FuNGI

A0A0R0M171

Protein Details

Accession

A0A0R0M171

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-136	HVNKLNKNQNQKDNNQREDN	Hydrophilic
262-281	IERNNKKKSKYYSNKFLQFR	Hydrophilic
530-571	LSKEEKIKEKNKDKKTKIKNKKTKDKKKTKINRKQIKQIKEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
534-566	EKIKEKNKDKKTKIKNKKTKDKKKTKINRKQIK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04565 RNA_pol_Rpb2_3

Amino Acid Sequences

MYLNHLNSYDGFLTNLPQLIGDLPTLNISGHSLSIDSIRFHKPVVIINDKVVKISHSDMLQSLESYKAKCTIVIRINGQRREIALGLWPVMVGSKLCHDQVTAEIERVVLDSVPLDHVNKLNKNQNQKDNNQREDNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHNNHKEDRKDIKPSQNEDRDEIDAEIHATASLFATPRHSAFHEPTGGYFVINGQEKLVRFLLVPKRHYPFLIERNNKKKSKYYSNKFLQFRSVRNEIGYNYYLYLTYNKNIMMKFFIKKKEYNIDVIIILKALKNVTDEQLIELLGDEGRYLLKEDIVSKRSALNTLENTFISIASQLNITASGDSLSSNSLSRDSDSSKPSEEFKVAQAVLNNLFVHLNTDLEKFNILIICIRKLLYSTTYDDMDTTANQEILGIGQILSMIVFDRLKESLDTVYRHFTHYDHKKEDSTEQAEKEELEKDELEKDKSEKDELEKDESEKDESDDDSSELFDQKAYSDDLSKEEKIKEKNKDKKTKIKNKKTKDKKKTKINRKQIKQIKEEDVLKRLKFSVCQKVDHFLNTGNCTFLNSTDILQSTGLSLSIDRLNNYRFISYFESVNRGSFFSTLRTSSIRLLKPESYGFLCPVHTPDGAQCGLIVHLTSGAIVTKNCNLSLPTTNVFLNHFISMNNVGSLKNVESDKNIESDKNVESLKNIESDKNVESDKNIESLKNVESLNNVIPLILNGKVLGTVDTSYIDYLRNLRLRNKQTFEIYQADEALYVFTEMGRLMRPVIFSDQNKVSPGVISPDVVSSDVVSSDVISDSVVWIGVKEQTQCIINNKEDFTREYTRDKNISDTTHESTASHKTINTKKDNPITTNIT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.15
4	0.13
5	0.13
6	0.13
7	0.14
8	0.13
9	0.11
10	0.1
11	0.11
12	0.12
13	0.11
14	0.1
15	0.11
16	0.11
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.1
21	0.13
22	0.15
23	0.15
24	0.19
25	0.23
26	0.23
27	0.23
28	0.26
29	0.25
30	0.3
31	0.37
32	0.4
33	0.37
34	0.42
35	0.49
36	0.45
37	0.44
38	0.37
39	0.29
40	0.26
41	0.27
42	0.26
43	0.2
44	0.21
45	0.22
46	0.25
47	0.24
48	0.21
49	0.19
50	0.21
51	0.23
52	0.22
53	0.23
54	0.24
55	0.24
56	0.26
57	0.28
58	0.31
59	0.36
60	0.41
61	0.46
62	0.51
63	0.6
64	0.6
65	0.6
66	0.53
67	0.47
68	0.45
69	0.39
70	0.3
71	0.26
72	0.24
73	0.22
74	0.2
75	0.18
76	0.14
77	0.14
78	0.13
79	0.08
80	0.08
81	0.11
82	0.14
83	0.15
84	0.16
85	0.15
86	0.16
87	0.19
88	0.25
89	0.22
90	0.2
91	0.2
92	0.19
93	0.19
94	0.18
95	0.15
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.1
101	0.12
102	0.12
103	0.14
104	0.18
105	0.26
106	0.31
107	0.37
108	0.43
109	0.48
110	0.58
111	0.64
112	0.7
113	0.71
114	0.74
115	0.78
116	0.79
117	0.81
118	0.77
119	0.72
120	0.7
121	0.72
122	0.69
123	0.68
124	0.66
125	0.62
126	0.61
127	0.67
128	0.62
129	0.6
130	0.63
131	0.58
132	0.57
133	0.63
134	0.62
135	0.6
136	0.65
137	0.64
138	0.61
139	0.65
140	0.64
141	0.61
142	0.65
143	0.64
144	0.61
145	0.65
146	0.64
147	0.61
148	0.65
149	0.64
150	0.61
151	0.65
152	0.64
153	0.61
154	0.65
155	0.64
156	0.61
157	0.65
158	0.64
159	0.61
160	0.65
161	0.64
162	0.61
163	0.65
164	0.64
165	0.61
166	0.65
167	0.64
168	0.61
169	0.65
170	0.64
171	0.61
172	0.65
173	0.64
174	0.61
175	0.65
176	0.65
177	0.64
178	0.65
179	0.64
180	0.61
