  F:RNA ligase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01139  RtcB  
Amino Acid Sequences PADSRTISQKAKSKGLVQLGSLGAGNHFLEFQRVETVYNDYVDKDSKDKLKFKNDQLCIMIHTGSRGLGHAVCEQAMKENSVSNTQKEENSVSENITFRIADKFDKSINLEEKTHMKRMTMKKTTMKKKTMKKAEKEEQKEEQKEEQKEEQLKQKEQLKQKEQLKQKEEQQKQKEEQEYICLQDNESQARYLNQMGCAANFAFANRALIQLTVEKILKKYGINSEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.58
3 0.53
4 0.45
5 0.44
6 0.37
7 0.34
8 0.29
9 0.22
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.16
23 0.21
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.17
32 0.21
33 0.27
34 0.34
35 0.4
36 0.46
37 0.54
38 0.6
39 0.67
40 0.72
41 0.67
42 0.65
43 0.59
44 0.52
45 0.44
46 0.38
47 0.29
48 0.19
49 0.17
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.22
69 0.23
70 0.2
71 0.23
72 0.24
73 0.24
74 0.23
75 0.24
76 0.18
77 0.2
78 0.19
79 0.16
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.22
99 0.28
100 0.29
101 0.32
102 0.28
103 0.24
104 0.3
105 0.38
106 0.46
107 0.45
108 0.47
109 0.51
110 0.6
111 0.69
112 0.69
113 0.7
114 0.68
115 0.72
116 0.77
117 0.8
118 0.79
119 0.77
120 0.79
121 0.8
122 0.81
123 0.79
124 0.74
125 0.72
126 0.72
127 0.67
128 0.6
129 0.58
130 0.56
131 0.52
132 0.51
133 0.46
134 0.44
135 0.46
136 0.46
137 0.47
138 0.46
139 0.46
140 0.47
141 0.5
142 0.51
143 0.55
144 0.62
145 0.59
146 0.62
147 0.67
148 0.69
149 0.71
150 0.73
151 0.68
152 0.64
153 0.67
154 0.69
155 0.7
156 0.72
157 0.72
158 0.71
159 0.72
160 0.74
161 0.7
162 0.63
163 0.55
164 0.51
165 0.45
166 0.39
167 0.39
168 0.31
169 0.27
170 0.29
171 0.3
172 0.28
173 0.27
174 0.25
175 0.2
176 0.21
177 0.23
178 0.22
179 0.22
180 0.19
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.22
185 0.2
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.17
200 0.19
201 0.2
202 0.2
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.28