181	0.62
182	0.6
183	0.6
184	0.61
185	0.59
186	0.62
187	0.63
188	0.67
189	0.68
190	0.7
191	0.71
192	0.71
193	0.67
194	0.61
195	0.56
196	0.48
197	0.42
198	0.36
199	0.26
200	0.18
201	0.16
202	0.13
203	0.09
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.07
209	0.06
210	0.07
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.15
215	0.17
216	0.2
217	0.23
218	0.28
219	0.28
220	0.27
221	0.26
222	0.27
223	0.25
224	0.2
225	0.17
226	0.13
227	0.14
228	0.15
229	0.15
230	0.12
231	0.15
232	0.16
233	0.19
234	0.19
235	0.14
236	0.13
237	0.21
238	0.29
239	0.33
240	0.37
241	0.4
242	0.43
243	0.44
244	0.44
245	0.41
246	0.4
247	0.43
248	0.5
249	0.53
250	0.58
251	0.67
252	0.76
253	0.74
254	0.69
255	0.68
256	0.66
257	0.68
258	0.7
259	0.7
260	0.71
261	0.77
262	0.82
263	0.77
264	0.7
265	0.68
266	0.62
267	0.57
268	0.53
269	0.47
270	0.39
271	0.37
272	0.38
273	0.29
274	0.3
275	0.26
276	0.2
277	0.17
278	0.16
279	0.15
280	0.14
281	0.16
282	0.13
283	0.13
284	0.14
285	0.14
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.19
290	0.21
291	0.25
292	0.3
293	0.36
294	0.37
295	0.39
296	0.44
297	0.47
298	0.46
299	0.45
300	0.4
301	0.34
302	0.3
303	0.29
304	0.23
305	0.15
306	0.13
307	0.09
308	0.09
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.1
313	0.11
314	0.13
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.12
319	0.1
320	0.09
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.11
333	0.17
334	0.19
335	0.19
336	0.18
337	0.21
338	0.21
339	0.22
340	0.2
341	0.19
342	0.21
343	0.22
344	0.23
345	0.2
346	0.2
347	0.18
348	0.16
349	0.11
350	0.08
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.11
372	0.14
373	0.17
374	0.19
375	0.2
376	0.21
377	0.22
378	0.23
379	0.23
380	0.21
381	0.17
382	0.16
383	0.2
384	0.18
385	0.18
386	0.16
387	0.16
388	0.15
389	0.16
390	0.15
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.1
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.14
421	0.14
422	0.12
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.09
449	0.12
450	0.14
451	0.14
452	0.18
453	0.18
454	0.19
455	0.19
456	0.18
457	0.24
458	0.32
459	0.37
460	0.36
461	0.38
462	0.38
463	0.39
464	0.41
465	0.37
466	0.34
467	0.3
468	0.27
469	0.26
470	0.25
471	0.24
472	0.22
473	0.19
474	0.14
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.16
479	0.17
480	0.17
481	0.16
482	0.17
483	0.18
484	0.2
485	0.21
486	0.17
487	0.19
488	0.25
489	0.26
490	0.3
491	0.28
492	0.28
493	0.28
494	0.28
495	0.26
496	0.19
497	0.18
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.07
509	0.06
510	0.06
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.1
515	0.1
516	0.13
517	0.17
518	0.18
519	0.2
520	0.22
521	0.27
522	0.32
523	0.39
524	0.46
525	0.53
526	0.62
527	0.69
528	0.77
529	0.79
530	0.82
531	0.86
532	0.87
533	0.88
534	0.89
535	0.89
536	0.89
537	0.93
538	0.94
539	0.94
540	0.94
541	0.94
542	0.92
543	0.93
544	0.93
545	0.94
546	0.93
547	0.93
548	0.92
549	0.88
550	0.89
551	0.86
552	0.84
553	0.79
554	0.75
555	0.69
556	0.65
557	0.64
558	0.56
559	0.55
560	0.51
561	0.45
562	0.39
563	0.36
564	0.31
565	0.3
566	0.34
567	0.37
568	0.35
569	0.39
570	0.39
571	0.42
572	0.42
573	0.39
574	0.33
575	0.27
576	0.27
577	0.27
578	0.25
579	0.21
580	0.19
581	0.19
582	0.18
583	0.14
584	0.13
585	0.1
586	0.11
587	0.12
588	0.12
589	0.12
590	0.11
591	0.11
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.11
599	0.12
600	0.12
601	0.15
602	0.16
603	0.2
604	0.21
605	0.2
606	0.16
607	0.19
608	0.24
609	0.23
610	0.24
611	0.22
612	0.25
613	0.24
614	0.25
615	0.22
616	0.17
617	0.16
618	0.15
619	0.15
620	0.14
621	0.16
622	0.15
623	0.17
624	0.18
625	0.19
626	0.23
627	0.3
628	0.3
629	0.3
630	0.33
631	0.33
632	0.34
633	0.34
634	0.31
635	0.26
636	0.24
637	0.23
638	0.2
639	0.19
640	0.17
641	0.18
642	0.18
643	0.16
644	0.15
645	0.14
646	0.18
647	0.17
648	0.16
649	0.14
650	0.11
651	0.11
652	0.11
653	0.1
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.06
661	0.07
662	0.09
663	0.13
664	0.14
665	0.14
666	0.15
667	0.15
668	0.18
669	0.22
670	0.25
671	0.22
672	0.23
673	0.23
674	0.23
675	0.24
676	0.22
677	0.19
678	0.16
679	0.15
680	0.13
681	0.15
682	0.17
683	0.16
684	0.15
685	0.13
686	0.12
687	0.13
688	0.15
689	0.13
690	0.14
691	0.15
692	0.15
693	0.17
694	0.2
695	0.2
696	0.22
697	0.22
698	0.19
699	0.19
700	0.22
701	0.21
702	0.21
703	0.21
704	0.18
705	0.18
706	0.2
707	0.2
708	0.21
709	0.22
710	0.2
711	0.21
712	0.24
713	0.24
714	0.25
715	0.25
716	0.21
717	0.2
718	0.22
719	0.21
720	0.22
721	0.21
722	0.19
723	0.19
724	0.21
725	0.21
726	0.21
727	0.2
728	0.17
729	0.18
730	0.21
731	0.21
732	0.2
733	0.18
734	0.14
735	0.14
736	0.14
737	0.14
738	0.12
739	0.1
740	0.08
741	0.08
742	0.09
743	0.09
744	0.09
745	0.08
746	0.08
747	0.08
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.11
753	0.11
754	0.14
755	0.21
756	0.24
757	0.28
758	0.35
759	0.44
760	0.52
761	0.6
762	0.62
763	0.6
764	0.62
765	0.62
766	0.59
767	0.55
768	0.48
769	0.4
770	0.36
771	0.3
772	0.24
773	0.2
774	0.16
775	0.1
776	0.08
777	0.07
778	0.05
779	0.06
780	0.06
781	0.07
782	0.08
783	0.09
784	0.1
785	0.12
786	0.13
787	0.16
788	0.21
789	0.28
790	0.28
791	0.34
792	0.37
793	0.38
794	0.39
795	0.37
796	0.32
797	0.25
798	0.25
799	0.23
800	0.2
801	0.18
802	0.17
803	0.17
804	0.17
805	0.17
806	0.16
807	0.11
808	0.11
809	0.1
810	0.1
811	0.08
812	0.07
813	0.08
814	0.08
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.08
821	0.06
822	0.06
823	0.08
824	0.11
825	0.14
826	0.16
827	0.17
828	0.19
829	0.22
830	0.25
831	0.31
832	0.34
833	0.36
834	0.39
835	0.4
836	0.41
837	0.41
838	0.41
839	0.41
840	0.42
841	0.41
842	0.44
843	0.47
844	0.52
845	0.54
846	0.53
847	0.53
848	0.51
849	0.5
850	0.49
851	0.5
852	0.47
853	0.44
854	0.43
855	0.36
856	0.34
857	0.38
858	0.34
859	0.3
860	0.27
861	0.34
862	0.41
863	0.51
864	0.56
865	0.56
866	0.63
867	0.7
868	0.75
869	0.7

A0A0R0M171

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer